用于缓存生物图像数据的系统和方法技术方案

技术编号:28053227 阅读:54 留言:0更新日期:2021-04-14 13:18
本公开涉及数字病理系统和服务器系统,其各自可以包括预填充有生物图像数据的缓存,所述生物图像数据包括已预处理为目标文件格式的生物图像数据。可以在所述数字病理系统和/或所述服务器系统上用生物图像数据填充缓存,以检索生物图像数据,从而有助于在浏览器中或在所述数字病理系统上实时或近实时地可视化生物图像数据。当接收扫描的图像数据时,可以自动对服务器上的生物图像数据进行预处理。自动对服务器上的生物图像数据进行预处理。自动对服务器上的生物图像数据进行预处理。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】用于缓存生物图像数据的系统和方法
[0001]相关专利申请的交叉引用
[0002]本申请要求2018年9月7日提交的美国专利临时申请号62/728,573的权益,出于全部目的其通过引用以其全文并入本文。

技术介绍

[0003]数字病理学是指在数字环境中管理和解读病理学信息。扫描装置用于使可能被染色的生物样品的载玻片成像,从而生成数字载玻片,例如整个载玻片图像。数字病理软件能够将数字载玻片存储在计算机存储装置中,在计算机监视器上查看并分析病理信息。

技术实现思路

[0004]本公开尤其针对包括具有改进的响应时间的客户端用户界面(GUI)的客户端

服务器系统。通常,用于图像数据的可视化和分析的界面在(i)客户端系统(例如,在客户端系统上本地运行的查看器应用程序)上运行,或(ii)在远程服务器上运行,其中客户端系统通过浏览器(诸如Web浏览器)访问远程服务器上查看器应用程序的实例。图像数据,例如用苏木精和伊红染色或经染色以识别一种或多种生物标志物的存在的生物样品的扫描图像,可以从远程服务器(例如,从通信地联接至远程服务器的存本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】1.一种在服务器上预处理生物图像数据以促进将所述生物图像数据传输至数字病理分析系统的方法,所述方法包括:(a)接收具有第一图像文件格式的生物图像数据,所述生物图像数据派生自其上放置有一个或多个生物样品的显微镜载玻片的扫描,所述生物样品经苏木精和伊红染色或经染色以鉴定一种或多种生物标志物的存在;(b)预处理接收的生物图像数据以生成一个或多个预处理图像文件,生成的一个或多个预处理图像文件中的每一个均派生自所述接收的第一图像文件格式的生物图像数据,并且其中所述生成的一个或多个预处理图像文件中的每一个以第二文件格式提供;以及(c)将以所述第二文件格式提供的所述生成的一个或多个预处理图像文件存储在与所述服务器通信地耦合的一个或多个存储器中。2.根据权利要求1所述的方法,其中所述第一图像文件格式和所述第二图像文件格式相同。3.根据权利要求2所述的方法,其中所述预处理步骤生成多个预处理图像文件。4.根据权利要求3所述的方法,其中所述多个预处理图像文件是多个图像图块文件,并且其中所述多个图像图块文件各自包括文件名,所述文件名包括与所述接收的具有第一图像文件格式的生物图像数据内的单个图块文件的位置相对应的坐标。5.根据权利要求2所述的方法,其中所述预处理步骤生成多组预处理图像文件,其中所述多组预处理图像文件中的每组预处理图像文件包括与单一放大级相对应的多个图像图块文件。6.根据权利要求2所述的方法,其中所述第一文件格式和所述第二文件格式是压缩图像文件格式。7.根据权利要求6所述的方法,其中所述压缩图像文件格式选自由JPEG文件交换格式、便携式网络图形文件格式及它们的派生格式组成的组。8.根据权利要求1所述的方法,其中所述第一图像文件格式和所述第二图像文件格式不同。9.根据权利要求8所述的方法,其中所述第一图像文件格式是RAW图像文件格式或未压缩图像文件格式中的一种;并且其中所述第二图像文件格式是压缩图像文件格式。10.根据权利要求9所述的方法,其中所述预处理步骤包括以所述RAW图像文件格式或所述未压缩图像文件格式转换所述接收的生物图像数据,以及以所述压缩图像文件格式生成所述一个或多个预处理图像文件。