一种骨髓增生异常综合征的评估方法及评估系统技术方案

本发明专利技术涉及一种骨髓增生异常综合征的评估方法，(1)采集年龄数据，采集IPSS评估系统所需数据，采集EVI1表达量数据，检测NRAS、SF3B1及TP53基因是否突变；(2)根据年龄数据为Age赋值；(3)根据IPSS评估系统的分组，为IPSS赋值；(4)根据EVI1表达量，为EVI1赋值；(5)根据TP53、NRAS、SF3B1基因是否突变，为TP53、NRAS、SF3B1赋值；(6)根据Age×0.8+IPSS×0.6+EVI1×0.2+TP53×1+NRAS×0.7+SF3B1×0.9计算结果；(7)根据计算结果进行分组。本发明专利技术评估相对全面和特异，为患者之后的治疗予以积极的指导，从而使患者获得相对良好的预后。另外，本发明专利技术的评估方法可以同时预测无事件生存。

An evaluation method and system of myelodysplastic syndrome

【技术实现步骤摘要】
一种骨髓增生异常综合征的评估方法及评估系统
本专利技术具体涉及一种骨髓增生异常综合征的评估方法及评估系统。
技术介绍
骨髓增生异常综合征(myelodysplasticsyndrome,MDS)是由遗传学异常驱动的克隆性造血干细胞或祖细胞性疾病，通常表现为全血细胞减少、病态造血及向白血病转化的高风险。细胞形态学和细胞遗传学异常是目前确立MDS诊断的主要参数。近年来，随着基因测序技术(尤其是二代测序技术)的快速发展和广泛应用，大多数MDS患者可检出基因突变，对MDS的诊断、治疗和预后评估等均将产生深远的影响。约90％的患者存在基因突变，超过50种基因突变与MDS的发病机制、转白机制、治疗反应和生存预后相关。EVI1表达量在MDS/AML疾病进展中亦有重要作用，基于MDS向白血病转化的高风险，目前国际上已有包括IPSS-R(theInternationalPrognosticScoringSystem-Revised)、IPSS(theInternationalPrognosticScoringSystem)和WPSS在内的多个预后积分系统用于MDS患者的预后风险评估，尤其是IPSS-R积分系统，对预后的评估作用明显优于另外两者。然而IPSS及IPSS-R预后均是结合患者初诊血象，骨髓原始细胞，核型异常因素对其预后评估；WPSS评估系统是结合输血与否，WHO诊断分型(主要依据骨髓原始细胞)及核型异常。目前国内外对MDS患者的预后评估以IPSS及IPSS-R积分系统为主，且这三种评估体系中以相对低危组(除高危及极高危以外)患者为主体，这部分患者目前国内外的治疗策略主要是观察和等待，可使用去甲基化药物小剂量化疗。然而这三种评估体系均没有涉及到患者初诊的年龄及基因组学的异常。而由于90％MDS患者可检出基因突变，对MDS的诊断、治疗和预后评估等均将产生深远的影响，对于处于IPSS或IPSS-R分层同一危险组别或不同组别的部分患者而言，基因突变可提供独立于IPSS-R系统的预后因子。另外年龄影响患者的克隆性造血，治疗反应等，在多个研究中均显示其独立IPSS、IPSS-R系统和基因突变的预后作用。评估系统在此的缺失必然影响部分患者在治疗前疾病评估的精准和个体化差异。
技术实现思路
本专利技术所要解决的技术问题是提供一种使MDS患者在初诊时治疗前疾病的评估相对全面和特异的评估方法及评估系统。为解决以上技术问题，本专利技术采用如下技术方案：本专利技术一方面提供一种骨髓增生异常综合征的评估方法，包括如下步骤：(1)采集年龄数据，采集IPSS评估系统所需数据，采集EVI1表达量数据，检测NRAS、SF3B1及TP53基因是否突变；(2)当步骤(1)采集的年龄数据<60岁时，则Age＝0，当步骤(1)采集的年龄数据≥60岁时，则Age＝0.6；(3)根据步骤(1)采集的IPSS评估系统所需数据以及IPSS评估系统进行积分分组，当所述的积分分组为低危时，IPSS＝0；当所述的积分分组为中危-1时，IPSS＝0.6；当所述的积分分组为中危-2时，IPSS＝1.2；当所述的积分分组为高危时，IPSS＝1.8；(4)当步骤(1)采集的所述的EVI1表达量<300拷贝/10000abl拷贝时，EVI1＝0；当步骤(1)采集的所述的EVI1表达量≥300拷贝/10000abl拷贝时，EVI1＝0.2；(5)当步骤(1)检测的TP53基因未发生突变时，TP53＝0；当步骤(1)检测的TP53基因发生突变时，TP53＝1；(6)当步骤(1)检测的NRAS基因未发生突变时，NRAS＝0；当步骤(1)检测的NRAS基因发生突变时，NRAS＝0.7；(7)当步骤(1)检测的SF3B1基因未发生突变时，SF3B1＝0；当步骤(1)检测的SF3B1基因发生突变时，SF3B1＝0.9；(8)将步骤(2)所得的Age数值、步骤(3)所得的IPSS数值、步骤(4)所得的EVI1数值、步骤(5)所得的TP53数值、步骤(6)所得的NRAS数值、步骤(7)所得的SF3B1数值代入如下公式进行计算，公式为：Age×0.8+IPSS×0.6+EVI1×0.2+TP53×1+NRAS×0.7+SF3B1×0.9；(9)根据步骤(8)的公式计算的结果进行分组，其中，计算结果<1.20为低危组；1.20≤计算结果≤3为中危组，计算结果≥3为高危组。