鸡体重及腹脂重相关的AGO3基因分子标记及其应用制造技术

本发明专利技术公开了鸡体重及腹脂重相关的AGO3基因分子标记和应用。该分子标记位于鸡基因组23号染色体上AGO3基因5′‑侧翼区，包括以下位点：鸡基因组gallus gallus 6版本23号染色体上第4330286bp处的A＞T突变、23号染色体上第4330299bp处的C＞T突变；应用时选择其中的一个位点或者两个位点来进行鸡体重及腹脂重的选育。通过优选这些SNP位点优势基因型，可以大大提供鸡的体重及腹脂重，在相同饲喂条件下，同日龄肉鸡中，体重更重，日增重更快，腹脂含量更高更重，饲料转化率更高，不仅可以减少饲养成本，还可以增加肉重，增加腹脂率，最终提高利润率。

【技术实现步骤摘要】
鸡体重及腹脂重相关的AGO3基因分子标记及其应用
本专利技术涉及分子生物技术和分子标记
，特别涉及一种鸡体重及腹脂重相关的AGO3基因分子标记及应用。
技术介绍
Argonaute蛋白首次是在植物中被鉴定出来，它有两个主要功能结构域，分别为PAZ结构域(PiwiArgonauteZwille)和PIWI结构域，整体Argonaute蛋白的结构还包括MID结构域，N-末端结构域和C-末端结构域。真核生物的Argonaute蛋白家族可分为AGO蛋白和PIWI蛋白，分别以拟南芥(Arabidopsisthaliana)AGO1和黑腹果蝇(Drosophilamelanogaster)Piwi代表。它们在物种之间高度保守，许多生物体可编码多个AGO蛋白家族成员。Argonaute蛋白在物种间发挥着多种多样的生物学功能。Argonaute蛋白是RNA诱导的沉默复合物(RISC)的重要组成部分，它们在不同的小分子RNA途径中起着重要作用。AGO蛋白主要与miRNA或siRNA相互作用，参与细胞质中转录后基因沉默过程。PIWI蛋白主要在生殖细胞中表达，并通过与PIWI相互作用的piRNA结合以沉默转座基因元件。结构分析表明，Argonaute蛋白的每个组分对RISC的活性都具有特殊功能。在RISC切割mRNA时，PAZ结构域可以抓住小RNA的3’末端。mRNA从N末端和PAZ结构域之间进入，再从PAZ和中间结构域之间出来。PIWI结构域与RNA酶H高度同源，与RNAi干扰机制组分的特殊结构相结合。因此，Argonaute蛋白的基本功能是在RISC中作为切割机调节基因表达。此外，Argonaute蛋白和miRNA的复合物能够将靶mRNA引导到P体中，而P体中存在大量的mRNA降解酶可导致mRNA的直接降解，但不会抑制其翻译。此外，Argonaute蛋白参与DNA甲基化和染色体重组，从而诱导转录后基因沉默。AGO3是miRNA介导的转录后基因沉默中发挥作用的主要Argonaute蛋白，在衣藻(Chlamydomonas)中鉴定出45个AGO3相关miRNA。人类AGO3参与调节人类干细胞增殖，可以特异性增强microRNAlet-7a的随从链的表达。Argonaute蛋白在鸟类中的作用的信息很少报道，在家禽上更鲜有报道，尤其是在鸡上的研究更少。随着社会的进步，人们的生活水平越来越高，人们对于鸡肉品质和数量的需求也越来越高，由此亟需从新的途径来研究和解决可以提高鸡的生长性能并能稳定遗传的方法。
技术实现思路
本专利技术的目的是提供一种鸡体重及腹脂重相关的AGO3基因分子标记和应用，以解决上述问题。根据本专利技术的一个方面，提供了一种鸡体重及腹脂重相关的AG03基因分子标记，该分子标记位点位于鸡基因组gallusgallus6版本23号染色体上AG03基因5′-侧翼区。在某些实施方式中，鸡体重及腹脂重相关的AG03基因分子标记位点包括以下位点：鸡基因组gallusgallus6版本23号染色体上第4330286bp处的A＞T突变。在某些实施方式中，鸡体重及腹脂重相关的AG03基因分子标记位点包括以下位点：鸡基因组gallusgallus6版本23号染色体上第4330299bp处的C＞T突变根据本专利技术的另一个方面，提供了一种鸡体重及腹脂重相关的AG03基因分子标记在鸡遗传育种中的应用。根据本专利技术的第三个方面，提供了一种提高鸡体重及腹脂重的方法，该方法包括如下步骤：1)检测鸡23号染色体上第4330286bp、4330299bp处的影响鸡体重及腹脂重的分子标记；2)分析标记在第4330286bp处的AA型；分子标记在第4330299bp处的CT型；选择其中的一个基因型或者两个基因型组合的个体；3)将选择出的个体作为种鸡，进行繁育，培育出高生长性能的品系。