包含细菌菌株的组合物制造技术

本发明专利技术提供了包含细菌菌株的组合物，其用于治疗和预防癌症。

【技术实现步骤摘要】
包含细菌菌株的组合物本申请是中国专利申请第201680066772.2号的分案申请。专利
本专利技术属于包含从哺乳动物消化道分离的细菌菌株的组合物和此类组合物用于治疗疾病的用途的领域。专利技术背景虽然认为人类肠道在子宫内是无菌的，但在出生后其立刻暴露于大量的母体和环境微生物。此后，出现微生物定殖和演替的动态期，其受例如分娩模式、环境、饮食和宿主基因型等因素影响，所有因素都影响肠微生物丛的组成，特别是在童年期间。随后，微生物丛稳定化并变成成人样[1]。人类肠微生物丛含有超过500-1000个基本上属于两大细菌分类脆弱拟杆菌(Bacteroidete)和厚壁门菌(Firmicute)的不同种系型[2]。由人类肠的细菌定殖产生的成功共生关系产生多种代谢、结构、保护和其它有益功能。定殖肠部的增强代谢活性确保降解以其它方式无法摄取的饮食组分，同时释放副产物，为宿主提供重要的营养物来源。类似地，充分认识到肠微生物丛的免疫重要性，且在免疫系统减弱的无菌动物中例示，其免疫系统在引入共生细菌后在功能上复原[3-5]。微生物丛组成的显著变化已经在例如发炎性肠病(IBD)等肠胃病症中证明。举例来说，在IBD患者中梭菌属(Clostridium)XIVa簇细菌的水平降低，而大肠杆菌数目增加，表明肠内共生体与病原性共生体的平衡的变化[6-9]。有趣地，此微生物生态失调也与效应T细胞群体的不平衡相关。认识到某些细菌菌株对动物肠可能具有潜在的积极作用，已经提议各种菌株用于治疗各种疾病(参见例如[10-13])。也已经提议某些菌株，包括大部分乳杆菌属(Lactobacillus)和双歧杆菌属(Bifidobacterium)菌株，用于治疗不直接与肠相关的各种发炎性和自身免疫性疾病(综述参见[14]和[15])。然而，不同疾病和不同细菌菌株之间的关系和特定细菌菌株对肠和在全身水平下和对任何特定类型疾病的准确作用尚未很好地表征。举例来说，某些肠球菌物种与引起癌症有关联[16]。本领域中需要治疗疾病的新方法。还需要待表征的肠细菌的潜在作用，以可以研发使用肠细菌的新疗法。专利技术概要本专利技术人已经研发用于治疗和预防疾病的新疗法。具体来说，本专利技术人已经研发用于治疗和预防癌症的新疗法。具体来说，本专利技术人已经确定鹑鸡肠球菌(Enterococcusgallinarum)物种的细菌菌株可以有效治疗和预防癌症。如实施例中所描述，经口施用包含鹑鸡肠球菌的组合物可以减小癌症的小鼠模型中的肿瘤尺寸。在优选实施方案中，本专利技术提供了一种包含鹑鸡肠球菌物种的细菌菌株的组合物，其用于治疗或预防例如乳癌、肺癌或肝癌等癌症的方法中。本专利技术人已经确定用包含鹑鸡肠球菌物种的细菌菌株的组合物治疗可以减少乳癌、肺癌和肝癌的小鼠模型中的肿瘤生长。在某些实施方案中，组合物用于在癌症治疗中减小肿瘤尺寸或预防肿瘤生长的方法中。使用鹑鸡肠球菌的组合物可以特别有效用于在癌症治疗中减小肿瘤尺寸或预防肿瘤生长。在本专利技术的优选实施方案中，组合物中的细菌菌株属于鹑鸡肠球菌。也可使用密切相关的菌株，例如具有与鹑鸡肠球菌的细菌菌株的16srRNA序列至少95％、96％、97％、98％、99％、99.5％或99.9％一致的16srRNA序列的细菌菌株。优选地，细菌菌株具有与SEQIDNO:1或2至少95％、96％、97％、98％、99％、99.5％或99.9％一致的16srRNA序列。优选地，序列一致性是针对SEQIDNO:2。优选地，用于本专利技术的细菌菌株具有由SEQIDNO:2表示的16srRNA序列。因此，本专利技术还提供了一种包含具有与鹑鸡肠球菌的细菌菌株的16srRNA序列至少95％一致的16srRNA序列的细菌菌株的组合物，其用于治疗或预防癌症的方法中。具体地说，本专利技术提供了一种包含具有与SEQIDNO:2至少95％一致的16srRNA序列的细菌菌株的组合物，其用于治疗或预防癌症的方法中。在一些实施方案中，组合物中的细菌菌株不属于鹑鸡肠球菌。在一些实施方案中，组合物中的细菌菌株不属于鹑鸡肠球菌，而是密切相关的菌株。在某些实施方案中，本专利技术的组合物用于经口施用。经口施用本专利技术的菌株可以有效地治疗癌症。此外，经口施用便于患者和开业医师且允许传递到肠和/或部分或全部定殖肠部。在某些实施方案中，本专利技术的组合物包含一种或多种药学上可接受的赋形剂或载剂。在某些实施方案中，本专利技术的组合物包含已冻干的细菌菌株。冻干是一项制备允许传递细菌的稳定组合物的有效和便利的技术。在某些实施方案中，本专利技术提供了一种包含如上所述的组合物的食品。在某些实施方案中，本专利技术提供了一种包含如上所述的组合物的疫苗组合物。另外，本专利技术提供了一种治疗或预防癌症的方法，其包括施用包含鹑鸡肠球菌物种的细菌菌株的组合物。在研发以上专利技术时，本专利技术人已经鉴别和表征特别适用于疗法的细菌菌株。本专利技术的鹑鸡肠球菌菌株展示有效治疗癌症。因此，在另一个方面中，本专利技术提供了一种以登记号NCIMB42488保藏的鹑鸡肠球菌菌株或其衍生物的细胞。本专利技术还提供了包含此类细胞的组合物或此类细胞的生物纯培养物。本专利技术还提供了一种以登记号NCIMB42488保藏的鹑鸡肠球菌菌株或其衍生物的细胞，其用于治疗中，尤其用于癌症。类似地，本专利技术提供了一种具有与SEQIDNO:2至少95％一致的16srRNA序列的细菌菌株或其衍生物的细胞。本专利技术还提供了包含此类细胞的组合物或此类细胞的生物纯培养物。本专利技术还提供了一种具有与SEQIDNO:2至少95％一致的16srRNA序列的细菌菌株或其衍生物的细胞，其用于治疗中，尤其治疗或预防癌症。图示简单说明图1：乳癌的小鼠模型-肿瘤体积。图2：肺癌的小鼠模型-肿瘤体积。图3：肝癌的小鼠模型-肝重。图4A：未成熟树突状细胞中的细胞因子水平(pg/ml)(无细菌)。图4B：在添加LPS之后未成熟树突状细胞中的细胞因子水平(pg/ml)。图4C：在添加MRX518之后未成熟树突状细胞中的细胞因子水平(pg/ml)。图4D：在添加MRX518和LPS之后未成熟树突状细胞中的细胞因子水平(pg/ml)。图5A：THP-1细胞中的细胞因子水平(无细菌)。图5B：在添加细菌沉积物之后THP-1细胞中的细胞因子水平。图5C：在添加单独或与LPS组合的MRX518之后THP-1细胞中的细胞因子水平。专利技术详述细菌菌株本专利技术的组合物包含鹑鸡肠球菌物种的细菌菌株。所述实施例证明此物种细菌可用于治疗或预防癌症。本专利技术还提供了包含具有与鹑鸡肠球菌的细菌菌株的16srRNA序列至少95％一致的16srRNA序列的细菌菌株的组合物，其用于治疗中，例如用于治疗或预防癌症的方法中。具体地说，本专利技术还提供了包含具有与SEQIDNO:2至少95％一致的16srRNA序列的细菌菌株的组合物，其用于治疗中，例如用于治疗或预防癌症的方法中。在一些实施方案中，组合物中的细菌菌株不属于鹑鸡肠本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.包含细菌菌株的组合物在制备用于治疗的药物中的用途，其中所述细菌菌株：/na.具有与SEQ ID NO:2至少99.5％一致的16s rRNA序列；或/nb.具有在SEQ ID NO:3的至少90％上与SEQ ID NO:3至少98％序列一致的染色体；或/nc.具有在SEQ ID NO:4的至少90％上与SEQ ID NO:4至少98％序列一致的质粒；或/nd.对以下中的至少一种的发酵呈阳性：L-阿拉伯糖、D-核糖、D-木糖、D-半乳糖、D-葡萄糖、D-果糖、D-甘露糖、N-乙酰葡糖胺、扁桃苷、熊果苷、水杨苷、D-纤维二糖、D-麦芽糖、蔗糖、D-海藻糖、龙胆二糖、D-塔格糖和葡糖酸钾；和/或/n对以下中的至少一种的发酵呈中间阳性：D-甘露糖醇、甲基-αD-吡喃葡糖苷、D-乳糖、淀粉和L-岩藻糖。/n

