一种检测艰难梭菌耐莫西沙星gyrA基因点突变的荧光PCR方法技术

本发明专利技术提供了一组用于荧光PCR引物和探针的多核苷酸以及一种检测艰难梭菌gyrA基因点突变的荧光PCR方法，使用所述荧光PCR方法单个反应即可以同时检测艰难梭菌莫西沙星耐药及敏感株的gyrA基因的点突变。本发明专利技术提供的方法简化了检测工作量，避免了通过扩增测序比对来获得gyrA基因点突变信息，缩短了检测时间；对于莫西沙星耐药艰难梭菌和莫西沙星敏感艰难梭菌的检测灵敏度均为10

【技术实现步骤摘要】
一种检测艰难梭菌耐莫西沙星gyrA基因点突变的荧光PCR方法
本专利技术公开了一组多核苷酸及在检测基因点突变中的应用，属于核苷酸应用领域。
技术介绍
艰难梭菌是抗生素相关性腹泻的重要病原，被美国CDC列为紧迫公共卫生威胁的第三位(参考文献：U.S.DepartmentofHealthandHumanServices,CDC,Antibioticresistancethreatsintheunitedstates2019)。BI/NAP1/RT027菌株引起北美、欧洲和澳洲的多起暴发流行，具有高水平喹诺酮耐药、毒素分泌和致死率(参考文献：DanielA.NEnglJMed2015；372:1539-48)。传统耐药菌株主要依赖药物敏感性检测的表型实验发现，如琼脂稀释、肉汤稀释和商品化的E-test条等。近年来，随着全基因组测序技术的普及，基于耐药基因分析来推测耐药表型已成为可能(参考文献：DavidWEyre,等.JAntimicrobChemother2017；72(7):1937-1947.NStoesser,等.JAntimicro本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一组用于荧光PCR引物和探针的多核苷酸，其特征在于，所述多核苷酸包括：序列如SEQ ID NO.1所示的上游引物Gyr-F，序列如SEQ ID NO.2所示的下游引物Gyr-R，序列如SEQID NO.3所示的探针P-ATT，序列如SEQ ID NO.4所示的探针P-ACT2。/n

【技术特征摘要】
1.一组用于荧光PCR引物和探针的多核苷酸，其特征在于，所述多核苷酸包括：序列如SEQIDNO.1所示的上游引物Gyr-F，序列如SEQIDNO.2所示的下游引物Gyr-R，序列如SEQIDNO.3所示的探针P-ATT，序列如SEQIDNO.4所示的探针P-ACT2。


2.根据权利要求1所述的多核苷酸，其特征在于，在所述探针P-ATT上标记第一荧光发光基团和荧光淬灭基因，在所述探针P-ACT2上标记第二荧光发光基团和荧光淬灭基因。


3.根据权利要求2所述的多核苷酸，其特征在于，在所述探针P-ATT的5’端标记第一荧光发光基团，在所述探针P-ATT的3’端标记荧光淬灭基因，在所述探针P-ACT2的5’端标记第二荧光发光基团，在所述探针P-ACT2的3’端标记荧光淬灭基因。


4.根据权利要求3所述的多核苷酸，其特征在于，所述第一荧光发光基团为VIC，所述第二荧光发光基团为FAM，所述荧光淬灭基团为MGB。

【专利技术属性】
技术研发人员：吴媛，卢金星，张文竹，李文革，王媛媛，贾筱溪，
申请(专利权)人：中国疾病预防控制中心传染病预防控制所，
类型：发明
国别省市：北京;11