【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】从流动池中的生物样品获取信息
[0001]相关申请
[0002]本申请要求2019年5月31日提交的名称为“从流动池中的生物样品获取信息”的美国临时专利申请号62/855,622的优先权,其全部内容通过引用并于本文。
技术介绍
[0003]计算机系统已经使用多种不同的机制来存储数据,包括磁存储、光存储和固态存储。这样的数据存储形式可以读写速度、数据保留的持续时间、功率使用或数据密度的形式存在缺点。
[0004]正如可以读取天然存在的DNA,也可以读取机器写入(machine
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written)的DNA。预先存在的DNA读取技术可以包括基于阵列的循环测序测定(例如合成测序(SBS)),其中DNA特征(例如模板核酸)的密集阵列通过酶促操作的迭代循环进行测序。在每个循环之后,可以捕获图像,然后将其与其他图像进行分析,以确定机器写入的DNA特征的序列。在另一种生物化学测定中,可以将具有可识别标记(例如荧光标记)的未知分析物暴露于在阵列内具有预先确定地址的已知探针的阵列。观察探针和未知分析物之间发生的化学反应可有助于识 ...
【技术保护点】
【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】1.一种方法,其包括:使生物样品与设备接触,所述设备包括:(a)流动池主体,其限定一个或多个流动通道和多个孔,所述一个或多个流动通道中的每个流动通道接收流体流,所述多个孔中的每个孔与所述一个或多个流动通道的对应流动通道流体地偶联,所述多个孔中的每个孔限定对应深度,(b)多个电极,所述多个电极中的每个电极被置于所述多个孔的对应孔中,所述多个电极实现所述多个孔的所述对应孔中的多核苷酸的读取或写入中的一者或两者,和(c)成像组件,以捕获指示写在所述多个孔中的至少一个孔中的多核苷酸中的核苷酸的图像;通过所述多核苷酸的读取或写入中的一者或两者来获取信息;其中所述接触包括使所述生物样品与所述设备的所述流动池主体接触;和其中所述信息是包含在所述生物样品中的DNA或RNA序列。2.根据权利要求1所述的方法,其进一步包括存储所述信息。3.根据权利要求1所述的方法,其中所述信息选自来自所述生物样品的DNA序列和来自所述生物样品的RNA序列中的一者或两者,并且其中所述多核苷酸对应于来自所述生物样品的所述DNA序列和来自所述生物样品的所述RNA序列中的所述一者或两者。4.根据权利要求3所述的方法,其中RNA和DNA中的所述一者或两者是无细胞DNA或无细胞RNA。5.根据前述权利要求中任一项所述的方法,其中所述生物样品选自全血、血清、血浆或其组合。6.根据前述权利要求中任一项所述的方法,其中所述生物样品选自病毒和细菌中的一者或两者。7.根据前述权利要求中任一项所述的方法,其进一步包括掺入位置索引特征,其中所述位置索引特征识别所述设备上的所述信息的位置。8.根据权利要求7所述的方法,其中所述位置索引特征包含粘附至所述设备的预先确定的序列,其中所述预先确定的序列被掺入至所述多核苷酸中。9.根据前述权利要求中任一项所述的方法,其进一步包括掺入来源索引特征,其中所述来源索引特征识别所述设备上的所述信息的来源。10.根据权利要求9所述的方法,其中所述来源索引特征包含被掺入至所述多核苷酸中的预先确定的序列。11.一种方法,其包括:使生物样品与设备接触,所述设备包括:(a)流动池主体,其限定一个或多个流动通道和多个孔,所述一个或多个流动通道中的每个流动通道接收流体流,所述多个孔中的每个孔与所述一个或多个流动通道的对应流动通道流体地偶联,所述多个孔中的每个孔限定对应深度,(b)多个电极,所述多个电极中的每个电极被置于所述多个孔的对应孔中,所述多个电极实现所述多个孔的所述对应孔中的多核苷酸的读取和写入中的一者或两者,(c)成像组件,以捕获指示写在所述多个孔中的至少一个孔中的多核苷酸中的核苷酸的图像,和
(d)被置于所述多个孔中或其附近的一种或多种结合组分,所述一种或多种结合组分与所述生物样品中的生物细胞选择性结合;其中所述接触包括使所述生物样品与所述设备的所述流动池主体接触以将所述结合组分与所述生物细胞结合,其中所述结合将所述生物细胞粘附至所述设备。12.根据权利要求11所述的方法,其中所述结合组分结合至预先选择的细胞类型,其中所述结合组分对所述预先选择的细胞类型具有选择性。13.根据权利要求12所述的方法,其中所述结合组分结合至所述生物细胞的表面分子,其中所述表面分子选自蛋白质、肽、受体、糖分子或其组合。14.根据权利要求12或13所述的方法,其中所述结合组分选自核苷酸、蛋白质、肽、小分子或其组合。15.根据权利要求11至14中任一项所述的方法,其中从所述生物细胞获取的所述信息选自来自所述生物细胞的DNA序列,来自所述生物细胞的RNA序列,所述生物细胞的类型或其组合。16.根据权利要求11至15中任一项所述的方法,其中所述生物样品选自全血、血清、血浆或其组合。17.根据权利要求11至16中任一项所述的方法,其进一步包括使所述设备与足以将未粘附的细胞从设备粘附的细胞分离的第一溶液接触。18.根据权利要求17所述的方法,其进一步包括使所述设备与足以裂解流动池粘附的细胞的第二溶液接触,其中所述裂解暴露DNA和RNA中的一者或两者用于写入包含在所述设备粘附的细胞内的所述多核苷酸。19.根据权利要求11至14中任一项所述的方法,其进一步包括结合所述设备中的多个生物细胞和流入用于所述多个生物细胞的存储的流体。20.根据权利要求19所述的方法,其...
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