一种苹果属植物全基因组InDel标记基因型数据库及其在种质资源特异性鉴定上的应用制造技术

本发明专利技术提供了一种苹果属植物全基因组InDel标记基因型数据库及其在种质资源特异性鉴定上的应用，属于分子生物学技术领域，所述基因型数据库的构建方法包括：利用引物对和多重PCR对所述苹果种质资源基因组DNA样品的InDel标记进行基因分型；按照每份苹果种质资源对应InDel标记的基因型为一行记录；汇总全部种质资源记录，得到苹果属植物全基因组InDel标记基因型数据库。本发明专利技术提供的数据库能够简便、高效、稳定地鉴定苹果种质的特异性，克服了DUS测试易受环境影响的局限性，为苹果新品种保护及种质资源的管理提供了一个有力工具。

【技术实现步骤摘要】
一种苹果属植物全基因组InDel标记基因型数据库及其在种质资源特异性鉴定上的应用
本专利技术属于分子生物学
，尤其涉及一种苹果属植物全基因组InDel标记基因型数据库及其在种质资源特异性鉴定上的应用。
技术介绍
苹果是世界上五大果树之一，栽培历史悠久。我国是苹果生产大国，栽培面积、产量和消费量均为世界第一，在我国农业生产中占有重要的地位。新中国成立以来，在我国苹果育种工作者通过不懈努力，先已经培育出数以百计的新品种。但是在杂交育种的亲本选择上，‘元帅’、‘国光’、‘金冠’、‘富士’和‘红玉’是最常用的育种亲本。由于骨干亲本的反复利用使得品种间遗传差异变小、遗传背景狭窄，为苹果品种的准确鉴定提出了更高的要求。根据1961年在巴黎签订的《国际植物新品种保护公约》，审查一个植物新品种要对其进行特异性(Distinctness)、一致性(Uniformity)和稳定性(Stability)测试，即DUS测试。由于传统的田间测试方法费时费力、受环境影响较大，人们逐渐将新品种测试中的新技术手段聚焦在DNA分子标记构建的指纹图谱技术及相本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种苹果属植物全基因组InDel标记基因型数据库，其特征在于，所述基因型数据库的构建方法包括：利用引物对和多重PCR对所述苹果种质资源基因组DNA样品的InDel标记进行基因分型；按照每份苹果种质资源对应InDel标记的基因型为一行记录；汇总全部种质资源记录，得到苹果属植物全基因组InDel标记基因型数据库；/n所述InDel的核苷酸序列如SEQ ID No.1～102所示；/n所述引物对的上游引物的核苷酸序列如SEQ ID No.103～204所示，所述引物对的下游引物的核苷酸序列如SEQ ID No.205～306所示；/n所述SEQ ID No.103～204为依次扩增SEQ ID ...

【技术特征摘要】
1.一种苹果属植物全基因组InDel标记基因型数据库，其特征在于，所述基因型数据库的构建方法包括：利用引物对和多重PCR对所述苹果种质资源基因组DNA样品的InDel标记进行基因分型；按照每份苹果种质资源对应InDel标记的基因型为一行记录；汇总全部种质资源记录，得到苹果属植物全基因组InDel标记基因型数据库；
所述InDel的核苷酸序列如SEQIDNo.1～102所示；
所述引物对的上游引物的核苷酸序列如SEQIDNo.103～204所示，所述引物对的下游引物的核苷酸序列如SEQIDNo.205～306所示；
所述SEQIDNo.103～204为依次扩增SEQIDNo.1～102的上游引物；
所述SEQIDNo.205～306为依次扩增SEQIDNo.1～102的下游引物；
所述多重PCR的配组如下表所示：











2.根据权利要求1所述的苹果属植物全基因组InDel标记基因型数据库，其特征在于，所述多重PCR的反应程序为：95℃预变性5min；95℃变性30s，55℃退火90s，72℃延伸90s，35个循环；60℃延伸30min。


3.根据权利要求1或2所述的苹果属植物全基因组InDel标记基因型数据库，其特征在于，所述多重PCR的体系每10μL包括：浓度为200ng/μL的1μL基因组DNA、4μL2.5×MasterMixI、1μLPrimermix和4μLddH2O；所述Primermix中每对引物的浓度均为0.2μM。


4.根据权利要求1所述的苹果属植物全基因组InDel标记基因型数据库，其特征在于，所述苹果属植物全基因组InDel标记基因型数据库中任意一份苹果属种质资源所有InDel标记的基因型组合作为鉴定该份种质资源特异性的分子身份信息。

【专利技术属性】
技术研发人员：张新忠，王旋，申飞，陈瑞婷，韩振海，王忆，吴婷，许雪峰，李威，邱昌朋，张希，
申请(专利权)人：中国农业大学，
类型：发明
国别省市：北京;11