白皮松EST-SSR引物及其在群体遗传多样性分析中的应用制造技术

本发明专利技术公开了白皮松EST‑SSR引物及其在群体遗传多样性分析中的应用。本发明专利技术利用白皮松转录组数据设计开发了特异的EST‑SSR标记从中筛选合成了96对引物并对其进行了相关验证，最终筛选出差异较为稳定、多态性良好的11对EST‑SSR特异性引物。本发明专利技术进一步公开了所述的EST‑SSR特异性引物在白皮松群体遗传多样性分析、多态性分析以及构建遗传图谱等方面的应用。本发明专利技术所提供的EST‑SSR引物可为白皮松群体的进化研究、种质资源保护等提供重要的借鉴价值，对于白皮松良种繁育也具有指导意义。

【技术实现步骤摘要】
白皮松EST-SSR引物及其在群体遗传多样性分析中的应用
本专利技术涉及EST-SSR引物，尤其涉及白皮松EST-SSR特异性引物，本专利技术进一步涉及所述白皮松EST-SSR特异性引物在群体遗传多样性分析等方面的应用，属于白皮松EST-SSR特异性引物及其应用领域。
技术介绍
近年来，随着分子生物学的不断发展，多种分子标记技术被开发且广泛应用于生物学研究，如随机扩增多态性DNA(RAPD)、简单重复序列(SSRs)、起始密码子多态性(SCoT)和单核苷酸多态性(SNPs)等。其中，简单重复序列标记技术(SSR)是针对基因组DNA中简单重复序列区域所设计的分子标记技术。基因组DNA中重复序列包括两种类型：分散型和串联型，其中SSR标记主要针对的是串联重复序列中的微卫星DNA，因此又被称为微卫星DNA标记。由于基因组DNA在复制过程中的滑动和修复机制造成微卫星DNA在全基因组水平上重复次数的差异，从而使得SSR标记在植物群体中具有较高的多态性，同时微卫星DNA两端序列又具有较高的保守性，因此通过设计合适的引物即可快速进行SSR分子标记多态性的检测本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.用于白皮松群体遗传多样性分析的EST-SSR特异性引物，其特征在于，由以下8对引物对组成：(1)由核苷酸序列为SEQ ID No.1和SEQ ID No.2所示的引物组成的引物对BPS-SSR-1；(2)由核苷酸序列为SEQ ID No.3和SEQ ID No.4所示的引物组成的引物对BPS-SSR-9；(3)由核苷酸序列为SEQ ID No.5和SEQ ID No.6所示的引物组成的引物对BPS-SSR-14；(4)由核苷酸序列为SEQ ID No.7和SEQ ID No.8所示的引物组成的引物对BPS-SSR-52；(5)由核苷酸序列为SEQ ID No.9和SEQ ID No.10所...

【技术特征摘要】
1.用于白皮松群体遗传多样性分析的EST-SSR特异性引物，其特征在于，由以下8对引物对组成：(1)由核苷酸序列为SEQIDNo.1和SEQIDNo.2所示的引物组成的引物对BPS-SSR-1；(2)由核苷酸序列为SEQIDNo.3和SEQIDNo.4所示的引物组成的引物对BPS-SSR-9；(3)由核苷酸序列为SEQIDNo.5和SEQIDNo.6所示的引物组成的引物对BPS-SSR-14；(4)由核苷酸序列为SEQIDNo.7和SEQIDNo.8所示的引物组成的引物对BPS-SSR-52；(5)由核苷酸序列为SEQIDNo.9和SEQIDNo.10所示的引物组成的引物对BPS-SSR-62；(6)由核苷酸序列为SEQIDNo.11和SEQIDNo.12所示的引物组成的引物对BPS-SSR-83；(7)由核苷酸序列为SEQIDNo.13和SEQIDNo.14所示的引物组成的引物对BPS-SSR-96；(8)由核苷酸序列为SEQIDNo.15和SEQIDNo.16所示的引物组成的引物对BPS-SSR-50。


2.用于白皮松群体遗传多样性分析的EST-SSR特异性引物，其特征在于，由以下11对引物对组成：(1)由核苷酸序列为SEQIDNo.1和SEQIDNo.2所示的引物组成的引物对BPS-SSR-1；(2)由核苷酸序列为SEQIDNo.3和SEQIDNo.4所示的引物组成的引物对BPS-SSR-9；(3)由核苷酸序列为SEQIDNo.5和SEQIDNo.6所示的引物组成的引物对BPS-SSR-14；(4)由核苷酸序列为SEQIDNo.7和SEQIDNo.8所示的引物组成的引物对BPS-SSR-52；(5)由核苷酸序列为SEQIDNo.9和SEQIDNo.10所示的引物组成的引物对BPS-SSR-62；(6)由核苷酸序列为SEQIDNo.11和SEQIDNo.12所示的引物组成的引物对BPS-SSR-83；(7)由核苷酸序列为SEQIDNo.13和SEQIDNo.14所示的引物组成的引物对BPS-SSR-96；(8)由核苷酸序列为SEQIDNo.15和SEQIDNo.16所示的引物组成的引物对BPS-SSR-50；(9)由核苷酸序列为SEQIDNo.17和SEQIDNo.18所示的引物组成的引物对BPS-SSR-16；(10)由核苷酸序列为SEQIDNo.19和SEQIDNo.20所示的引物组成的引物对BPS-SSR-82；(11)由核苷酸序列为SEQIDNo.21和SEQIDNo.22所示的引物组成的引物对BPS-SSR-93。


3.白皮松EST-SSR特异性引物，其特征在于，选自以下11对引物对中的任何一种或一种以上的组合：(1)由核苷酸序列为SEQIDNo.1和SEQIDNo.2所示的引物组成的引物对BPS-SSR-1；(2)由核苷酸序列为SEQIDNo.3和SEQIDNo.4所示的引物组成的引物对BPS-SSR-9；(3)由核苷酸序列为SEQIDNo.5和SEQIDNo.6所示的引物组成的引物对BPS-SSR-14；(4)由核苷酸...

【专利技术属性】
技术研发人员：陈仲，杨雄，李国雷，袁启华，
申请(专利权)人：北京林业大学，
类型：发明
国别省市：北京;11