本发明专利技术提出一组可以检测单基因遗传性心血管疾病的基因组合,该基因组合包括165个基因,涉及相关疾病7大类66种,涉及基因组合的检测位点的具体区域是基因的外显子部分。本发明专利技术还提出这个组合基因的应用方式是通过基因检测技术手段来检测基因,然后运用生物信息的分析的方法查看基因上是否存在致病性变异,之后依据现有研究报道的变异和疾病致病关系,帮助受疾病影响的患者找到致病基因,同时可以辅助医生制定治疗策略、评估预后和遗传咨询。
【技术实现步骤摘要】
单基因遗传性心血管疾病检测用的基因组合及应用
本专利技术涉及基因检测领域,具体涉及一种单基因遗传性心血管疾病检测用的基因组合及应用。
技术介绍
单基因遗传性心血管疾病是一类发病表型包括心血管损害的、由单个基因的致病突变就可引起的遗传性疾病。此类疾病发病后果严重,部分疾病不发病时症状隐匿不表现,发病会导致猝死等严重后果,疾病在家族中呈现聚集性发病,导致患者总数庞大,这使得此类疾病广泛受到医学研究的关注。随着现有研究的深入,越来越多的明确致病关系的基因被找到,如何将基因合理运用组合起来,如何使其切实、有效地应用,使得疾病影响人群受益最大化,是现有研究投入到实际应用的关键。外显子是真核生物DNA序列中可以被表达合成蛋白质的编码区,全部的外显子序列总长度占人类基因组的1%左右,但和人类85%的疾病相关。在研究疾病和基因的致病关系时,重点关注外显子区域是全面、高效且性价比极高的,目前外显子的研究应用范围广泛,方向可涉及遗传疾病检测、临床医学诊断等。2019年中国发改委将基因检测行业列入发展战略后,对行业的未来应用中就包括了心血管疾病的预防和检测。响应国家政策,近年来,遗传性心血管疾病基因检测产品被陆续开发出来,总体上来看,目前的产品存在检测病种单一、检测位点少的缺点,而且部分产品是针对多基因遗传病来设计的,而多基因遗传病的特点是多个微效基因的共同作用,加上环境影响而导致的疾病,这就会造成检测结果不准确、给受检者带来心理负担的问题。
技术实现思路
为解决上述问题,本专利技术提供一种单基因遗传性心血管疾病检测用的基因组合技术方案,所述基因组合用于检测人基因组DNA的165个基因,所述基因组合包括165个基因的全外显子区域内的所有位点。进一步优选的:所述165个基因请详见表1。进一步优选的:所述165个基因的全外显子区域位置和序列来源于NCBIGenome数据库(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/)。进一步优选的:所述基因组合的检测结果包括遗传性高血压、主动脉疾病、心脏离子通道病、心肌病、肺动脉疾病、遗传性易血栓及遗传性高胆固醇等七大类疾病的遗传风险评估。更详细的说:所述七大类疾病包含66种疾病,具体详见下表2;表2:七大类疾病包含66种疾病进一步优选的:所述基因组合的检测方法包括以下步骤:步骤一,从检测者上提取人基因组DNA;步骤二,对步骤一得到的人基因组DNA进行基因检测技术中的探针以捕获目标DNA序列;步骤三,对步骤二中的目标DNA序列进行数据分子,并利用所述的165个基因的全外显子区域内的所有位点对比,以获得变异基因结果,并将所述变异基因结果进行注释;步骤四,对步骤三种得到的注释信息进行筛选及分级,再将突变基因以报告的形式展示给受检者。上述的用于单基因遗传性心血管疾病遗传风险评估检测的基因组合的应用,其包括从遗传层面进行心血管疾的高位人群筛查、预防和临床心血管疾的辅助诊断。与现有技术相比,本专利技术具有以下优点:本专利技术所述的基因组合包括165个基因,该165个基因中各基因的检测外显子区域,而非单个突变位点,致使其覆盖面大,满足实际临床检测需要;另,本专利技术所述基因组合能检测七大类66种疾病,具有疾病种类多,且较为常见的优点,尤其是是针对于中国人体质及其遗传性特单的设计;综上所述,本专利技术还可用于对患者亲属或普通群体的疾病早期筛查和预防,进而降低或预防遗传性心血管疾病可引起的猝死概率。附图说明图1是本专利技术实施例2中所述探针捕获目标DNA上机测序的流程图;图2是本专利技术实施例2中所述数据分析流程图。具体实施方式本专利技术提出一组可以检测单基因遗传性心血管疾病的基因组合,该基因组合包括165个基因,涉及相关疾病7大类66种,涉及基因组合的检测位点的具体区域是基因的外显子部分。