ceRNA竞争模块识别方法、装置、电子设备及存储介质制造方法及图纸

本发明专利技术提供一种ceRNA竞争模块识别方法、装置、电子设备及存储介质，涉及基因识别领域。该ceRNA竞争模块识别方法包括：分别根据RNA

【技术实现步骤摘要】
ceRNA竞争模块识别方法、装置、电子设备及存储介质
本专利技术涉及基因识别
，具体而言，涉及一种ceRNA竞争模块识别方法、装置、电子设备及存储介质。
技术介绍
微小核糖核酸(MicroRibonucleicAcid，miRNA)是一类非编码小核糖核酸(RibonucleicAcid，RNA)分子。miRNA主要通过负调控靶基因来影响靶基因的表达水平。然而，根据内源竞争RNA(competingendogenousRNA，ceRNA)假说，共享miRNA反应元件(miRNAresponseelements，MREs)的靶基因也可以通过相互竞争的方式来影响各自的基因表达水平。这些共享相同MREs又构成竞争关系的靶基因(包括编码基因和非编码基因)统称为ceRNA或miRNA海绵。现有技术中，申请号为CN201910684738.7的申请方案中提供了一种miRNA海绵模块的识别方法和装置，可以识别ceRNA外部竞争模块。ceRNA模块的竞争方式分为内部竞争和外部竞争两种方式。ceRNA外部竞争模块为不同类型RNA分子模本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种ceRNA竞争模块识别方法，其特征在于，包括：/n分别根据核糖核酸RNA

【技术特征摘要】
1.一种ceRNA竞争模块识别方法，其特征在于，包括：
分别根据核糖核酸RNA1的表达矩阵和RNA2的表达矩阵获取所述RNA1基因模块和所述RNA2基因模块，其中，所述RNA1和所述RNA2为微小核糖核酸miRNA靶基因；
根据先验的miRNA-靶基因调控关系数据、miRNA表达矩阵、所述RNA1基因模块和所述RNA2基因模块，识别得到满足条件的ceRNA竞争模块，其中，所述ceRNA竞争模块包括内部竞争模块和外部竞争模块。


2.如权利要求1所述的方法，其特征在于，根据先验的miRNA-靶基因调控关系数据、miRNA表达矩阵、所述RNA1基因模块和所述RNA2基因模块，识别得到满足条件的内部竞争模块，包括：
分别获取RNA1-RNA1模块和RNA2-RNA2模块的共享miRNAs显著性值、典型相关系数值、敏感典型相关系数值；
若所述RNA1-RNA1模块和所述RNA2-RNA2模块的所述共享miRNAs显著性值小于第一阈值，所述典型相关系数值大于第二阈值，所述敏感典型相关系数值大于第三阈值，则确认所述RNA1-RNA1模块和所述RNA2-RNA2模块分别为所述RNA1-RNA1内部竞争模块和所述RNA2-RNA2内部竞争模块。


3.如权利要求1所述的方法，其特征在于，根据先验的miRNA-靶基因调控关系数据、miRNA表达矩阵、所述RNA1基因模块和所述RNA2基因模块，识别得到满足条件的外部竞争模块，包括：
分别获取RNA1-RNA2模块的共享miRNAs显著性值、典型相关系数值、敏感典型相关系数值；
若所述RNA1-RNA2模块的所述共享miRNAs显著性值小于第一阈值，所述典型相关系数值大于第二阈值，所述敏感典型相关系数值大于第三阈值，则确认所述RNA1-RNA2模块为所述RNA1-RNA2外部竞争模块。


4.如权利要求1-3任一所述的方法，其特征在于，在识别得到满足条件的ceRNA竞争模块之后，还包括：
获取所述ceRNA竞争模块与目标疾病的评估结果。


5.一种ceRNA竞争模块识别装置，其特征在于，包括：
获取模...

【专利技术属性】
技术研发人员：张俊鹏，饶妮妮，王光斌，
申请(专利权)人：电子科技大学，大理大学，
类型：发明
国别省市：四川;51