在某些实施方式中，鸡品系包括选用杏花鸡×隐性白洛克鸡杂交的F2代全同胞家系。根据本专利技术的第四个方面，提供了一种鸡的遗传改良的方法，该方法包括：1)检测鸡23号染色体上第4330286bp、4330299bp处的影响鸡体重及腹脂重的分子标记；2)分析标记在第4330286bp处的AA型；分子标记在第4330299bp处的CT型；选择其中的一个基因型或者两个基因型组合的个体；3)将选择出的个体作为种鸡，进行繁育，培育出高生长性能的品系；4)将培育出的高生长性能的品系作为种鸡，经过繁育，逐代提高该位点的优势等位基因的频率，从而改良后代鸡的体重及腹脂重本专利技术的有益效果：1、本专利技术公开的影响鸡体重及腹脂重的分子标记，位于23号染色体上AGO3基因5′-侧翼区，该位点的分子标记在选育时更加高效和稳定。2、影响鸡体重及腹脂重的分子标记应用在鸡的遗传育种上，更加高效并能稳定遗传。3、通过优选本专利技术公开的SNP位点优势基因型，可以大大提供鸡的体重及腹脂重，在相同饲喂条件下，同日龄肉鸡中，体重更重，日增重更快，腹脂含量更高更重，饲料转化率更高，不仅可以减少饲养成本，还可以增加肉重，增加腹脂率，最终提高利润率。具体实施方式下面对专利技术作进一步详细的说明。1实验材料选择具有深度表型记录的(杏花鸡×隐性白洛克鸡)F2全同胞家系，杏花鸡是慢生本土品种，隐性白洛克鸡是外来速生肉鸡品种，Leietal.，2005详细介绍了F2家系形成的过程。2鸡AG03基因5′-侧翼区的SNP位点的克隆和鉴定2.1鸡AG03基因5′-侧翼区的SNP位点的克隆从DNA样品中随机选择10个F2资源群体(杏花鸡×隐性白洛克肉鸡)的DNA样本用作混池模板，通过PCR和测序鉴定AG035′侧翼区域的SNP。对于SNP基因分型，所有DNA样品进行PCR和测序，然后用DNAStar软件的SeqMan程序分析得到的序列，以鉴定每个个体的基因型。PCR扩增体系如下表1，反应程序为94℃预变性3min，32个循环(94℃变性30s，58℃退火30s，72℃延伸30s)，最后72℃延伸5min，16℃保存。其中引物序列为Forwardprimer：AGO3-F，ATTGAGGCTGTGGATGAA；Reverseprimer：AGO3-R，GCTATTGGAGGTGATATTGT。表1PCR反应体系3.2鸡AGO3基因5′-侧翼区的SNP位点的鉴定在AGO3基因的5′-侧翼区鉴定出2个SNP(如表2所示)，对F2家系(杏花鸡×隐性白洛克肉鸡)进行基因分型和关联分析。以转录起始位点的位置为基准，将这2个SNP分别命名为g.4330286A＞T和g.4330299C＞T，对应的位点分别位于鸡基因组第23号染色体上第4330286处和第4330299处。表2在鸡AGO3基因的5′侧翼区鉴定了2个SNP2.3鸡AGO3基因5′侧翼区的SNP位点与鸡体重及腹脂重性状的关联分析2.3.1本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.鸡体重及腹脂重相关的AGO3基因分子标记，其中，所述的分子标记位点位于鸡基因组23号染色体上AGO3基因5′-侧翼区。/n

【技术特征摘要】
1.鸡体重及腹脂重相关的AGO3基因分子标记，其中，所述的分子标记位点位于鸡基因组23号染色体上AGO3基因5′-侧翼区。


2.根据权利要求1所述的鸡体重及腹脂重相关的AGO3基因分子标记，其中，所述的分子标记位点包括以下位点：鸡基因组gallusgallus6版本23号染色体上第4330286bp处的A＞T突变。


3.根据权利要求1所述的鸡体重及腹脂重相关的AGO3基因分子标记，其中，所述的分子标记位点包括以下位点：鸡基因组gallusgallus6版本23号染色体上第4330299bp处的C＞T突变。


4.权利要求2或3所述的鸡体重及腹脂重相关的AGO3基因分子标记在鸡遗传育种中的应用。

【专利技术属性】
技术研发人员：聂庆华，陈小兰，陈扬风，黎镇晖，徐海平，郑茗，
申请(专利权)人：华南农业大学，
类型：发明
国别省市：广东;44