一种气单胞菌属内不同物种的条形码鉴定引物、鉴定方法和试剂盒技术

本发明专利技术公开了一种气单胞菌属内不同物种的条形码鉴定引物、鉴定方法和试剂盒。它包括F：5’‑GGAATTCGCAACCGTTCTGGCTCAGGCTATCGT‑3’；R：5’‑TGTCGACGACGGCAGCCACTTTCAC‑3’。16S rRNA序列分析鉴定方法普遍认为,序列相似性达到97％以上即视为同种水平，而实际应用中往往出现气单胞菌属多个不同的物种满足该序列相似性要求。这种情况下，16S rRNA序列分析只能鉴定到属水平而无法准确鉴定到种。本发明专利技术可以解决上述问题，待测物种cpn60序列经BLAST比对后，满足相似性大于98.8％且覆盖度大于98％的比对结果高度专一，为气单胞菌属下特定种，比对结果中不存在不同物种的情况。

【技术实现步骤摘要】
一种气单胞菌属内不同物种的条形码鉴定引物、鉴定方法和试剂盒
：本专利技术属于生物学
，具体涉及一种气单胞菌属内不同物种的条形码鉴定引物、鉴定方法和试剂盒。
技术介绍
：气单胞菌(Aeromonasspp)隶属弧菌科，兼性厌氧，是一种革兰阴性细菌，广泛分布于河流、湖泊、池塘、海水、河口等水生生境。气单胞菌可感染多种动物，引起动物患病甚至死亡，给水产养殖业带来巨大的挑战。此外，致病性气单胞菌还可引起人发生急性腹泻，菌血症、脑膜炎、心内膜炎等疾病，给公共卫生安全带来隐患，给人类健康带来影响。因此,如何快速准确地对病原菌进行鉴定,从而有针对性地对病情进行控制,在生产实践上具有重要的意义。目前，针对气单胞菌的检测主要采用生理生化特征结合16SrRNA序列分析进行鉴定。生理生化特征旨在利用不同种类的气单胞菌对底物的分解利用能力、代谢产物方面存在的差别，根据一系列生化指标将不同种类的气单胞菌区分开来。该方法缺点是需要综合利用生化指标及其培养特征进行判断，检测过程繁琐,试验所需时间比较长。16SrRNA序列分析是细菌种属鉴定中最常用的分子本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种气单胞菌属不同物种的条形码鉴定引物，其特征在于，包括：/nF：5’-GGAATTCGCAACCGTTCTGGCTCAGGCTATCGT-3’；/nR：5’-TGTCGACGACGGCAGCCACTTTCAC-3’。/n

【技术特征摘要】
1.一种气单胞菌属不同物种的条形码鉴定引物，其特征在于，包括：
F：5’-GGAATTCGCAACCGTTCTGGCTCAGGCTATCGT-3’；
R：5’-TGTCGACGACGGCAGCCACTTTCAC-3’。


2.一种气单胞菌属不同物种的条形码鉴定方法，其特征在于，包括以下步骤：
A、提取待测气单胞菌基因组DNA；
B、使用权利要求1所述的条形码鉴定引物进行PCR扩增，产物经琼脂糖凝胶电泳检测合格后进行测序；
C、将待测PCR产物序列作BLAST比对分析，以序列覆盖度大于98％且相似度大于98.8％作为筛选标准，GenBank数据库中满足此条件的物种与待测物种为同一物种。


3.根据权利要求2所述的条形码鉴定方法，其特征在于，从Gen...

【专利技术属性】
技术研发人员：李梅，许承佳，李丹，林森馨，陈发明，李天宇，杨呈勇，刘贻尧，吴国锋，潘育方，
申请(专利权)人：电子科技大学中山学院，中山市动物疫病预防控制中心中山市动物卫生技术中心，
类型：发明
国别省市：广东;44