进一步地，根据所述的评估方法所得的分组推荐治疗方案，当所述的分组为低危组时，推荐观察和等待或者给予小剂量去甲基化剂量治疗；当所述的分组为中危组或高危组时，推荐积极的化疗或移植。优选地，步骤(1)中EVI1表达量数据通过RT-PCR检测。本专利技术的另一方面是提供一种用于报告骨髓增生异常综合征的风险的评估系统，所述的评估系统包括：(a)被配置为接收数据输入的至少一个存储器单元，所述的数据输入包含来自受试者的年龄，IPSS评估系统分组数据，EVI1表达量，NRAS、SF3B1及TP53基因是否突变；(b)与所述的存储器单元可操作地耦合的计算机处理器，其中，所述的计算机处理器被编程为(ⅰ)当输入的年龄数据<60岁时，则为Age赋值为0，当输入的年龄数据≥60岁时，则为Age赋值为0.6；(ⅱ)当输入的IPSS评估系统分组为低危时，为IPSS赋值为0；当输入的IPSS评估系统分组为中危-1时，为IPSS赋值为0.6；当输入的IPSS评估系统分组为中危-2时，为IPSS赋值为1.2；当输入的IPSS评估系统分组为高危时，为IPSS赋值为1.8；(ⅲ)当输入的EVI1表达量<300拷贝/10000abl拷贝时，为EVI1赋值为0；当输入的EVI1表达量≥300拷贝/10000abl拷贝时，为EVI1赋值为0.2；(ⅳ)当输入的TP53基因未发生突变时，为TP53赋值为0；当输入的TP53基因发生突变时，为TP53赋值为1；(ⅴ)当输入的NRAS基因未发生突变时，为NRAS赋值为0；当输入的NRAS基因发生突变时，为NRAS赋值为0.7；(ⅵ)当输入的SF3B1基因未发生突变时，为SF3B1赋值为0；当输入的SF3B1基因发生突变时，为SF3B1赋值为0.9；(ⅶ)将Age、IPSS、EVI1、TP53、NRAS、SF3B1所赋值代入公式为Age×0.8+IPSS×0.6+EVI1×0.2+TP53×1+NRAS×0.7+SF3B1×0.9进行计算得到计算结果；以及(ⅷ)生成输出，其中，当计算结果<1.20时，则输出为低危组；当1.20≤计算结果≤3时，则输出为中危组；当计算结果≥3时，则输出为高危组。进一步地，所述的输出还包括根据所述输出的分组推荐的治疗方案，其中，当所述的分组为低危组时，推荐观察和等待或者给予小剂量去甲基化剂量治疗；当所述的分组为中危组或高危组时，推荐积极的化疗或移植。进一步地，所述的评估系统还包括将所述的输出递送至用户界面进行本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种骨髓增生异常综合征的评估方法，其特征在于：包括如下步骤：/n(1)采集年龄数据，采集IPSS评估系统所需数据，采集EVI1表达量数据，检测NRAS、SF3B1及TP53基因是否突变；/n(2)当步骤(1)采集的年龄数据<60岁时，则Age＝0，当步骤(1)采集的年龄数据≥60岁时，则Age＝0.6；/n(3)根据步骤(1)采集的IPSS评估系统所需数据以及IPSS评估系统进行积分分组，当所述的积分分组为低危时，IPSS＝0；当所述的积分分组为中危-1时，IPSS＝0.6；当所述的积分分组为中危-2时，IPSS＝1.2；当所述的积分分组为高危时，IPSS＝1.8；/n(4)当步骤(1)采集的所述的EVI1表达量<300拷贝/10000abl拷贝时，EVI1＝0；当步骤(1)采集的所述的EVI1表达量≥300拷贝/10000abl拷贝时，EVI1＝0.2；/n(5)当步骤(1)检测的TP53基因未发生突变时，TP53＝0；当步骤(1)检测的TP53基因发生突变时，TP53＝1；/n(6)当步骤(1)检测的NRAS基因未发生突变时，NRAS＝0；当步骤(1)检测的NRAS基因发生突变时，NRAS＝0.7；/n(7)当步骤(1)检测的SF3B1基因未发生突变时，SF3B1＝0；当步骤(1)检测的SF3B1基因发生突变时，SF3B1＝0.9；/n(8)将步骤(2)所得的Age数值、步骤(3)所得的IPSS数值、步骤(4)所得的EVI1数值、步骤(5)所得的TP53数值、步骤(6)所得的NRAS数值、步骤(7)所得的SF3B1数值代入如下公式进行计算，公式为：Age×0.8+IPSS×0.6+EVI1×0.2+TP53×1+NRAS×0.7+SF3B1×0.9；/n(9)根据步骤(8)的公式计算的结果进行分组，其中，计算结果<1.20为低危组；1.20≤计算结果≤3为中危组，计算结果≥3为高危组。/n...

