【技术实现步骤摘要】
质谱数据的反卷积
本专利技术涉及用于分析和反卷积质谱数据的获取后方法。确切地说，质谱数据包含重叠的同位素模式。本专利技术适用于如蛋白质组学、蛋白质分析、肽分析、代谢组学、核酸分析、化合物识别和疾病检测、药物和毒理学标记物的领域中的质谱数据的定量分析。本专利技术尤其(但非排他地)适用于已使用质量标签(例如串联质量标签(TMT))获取的质谱数据的分析。
技术介绍
最近，质谱领域中使用可裂解地附接到所关注的相关分子的质量标签(也称为质量标记)已得以发展。标签用于识别和定量生物大分子，如蛋白质、肽和核酸。使用串联质量标签(TMT)的方法描述于WO01/68664和Thompson等人《分析化学(Anal.Chem.)》2003,75,1895-1904。TMT含有四个区或部分，即质量报告子区或部分(M)、可裂解连接子区或部分(F)、质量标准化区或部分(N)和蛋白质反应性基团(R)。所有标签的化学结构均相同，但各自含有在不同位置处经取代的同位素，使得质量报告子和质量标准化区在每一标签中具有不同分子质量。标签的组合M-F-N-R区具有相...
【技术保护点】
1.一种用于对所测量的质谱数据进行反卷积的方法，所述方法包含：/n接收表示各自具有相应同位素模式的至少两个分子部分的所测量的质谱数据，其中所述同位素模式中的至少两个重叠；/n迭代填充一组质量通道以产生所述质谱数据的近似版本，所述迭代填充包含多个迭代，每一迭代包含根据选用于所述迭代的两个或更多个分子部分中的相应一个的所述同位素模式，用强度数据块填充所述质量通道中的一个或多个；/n当满足指示所述质谱数据的所述近似版本符合所述所测量的质谱数据的适合性标准时，终止所述迭代填充；并且/n根据所述分子部分的所述相应同位素模式，基于总填充量确定产生所述所测量的质谱数据的每个分子部分的量。/n
【技术特征摘要】
20190802 EP 19189886.5;20190531 GB 1907792.41.一种用于对所测量的质谱数据进行反卷积的方法，所述方法包含：
接收表示各自具有相应同位素模式的至少两个分子部分的所测量的质谱数据，其中所述同位素模式中的至少两个重叠；
迭代填充一组质量通道以产生所述质谱数据的近似版本，所述迭代填充包含多个迭代，每一迭代包含根据选用于所述迭代的两个或更多个分子部分中的相应一个的所述同位素模式，用强度数据块填充所述质量通道中的一个或多个；
当满足指示所述质谱数据的所述近似版本符合所述所测量的质谱数据的适合性标准时，终止所述迭代填充；并且
根据所述分子部分的所述相应同位素模式，基于总填充量确定产生所述所测量的质谱数据的每个分子部分的量。
2.根据权利要求1所述的方法，其中对于每一迭代，所述强度数据块包含各自对应于相应质量通道的强度组，其中根据所述强度数据的所述同位素模式按比例调整所述强度组。
3.根据权利要求1所述的方法，其中对于每一迭代，所述强度数据块是相应质量通道的强度，其中根据基于所述强度数据的所述同位素模式的概率分布选择所述相应质量通道。
4.根据任一前述权利要求所述的方法，其中基于在所述迭代处的所述所测量的质谱数据与所述质谱数据的所述近似版本之间的偏差的量度来选择选用于每一迭代的所述分子部分。
5.根据任一前述权利要求所述的方法，其中在每一迭代处，选择具有对应于所述质量通道的质量的所述分子部分，所述质量通道在所述质谱数据的所述近似版本与所述所测量的质谱数据之间具有最大强度差异。
6.根据任一前述权利要求所述的方法，其进一步包含如果填充导致所述质谱数据的所述近似版本的质量通道的强度高于所述所测量的质谱数据的质量...
【专利技术属性】
技术研发人员：R·马雷克，F·伯格，K·弗里策迈耶，
申请(专利权)人：塞莫费雪科学不来梅有限公司，
类型：发明
国别省市：德国;DE
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