本专利技术还提出这个组合基因的应用方式是通过基因检测技术手段来检测基因,即:使用基因检测技术手段中的探针捕获目标DNA序列的方法,对单基因遗传性心脑血管疾病的患者进行疾病的辅助诊断,查找致病基因及位点(所述基因检测技术手段具体包括:试剂盒,探针、芯片检测等二代测序技术手段),然后运用生物信息的分析的方法查看基因上是否存在致病性变异,之后依据现有研究报道的变异和疾病致病关系(所述查找基因上的致病性变异的分类标准遵循ACMG变异分类指南),帮助受疾病影响的患者找到致病基因,同时可以辅助医生制定治疗策略、评估预后和遗传咨询。由于涉及相关疾病均为遗传性疾病,且会在家族中遗传,这些基因组合还可用于对患者亲属或普通群体的疾病早期筛查和预防;另,由于遗传性心血管疾病可引起猝死,这些基因组合还可以应用于对心源性猝死高危人群的早期筛查和预防,及猝死人群的死因检测。下面结合附图对本专利技术的具体实施方式做详细的说明。实施例1技术方案的确立本专利技术阐述的基因组合包括165个基因,涉及相关疾病7大类66种,涉及基因组合的检测位点的具体区域是基因的外显子部分,所述基因组合的检测方法包括以下步骤:步骤一,从检测者上提取人基因组DNA;步骤二,对步骤一得到的人基因组DNA进行基因检测技术中的探针以捕获目标DNA序列;步骤三,对步骤二中的目标DNA序列进行数据分子,并利用所述的165个基因的全外显子区域内的所有位点对比,以获得变异基因结果,并将所述变异基因结果进行注释;步骤四,对步骤三种得到的注释信息进行筛选及分级,再将突变基因以报告的形式展示给受检者。表1为单基因遗传性心血管疾病检测用的基因组合实施例2样本提取及分析:本专利技术使用基因检测技术手段中的探针捕获目标DNA序列的方法,对单基因遗传性心脑血管疾病的患者进行疾病的辅助诊断,查找致病基因及位点。步骤一:探针捕获目标DNA上机测序流程,图解见图1。本实施例使用的探针试剂盒从艾吉泰康生物科技(北京)有限公司定制,实验流程操作按照产品说明书中的基因组液相捕获实验全流程操作手册,实验中所提到的试剂均可在试剂公司得到。1)取患者亲属血液样本,提取DNA,使用BioruptorPico打断仪进行DNA打断。然后,将打断后的DNA样品完全转移至PCR管中,按如下表格1配置‘末端修复、3’端加“A”体系’反应体系,使用移液器吹打混匀(避免剧烈震荡混匀),将PCR管放回冰盒上备用;运行PCR程序,设置PCR仪参数如下:Heatlid85℃,4℃for1min,20℃for30min,65℃for30min,4℃for∞,等待程序完成。表格1:末端修复、3’端加“A”体系2)将adapter提前稀释成合适的浓度,在上述步骤1)反应的PCR管中,按如下表格2配置反应体系按照下2配置‘连接体系’,轻轻吸打混匀6次,避免产生气泡,然后短暂离心;运行PCR仪程序(要求无热盖),设置PCR仪参本文档来自技高网...
【技术保护点】
1.单基因遗传性心血管疾病检测用的基因组合,其特征在于:所述基因组合用于检测人基因组DNA的165个基因,所述基因组合包括165个基因的全外显子区域内的所有位点。/n
【技术特征摘要】
1.单基因遗传性心血管疾病检测用的基因组合,其特征在于:所述基因组合用于检测人基因组DNA的165个基因,所述基因组合包括165个基因的全外显子区域内的所有位点。
2.根据权利要求1所述的单基因遗传性心血管疾病检测用的基因组合,其特征在于:所述165个基因分别为:
。
3.根据权利要2所述的单基因遗传性心血管疾病检测用的基因组合,其特征在于:所述165个基因的全外显子区域位置和序列来源于NCBIGenome数据库。
4.根据权利要求1所述的单基因遗传性心血管疾病检测用的基因组合,其特征在于:所述基因组合的检测结果包括遗传性高血压、主动脉疾病、心脏离子通道病、心肌病、肺动脉疾病、遗传性易血栓及遗传性高胆固醇等七大类疾病的遗传风险评估...
【专利技术属性】
技术研发人员:陈洪亮,肖月,郑海灵,
申请(专利权)人:陈洪亮,
类型:发明
国别省市:福建;35
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