【技术特征摘要】
20151120 GB 1520502.4;20160323 GB 1604924.91.包含细菌菌株的组合物在制备用于治疗的药物中的用途，其中所述细菌菌株：
a.具有与SEQIDNO:2至少99.5％一致的16srRNA序列；或
b.具有在SEQIDNO:3的至少90％上与SEQIDNO:3至少98％序列一致的染色体；或
c.具有在SEQIDNO:4的至少90％上与SEQIDNO:4至少98％序列一致的质粒；或
d.对以下中的至少一种的发酵呈阳性：L-阿拉伯糖、D-核糖、D-木糖、D-半乳糖、D-葡萄糖、D-果糖、D-甘露糖、N-乙酰葡糖胺、扁桃苷、熊果苷、水杨苷、D-纤维二糖、D-麦芽糖、蔗糖、D-海藻糖、龙胆二糖、D-塔格糖和葡糖酸钾；和/或
对以下中的至少一种的发酵呈中间阳性：D-甘露糖醇、甲基-αD-吡喃葡糖苷、D-乳糖、淀粉和L-岩藻糖。


2.如权利要求1所述的用途，其中所述细菌菌株是以登记号NCIMB42488保藏的细菌菌株的生物型菌株。


3.如权利要求2所述的用途，其中所述生物型菌株在其基因组的至少90％上具有与所述以登记号NCIMB42488保藏的细菌菌株的基因组至少98％的序列一致性，并且任选地具有与SEQIDNO:2序列至少99.5％一致的16srRNA序列。


4.如前述权利要求中任一项所述的用途，其中所述细菌菌株具有由SEQIDNO:2表示的16srRNA序列。


5.如前述权利要求中任一项所述的用途，其中所述药物用于治疗或预防癌症。


6.如权利要求5所述的用途，其中所述癌症为肺癌、乳癌、肝癌或...

【专利技术属性】
技术研发人员：伊姆克·伊丽莎白·马尔德，艾米·贝丝·霍尔特，多梅尼科·潘兹卡，肖恩·玛丽·麦克罗斯基，
申请(专利权)人：四D制药研究有限公司，
类型：发明
国别省市：英国;GB