【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】使用热塑性硅石纳米材料进行尺寸选择纯化相关申请的交叉引用本申请要求于2017年6月30日提交的美国临时专利申请第62/527,659号的权益,并依赖该申请的提交日期,其全部公开内容通过引用并入本文。
技术介绍
近年来,第三代测序技术彻底改变了我们对基因组的结构-功能和参考组装准确性的理解。PacificBiosciences1(MenloPark,CA)、OxfordNanoporeTechnologiesLimited2(Oxford,UnitedKingdom)、10XGenomics3(Pleasanton,CA)和BioNanoGenomics4(SanDiego,CA)取得了变革性进展,这引起了人们对最高质量的高分子量(HMW)DNA以及有效处理它的新技术产生的新的需求。但是,用于处理和分析HMWDNA的绝大多数技术,例如脉冲的场凝胶电泳(PFGE)、沉淀和凝胶塞提取(gelplugextraction)以及透析纯化,最初是在分子生物学的初期发展的,并且非常缓慢且繁琐。大多数长读段(long-read)测序技术的文库准备 ...
【技术保护点】
1.一种用于纯化含核酸的样品以获得分离的所需尺寸范围的核酸的方法,包括:/na.将含核酸的样品与结合缓冲液混合以提供结合混合物;/nb.使所述结合混合物与纳米膜接触,其中所述纳米膜结合所述结合混合物中的核酸;/nc.在所述核酸与所述纳米膜结合之前、期间或之后,基于尺寸选择所述核酸;以及/nd.从其余样品中分离结合的核酸。/n
【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】20170630 US 62/527,6591.一种用于纯化含核酸的样品以获得分离的所需尺寸范围的核酸的方法,包括:
a.将含核酸的样品与结合缓冲液混合以提供结合混合物;
b.使所述结合混合物与纳米膜接触,其中所述纳米膜结合所述结合混合物中的核酸;
c.在所述核酸与所述纳米膜结合之前、期间或之后,基于尺寸选择所述核酸;以及
d.从其余样品中分离结合的核酸。
2.根据权利要求1所述的方法,其中步骤c)包括在核酸结合后洗涤所述纳米膜以选择性地去除特定尺寸范围的核酸。
3.根据权利要求1所述的方法,其中步骤c)包括选择性地结合特定尺寸范围的核酸。
4.根据权利要求1所述的方法,其中步骤c)包括选择性地洗脱特定尺寸范围的结合的核酸。
5.根据权利要求1所述的方法,其中步骤c)包括在步骤a之前沉淀特定尺寸的核酸。
6.根据权利要求1所述的方法,其中步骤c)包括在核酸结合期间沉淀特定尺寸的核酸。
7.根据权利要求1所述的方法,其中步骤c)包括在洗脱之后沉淀特定尺寸的核酸。
8.根据权利要求1所述的方法,其中所述所需尺寸范围的核酸结合至所述纳米膜。
9.根据权利要求1所述的方法,其中所述所需尺寸范围的核酸不结合至所述纳米膜。
10.根据权利要求2所述的方法,其中所述纳米膜包括硅石纳米膜,并且所述方法包括:
a.使洗涤溶液与所述硅石纳米膜接触,以及
b.除去与所述硅石纳米膜接触的洗涤溶液。
11.根据权利要求1所述的方法,其中核酸的所述所需尺寸范围包括大于截留值的所有尺寸。
12.根据权利要求1所述的方法,其中核酸的所述所需尺寸范围包括小于截留值的所有尺寸。
13.根据权利要求1所述的方法,其中核酸的所述所需尺寸范围是大于下限截留值和小于上限截留值的尺寸范围带。
14.根据权利要求1所述的方法,其中通过两个或更多个顺序的纯化步骤产生特定尺寸带的核酸。
15.根据权利要求1所述的方法,其中步骤c)包括组合使用或顺序使用的两个或更多个尺寸选择步骤。
16.根据权利要求1所述的方法,其中从单个含核酸的样品中产生包含核酸尺寸大于截留值的第一洗脱物以及包含核酸尺寸小于截留值的第二洗脱物。
17.根据前述权利要求中任一项所述的方法,其中蛋白质与所述核酸共纯化。
18.根据前述权利要求中任一项所述的方法,其中通过至少一个结合条件确定选择性结合特定尺寸范围的核酸,其中所述至少一个结合条件选自由以下组成的组:
a.pH,
b.盐的浓度,
c.存在或不存在离液盐,
d.存在或不存在一价盐和/或二价盐,
e.醇的类型和浓度,
f.分子拥挤剂的浓度,
g.分子拥挤剂的类型和分子量,
h.结合时间,
i.结合期间的温度
j.存在或不存在变性剂,
k.存在或不存在多胺,
l.存在或不存在其他添加剂分子,
m.缓冲液的体积,
n.结合期间管的运动,例如涡旋、离心、摇动、旋转,
o.纳米膜的尺寸,
p.纳米膜的形状,
q.纳米膜的3D构型,
r.纳米膜的数量,以及
s.它们的组合。
19.根据前述...
【专利技术属性】
技术研发人员:K·JF·刘,J·D·基尔伯恩,J·M·伯克,
申请(专利权)人:赛库乐米克斯公司,
类型:发明
国别省市:美国;US
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