【技术实现步骤摘要】
一种微生物鉴定方法、装置、设备及存储介质
本申请涉及微生物鉴定
,具体而言,涉及一种微生物鉴定方法、装置、设备及存储介质。
技术介绍
随着科学技术的发展,微生物鉴定成为微生物分类学的一个重要组成部分,通过微生物鉴定,可以使人们了解微生物界的全貌,有利于进一步开发和利用丰富的微生物资源。现有技术中,通过参考微生物分类系统中包括的各分类标准,比如微生物单个细胞的形态、对周围环境资源的利用度、血清学反应等分类标准,人工鉴定微生物的类型,但目前的微生物分类系统还不完整、存在较大的误差,所以该微生物分类系统中分类标准的准确率低,使得依据该分类标准进行的微生物鉴定的准确率也较低。
技术实现思路
有鉴于此,本申请实施例提供了一种微生物鉴定方法、装置、设备及存储介质,以提高微生物鉴定的准确率。主要包括以下几个方面:第一方面,本申请实施例提供了一种微生物鉴定方法,该方法包括:在获取待鉴定微生物的质谱图后,根据所述质谱图中各谱峰的强度值,确定各所述谱峰在所述质谱图中的区域,其中,各所述强 ...
【技术保护点】
1.一种微生物鉴定方法,其特征在于,包括:/n在获取待鉴定微生物的质谱图后,根据所述质谱图中各谱峰的强度值,确定各所述谱峰在所述质谱图中的区域,其中,各所述强度值用于表示所述待鉴定微生物包含的各蛋白质的含量;/n针对数据库中每一个已知微生物的基准质谱图,计算该基准质谱图中各基准谱峰的质量值与所述质谱图中每一个谱峰的质量值的差值,其中,各所述谱峰的质量值用于表示所述待鉴定微生物包含的各所述蛋白质的质核比;/n针对每一个所述谱峰,在该谱峰对应的差值中确定在第一预设范围内的差值的数量,以将所述数量作为该谱峰的匹配数;/n根据各所述区域包括的所述谱峰的总匹配数和各所述区域包括的所述 ...
【技术特征摘要】
1.一种微生物鉴定方法,其特征在于,包括:
在获取待鉴定微生物的质谱图后,根据所述质谱图中各谱峰的强度值,确定各所述谱峰在所述质谱图中的区域,其中,各所述强度值用于表示所述待鉴定微生物包含的各蛋白质的含量;
针对数据库中每一个已知微生物的基准质谱图,计算该基准质谱图中各基准谱峰的质量值与所述质谱图中每一个谱峰的质量值的差值,其中,各所述谱峰的质量值用于表示所述待鉴定微生物包含的各所述蛋白质的质核比;
针对每一个所述谱峰,在该谱峰对应的差值中确定在第一预设范围内的差值的数量,以将所述数量作为该谱峰的匹配数;
根据各所述区域包括的所述谱峰的总匹配数和各所述区域包括的所述谱峰的总数量,计算该基准质谱图的得分;
计算各所述得分中的最高得分在所有所述得分中出现的第一概率;
判断所述第一概率是否小于预设阈值;
若小于,将所述最高得分对应的基准质谱图显示在显示屏上。
2.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述根据所述质谱图中各谱峰的强度值,确定各所述谱峰在所述质谱图中的区域,包括:
计算各所述强度值的和值,以得到所述谱峰的总强度值;
针对每一个所述谱峰,计算该谱峰的强度值与大于该强度值的所有所述强度值的和值,以得到该谱峰的目标强度值;
计算所述质谱图中各所述目标强度值与所述总强度值的比值;
根据各所述区域规定的比值范围,通过确定各所述比值所属的所述比值范围,得到各所述比值对应的谱峰在所述质谱图中的区域。
3.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述根据各所述区域包括的所述谱峰的总匹配数和各所述区域包括的所述谱峰的总数量,计算该基准质谱图的得分,包括:
第一区域的所述总匹配数为m1,第一区域的所述总数量为t1;
第二区域的所述总匹配数为m2,第二区域的所述总数量为t2;
以此类推,第N区域的所述总匹配数为mn,第N区域的所述总数量为tn;
计算N个所述区域的所述总匹配数的和值M及N个所述区域的所述总数量的和值T;
通过以下公式,得到该基准质谱图的匹配概率:
其中,i=1,2,……,n;
通过对所述匹配概率取负对数,得到该基准质谱图的所述得分。
4.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述计算各所述得分中的最高得分在所有所述得分中出现的第一概率,包括:
计算各所述得分在所有所述得分中出现的第二概率;
通过拟合各所述得分及其第二概率,得到所述得分和所述第二概率的函数关系;
通过将所述最高得分代入到所述函数关系中,得到所述第一概率。
5.如权利要求1所述的方法,其特征在于,在所述获取待鉴定微生物的质谱图前,所述方法还包括:
S1:针对所述数据库中的每一个所述已知微生物,获取该已知微生物的至少一个质谱图;
S2:在所述至少一个质谱图中任选一个第一质谱图,以将该第一质谱图确定为第一基准质谱图;
S3:依次遍历所述至少一个质谱图中除所述第一质谱图外的每一个第二质谱图,以计算所述第二质谱图中各谱峰的质量值与所述第一基准质谱图中每一个第一基准谱峰的质量值的差值;
S4:针对每一个所述第一基准谱峰,在该第一基准谱峰对应的差值中筛选在第二预设范围内的第一差值,并将所述第一差值对应的所述第二质谱图的谱峰确定为该第一基准谱峰的匹配谱峰;
S5:将所述第二质谱图中除所述第一基准谱峰的匹配谱峰外的谱峰加入到所述第一基准质谱图中,以得到第二基准质谱图;
S6:计算所述第二基准质谱图中各第二基准谱峰的质量值与对应的匹配谱峰的质量值的第一质量均值,并使用各所述第一质量均值替换对应的第二基准谱峰的质量值,以得到第三基准质谱图;
S7:...
【专利技术属性】
技术研发人员:黄泽炽,张鑫磊,李红磊,孔祥雅,
申请(专利权)人:北京携云基因科技有限公司,
类型:发明
国别省市:北京;11
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