【技术特征摘要】
1.一种骨髓增生异常综合征的评估方法，其特征在于：包括如下步骤：
(1)采集年龄数据，采集IPSS评估系统所需数据，采集EVI1表达量数据，检测NRAS、SF3B1及TP53基因是否突变；
(2)当步骤(1)采集的年龄数据<60岁时，则Age＝0，当步骤(1)采集的年龄数据≥60岁时，则Age＝0.6；
(3)根据步骤(1)采集的IPSS评估系统所需数据以及IPSS评估系统进行积分分组，当所述的积分分组为低危时，IPSS＝0；当所述的积分分组为中危-1时，IPSS＝0.6；当所述的积分分组为中危-2时，IPSS＝1.2；当所述的积分分组为高危时，IPSS＝1.8；
(4)当步骤(1)采集的所述的EVI1表达量<300拷贝/10000abl拷贝时，EVI1＝0；当步骤(1)采集的所述的EVI1表达量≥300拷贝/10000abl拷贝时，EVI1＝0.2；
(5)当步骤(1)检测的TP53基因未发生突变时，TP53＝0；当步骤(1)检测的TP53基因发生突变时，TP53＝1；
(6)当步骤(1)检测的NRAS基因未发生突变时，NRAS＝0；当步骤(1)检测的NRAS基因发生突变时，NRAS＝0.7；
(7)当步骤(1)检测的SF3B1基因未发生突变时，SF3B1＝0；当步骤(1)检测的SF3B1基因发生突变时，SF3B1＝0.9；
(8)将步骤(2)所得的Age数值、步骤(3)所得的IPSS数值、步骤(4)所得的EVI1数值、步骤(5)所得的TP53数值、步骤(6)所得的NRAS数值、步骤(7)所得的SF3B1数值代入如下公式进行计算，公式为：Age×0.8+IPSS×0.6+EVI1×0.2+TP53×1+NRAS×0.7+SF3B1×0.9；
(9)根据步骤(8)的公式计算的结果进行分组，其中，计算结果<1.20为低危组；1.20≤计算结果≤3为中危组，计算结果≥3为高危组。


2.根据权利要求1所述的骨髓增生异常综合征的评估方法，其特征在于：根据所述的评估方法所得的分组推荐治疗方案，当所述的分组为低危组时，推荐观察和等待或者给予小剂量去甲基化剂量治疗；当所述的分组为中危组或高危组时，推荐积极的化疗或移植。


3.根据权利要求1所述的骨髓增生异常综合征的评估方法，其特征在于：步骤(1)中EVI1表达量数据通过RT-PCR检测。...

【专利技术属性】
技术研发人员：喻艳，孙爱宁，陈苏宁，曾招，文丽君，王琴荣，张彤彤，徐溢，
申请(专利权)人：苏州大学，
类型：发明
国别省市：江苏;32