【技术实现步骤摘要】
一种肿瘤突变负荷的检测试剂盒及其检测方法和装置
本专利技术涉及生物信息
,具体而言,涉及一种肿瘤突变负荷的检测试剂盒及其检测方法和装置。
技术介绍
肿瘤突变负荷(TMB)是指每百万碱基(Mb)的肿瘤基因组区域中包含的肿瘤体细胞突变总数,是预测免疫治疗效果的全新的生物标志物,具有良好的应用前景。体细胞突变会改变蛋白序列,产生新抗原。这些新抗原被自身免疫系统识别为非自身抗原,激活T细胞,引起免疫反应,因此肿瘤突变负荷高时就会产生更多的抗原,有利于免疫系统杀死肿瘤细胞。很多研究已经证明肿瘤突变负荷与免疫治疗效果是显著相关的。TMB采用全外显子组测序方法,对照患者的正常组织和癌组织,找出癌细胞特有的体细胞突变。但是对癌组织和正常组织同时测序成本较高,检测周期长。鉴于此,特提出本专利技术。
技术实现思路
本专利技术的目的在于提供一种肿瘤突变负荷的检测试剂盒及其检测方法和装置。本专利技术是这样实现的:第一方面,实施例提供了一种肿瘤突变负荷的检测试剂盒,其包括有用于依次检测 ...
【技术保护点】
1.一种肿瘤突变负荷的检测试剂盒,其特征在于,其包括有用于依次检测OR1C1、OR4C3、GLYAT、OR4D11、WDR74、TMEM132C、OR4M2、DUSP22和MYCT1基因的启动子和/或其上游区域的核酸组合1~9。/n
【技术特征摘要】
1.一种肿瘤突变负荷的检测试剂盒,其特征在于,其包括有用于依次检测OR1C1、OR4C3、GLYAT、OR4D11、WDR74、TMEM132C、OR4M2、DUSP22和MYCT1基因的启动子和/或其上游区域的核酸组合1~9。
2.根据权利要求1所述的肿瘤突变负荷的检测试剂盒,其特征在于,核酸组合1的检测区域选自染色体1的第247758680~247761405位碱基的区域1;
优选地,核酸组合2的检测区域选自染色体11的第48322022~48325021位碱基的区域2;
优选地,核酸组合3的检测区域选自染色体11的第58731961~58734973位碱基的区域3;
优选地,核酸组合4的检测区域选自染色体11的第59500575~59503574位碱基的区域4;
优选地,核酸组合5的检测区域选自染色体11的第62840380~62843155位碱基的区域5;
优选地,核酸组合6的检测区域选自染色体12的第128264402~128268401位碱基的区域6;
优选地,核酸组合7的检测区域选自染色体15的第22077526~22080525位碱基的区域7;
优选地,核酸组合8的检测区域选自染色体6的第289100~292460位碱基的区域8;
优选地,核酸组合9的检测区域选自染色体6的第152694894~152697893位碱基的区域9。
3.根据权利要求2所述的肿瘤突变负荷的检测试剂盒,其特征在于,所述核酸组合1~9包括探针和/或引物对。
4.根据权利要求3所述的肿瘤突变负荷的检测试剂盒,其特征在于,所述核酸组合1包括探针1~23中的至少一个或多个的组合,探针1~23的碱基序列依次如SEQIDNo.1~23所示;
优选地,所述核酸组合2包括探针24~43中的至少一个或多个的组合,探针24~43的碱基序列依次如SEQIDNo.24~43所示;
优选地,所述核酸组合3包括探针44~65中的至少一个或多个的组合,探针44~65的碱基序列依次如SEQIDNo.44~65所示;
优选地,所述核酸组合4包括探针66~78中的至少一个或多个的组合,探针66~78的碱基序列依次如SEQIDNo.66~78所示;
优选地,所述核酸组合5包括探针79~92中的至少一个或多个的组合,探针79~92的碱基序列依次如SEQIDNo.79~92所示;
优选地,所述核酸组合6包括探针93~126中的至少一个或多个的组合,探针93~126的碱基序列依次如SEQIDNo.93~126所示;
优选地,所述核酸组合7包括探针127~150中的至少一个或多个的组合,探针127~150的碱基序列依次如SEQIDNo.127~150所示;
优选地,所述核酸组合8包括探针151~174中的至少一个或多个的组合,探针151~174的碱基序列依次如SEQIDNo.151~174所示;
优选地,所述核酸组合9包括探针175~193中的至少一个或多个的组合,探针175~193的...
【专利技术属性】
技术研发人员:李文斌,姚天然,钱志荣,郭蕾,
申请(专利权)人:中国医学科学院肿瘤医院,北斗生命科学广州有限公司,
类型:发明
国别省市:北京;11
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