【技术实现步骤摘要】
一种猪δ冠状病毒感染性克隆质粒的构建方法
本专利技术属于动物传染病防治和生物领域。具体涉及一种猪δ冠状病毒感染性克隆质粒的构建方法。
技术介绍
猪δ冠状病毒(porcinedeltacoronavirus,PDCoV)属于冠状病毒科,δ冠状病毒属成员,有囊膜、基因组为单股正链RNA,是目前唯一一种成功分离的δ冠状病毒。Woo等人对中国香港地区2010-2011年采集自不同动物的样品进行冠状病毒检测时首次发现猪δ冠状病毒(WooP.C.Y,DiscoveryofsevennovelMammalianandaviancoronavirusesinthegenusdeltacoronavirussupportsbatcoronavirusesasthegenesourceofalphacoronavirusandbetacoronavirusandaviancoronavirusesasthegenesourceofgammacoronavirusanddeltacoronavirus.J.Virol.2012,86:3995-4 ...
【技术保护点】
1.一种猪δ冠状病毒感染性克隆质粒的构建方法,其特征在于包括以下步骤:/n(1)提取猪δ冠状病毒RNA并反转录成cDNA;/n(2)以上述cDNA为模板,设计引物分别进行PCR扩增,获得猪δ冠状病毒的5’端基因序列、3’端基因序列以及5个基因片段,其中,所述5个基因片段之间含有20bp的同源序列,此外,将15121位点C沉默突变成A,消除了一个ClaI内切酶序列,作为遗传标记;/n(3)以pBAC-AJ1102质粒为模板,设计引物分别进行PCR扩增,获得CMV启动子和HDV-BGH基因序列;/n(4)利用BAC系统,通过ApaLI和HindIII限制性内切酶和多步融合PCR ...
【技术特征摘要】
1.一种猪δ冠状病毒感染性克隆质粒的构建方法,其特征在于包括以下步骤:
(1)提取猪δ冠状病毒RNA并反转录成cDNA;
(2)以上述cDNA为模板,设计引物分别进行PCR扩增,获得猪δ冠状病毒的5’端基因序列、3’端基因序列以及5个基因片段,其中,所述5个基因片段之间含有20bp的同源序列,此外,将15121位点C沉默突变成A,消除了一个ClaI内切酶序列,作为遗传标记;
(3)以pBAC-AJ1102质粒为模板,设计引物分别进行PCR扩增,获得CMV启动子和HDV-BGH基因序列;
(4)利用BAC系统,通过ApaLI和HindIII限制性内切酶和多步融合PCR方法将CMV启动子、5’端基因序列、3’端基因序列、27个腺嘌呤脱氧核苷酸(A)的poly(A)结构、丙肝病毒(HDV)核酶自切割位点以及牛生长激素终止序列(BGH)克隆至低拷贝载体pBeloBAC11中获得中间载体pBAC-M-PDCoV;
(5)将5个基因片段按比例同源重组一步克隆至中间载体pBAC-M-PDCoV中获得重组质粒pBAC-CHN-HN-2014;
(6)将重组产物转化至DH10B化学感受态细胞中,利用PCR筛选阳性克隆,将测序正确的阳性克隆扩大培养后提取质粒。
2.如权利要求1所述猪δ冠状病毒感染性克隆质粒的构建方法,其特征在于:所述猪δ冠状病毒为CHN-HN-2014株。
3.如权利要求1所述猪δ冠状病毒感染性克隆质粒的构建方法,其特征在于,所述5’端基因序列、3’端基因序列以及5个基因片段的序列分别为:
5’端基因序列:SEQIDNO:1;
3’端基因序列:SEQIDNO:2;
基因片段A:SEQIDNO:3;
基因片段B:SEQIDNO:4;<...
【专利技术属性】
技术研发人员:方六荣,方谱县,肖少波,夏思进,任杰,张健淞,张慧畅,
申请(专利权)人:华中农业大学,
类型:发明
国别省市:湖北;42
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