11.根据权利要求10所述的方法,其中所述预处理步骤以所述压缩图像文件格式生成单一预处理图像文件。12.根据权利要求10所述的方法,其中所述预处理步骤以所述压缩图像文件格式生成多个预处理图像文件。13.根据权利要求12所述的方法,其中所述预处理步骤生成多组预处理图像文件,其中所述多组预处理图像文件中的每组预处理图像文件包括与单一放大级相对应的所述压缩图像文件格式的多个图像图块文件。14.根据权利要求12所述的方法,其中所述多个预处理图像文件是多个图像图块文件,并且其中所述多个图像图块文件各自包括文件名,所述文件名包括与所述接收的具有第一
图像文件格式的生物图像数据内的单个图块文件的位置相对应的坐标。15.根据权利要求12所述的方法,其中所述接收的具有第一图像文件格式的生物图像数据的文件大小大于所述压缩图像文件格式的所述生成的多个预处理图像文件中的所有预处理图像文件的合计文件大小。16.根据权利要求9所述的方法,其中所述压缩图像文件格式是目标文件格式。17.根据权利要求16所述的方法,其中所述目标文件格式是浏览器兼容文件格式。18.根据权利要求1所述的方法,其进一步包括从所述数字病理分析系统接收对存储的一个或多个预处理图像文件的请求。19.根据权利要求1所述的方法,其进一步包括将所述存储的一个或多个预处理图像文件自动传输至在所述数字病理分析系统上运行的缓存代理。20.根据权利要求1所述的方法,其中所述一个或多个存储器包括易失性存储器和非易失性存储器两者。21.根据权利要求1所述的方法,其中所述一个或多个存储器是非易失性存储器。22.根据权利要求21所述的方法,其中所述存储的一个或多个预处理图像文件在所述一个或多个非易失性存储器中维护预定的时间量。23.根据权利要求22所述的方法,其中所述预定的时间量的范围为5天至15天。24.一种在数字病理分析系统内的客户端缓存中管理生物图像数据的方法,所述方法包括:(a)使用远程服务器执行用户验证,其中所述验证包括确认缓存代理正在所述数字病理分析系统上运行;(b)从所述远程服务器接收多个新生物图像图块,所述新生物图像图块派生自其上放置有一个或多个生物样品的显微镜载玻片的扫描,所述生物样品经苏木精和伊红染色或经染色以鉴定一种或多种生物标志物的存在;(c)基于预定标准从与所述数字病理系统通信地耦合的客户端缓存中移除预先存在的生物图像图块的至少第一部分;以及(d)将接收的新生物图像图块存储在所述客户端缓存中。25.根据权利要求24所述的方法,其中所述预定标准包括存储分配限制、缓存图像过期、载玻片查看期过期和病例再分配。26.根据权利要求24所述的方法,其中移除的所述预先存在的生物图像图块的第一部分的合计大小与接收的所述新生物图像图块的总大小大致相同。27.根据权利要求24所述的方法,其中移除的所述预先存在的生物图像图块的第一部分的合计大小大于接收的所述新生物图像图块的大小。28.根据权利要求24所述的方法,其中接收的多个新生物图像图块是具有压缩文件格式的预处理生物图像图块。29.根据权利要求28所述的方法,其中所述压缩文件格式是JPEG。30.根据权利要求24所述的方法,其进一步包括通过基于预定标准移除存储的新生物图像图块的第一部分来维护所述客户端缓存。31.根据权利要求30所述的方法,其中所述预定标准包括存储分配限制、缓存图像过期、载玻片查看期过期和病例再分配。
32.根据权利要求30所述的方法,其进一步包括移除由病理科医生检查的所述存储的新生物图像图块的第二部分。33.一种在数字病理分析系统内的客户端缓存中管理生物图像数据的方法,所述方法包括:(a)维护与所述数字病理分析系统通信地耦合的客户端缓存,所述客户端缓存包括一个或多个患者病例的生物图像数据,其中通过基于预定标准移除预先存在的生物图像数据的第一部分来维护所述客户端缓存;(b)使用远程服务器执行验证;(c)从所述远程服务器接收第一请求,以将新生物图像数据添加至客户端缓存;以及(d)将所述新生...

【专利技术属性】
技术研发人员:P
申请(专利权)人:文塔纳医疗系统公司
类型:发明
国别省市:

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