一种鉴定辣椒品种真实性的方法及其专用SSR引物组合技术

本发明专利技术属于分子标记及其检测领域，具体涉及一种鉴定辣椒品种真实性的方法及其专用SSR引物组合。鉴定辣椒品种真实性的SSR位点，根据辣椒的参考基因组Capsicum.annuum.L与40份种质资源全基因组重测序数据进行数据挖掘所获得；上述SSR引物组合选自：第一SSR引物对至第二十二SSR引物对，分别用于PCR扩增上述第一SSR位点至第二十二SSR位点，分别优选为与序列表中的SEQ ID NO：1‑44的核苷酸序列的同源性为85％‑100％的核苷酸序列。本发明专利技术可用于对辣椒品种进行自种子开始的全生命周期的真实性鉴定，并为辣椒种质资源和新品种保护提供技术支持。

A method to identify the authenticity of pepper varieties and its special SSR primer combination

【技术实现步骤摘要】
一种鉴定辣椒品种真实性的方法及其专用SSR引物组合
本专利技术属于分子标记及其检测领域，具体涉及一种鉴定辣椒品种真实性的方法及其专用SSR引物组合。
技术介绍
辣椒是木兰纲，茄科辣椒属的植物，适于生食，烹饪，及作为调味品使用，是全世界种植最广泛，食用最广的作物，本种起源于墨西哥到哥伦比亚，后引种到全世界广泛栽培。由于辣椒栽培的广泛性及其食用的普适性，辣椒是一种极为受到人类喜爱的植物，由于全世界各地对辣椒的实际需求存在一定差异，故而辣椒的育种方向也是千头万绪繁复无穷的，同时由于其所能产生的经济利益丰厚，故而造成的现状就是市场上的辣椒品种几乎难以计数。2017年开始我国实行《农作物新品种登记保护制度》，截止到2019年底，登记的辣椒品种超过4000份，这对我国农作物品种审定管理工作提出了极其严峻的考验，如何快速有效的对辣椒品种进行鉴定成了一个亟待解决的问题。辣椒品种真实性鉴定的问题一直存在，由于其本身品种的数量就很庞大，故而早已引入分子标记鉴定手段。但是由于之前的SSR分子鉴定技术是基于少量品种开发的，同时没有基因组数据支持，其鉴别本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.鉴定辣椒品种真实性的SSR位点，所述SSR位点选自如下第一SSR位点到第二十二SSR位点中的任1到22种：/n第一SSR位点，位于辣椒参考基因组第3染色体第37196662-37196880位，或其种间同源基因组片段；/n第二SSR位点，位于辣椒参考基因组第4染色体第9461660-9461928位，或其种间同源基因组片段；/n第三SSR位点，位于辣椒参考基因组第4染色体第13136291-13136448位，或其种间同源基因组片段；/n第四SSR位点，位于辣椒参考基因组第5染色体第32758554-32758739位，或其种间同源基因组片段；/n第五SSR位点，位于辣椒参考基因组第5染色...

【技术特征摘要】
1.鉴定辣椒品种真实性的SSR位点，所述SSR位点选自如下第一SSR位点到第二十二SSR位点中的任1到22种：
第一SSR位点，位于辣椒参考基因组第3染色体第37196662-37196880位，或其种间同源基因组片段；
第二SSR位点，位于辣椒参考基因组第4染色体第9461660-9461928位，或其种间同源基因组片段；
第三SSR位点，位于辣椒参考基因组第4染色体第13136291-13136448位，或其种间同源基因组片段；
第四SSR位点，位于辣椒参考基因组第5染色体第32758554-32758739位，或其种间同源基因组片段；
第五SSR位点，位于辣椒参考基因组第5染色体第208120671-208120969位，或其种间同源基因组片段；
第六SSR位点，位于辣椒参考基因组第6染色体第194333083-194333311位，或其种间同源基因组片段；
第七SSR位点，位于辣椒参考基因组第7染色体第204507520-204507743位，或其种间同源基因组片段；
第八SSR位点，位于辣椒参考基因组第9染色体第173948946-173949110位，或其种间同源基因组片段；
第九SSR位点，位于辣椒参考基因组第10染色体第118282068-118282357位，或其种间同源基因组片段；
第十SSR位点，位于辣椒参考基因组第11染色体第163975350-163975616位，或其种间同源基因组片段；
第十一SSR位点，位于辣椒参考基因组第12染色体第63723425-63723524位，或其种间同源基因组片段；
第十二SSR位点，位于辣椒参考基因组第8染色体第130825854-130826103位，或其种间同源基因组片段；
第十三SSR位点，位于辣椒参考基因组第10染色体第197117583-197117732位，或其种间同源基因组片段；
第十四SSR位点，位于辣椒参考基因组第2染色体第110132463-110132662位，或其种间同源基因组片段；
第十五SSR位点，位于辣椒参考基因组未定位的染色体第
146789152-146789252位，或其种间同源基因组片段；
第十六SSR位点，位于辣椒参考基因组第4染色体第213298719-213298732位，或其种间同源基因组片段；
第十七SSR位点，位于辣椒参考基因组第10染色体第33073195-33073206位，或其种间同源基因组片段；
第十八SSR位点，位于辣椒参考基因组第9染色体第107586969-107586980位，或其种间同源基因组片段；
第十九SSR位点，位于辣椒参考基因组第9染色体第107585342-107585353位，或其种间同源基因组片段；
第二十SSR位点，位于辣椒参考基因组第4染色体第36880157-36880168位，或其种间同源基因组片段；
第二十一SSR位点，位于辣椒参考基因组第7染色体第215759919-215759930位，或其种间同源基因组片段；
第二十二SSR位点，位于辣椒参考基因组第5染色体第214376146-214376155位，或其种间同源基因组片段；
所述辣椒参考基因组为Capsicum.annuum.L。


2.鉴定辣椒品种真实性的SSR引物组，所述SSR引物组用于分别扩增如权利要求1所述的SSR位点，所述SSR引物组包括：
第一SSR引物对，用于扩增所述第一SSR位点；
第二SSR引物对，用于扩增所述第二SSR位点；
第三SSR引物对，用于扩增所述第三SSR位点；
第四SSR引物对，用于扩增所述第四SSR位点；
第五SSR引物对，用于扩增所述第五SSR位点；
第六SSR引物对，用于扩增所述第六SSR位点；
第七SSR引物对，用于扩增所述第七SSR位点；
第八SSR引物对，用于扩增所述第八SSR位点；
第九SSR引物对，用于扩增所述第九SSR位点；
第十SSR引物对，用于扩增所述第十SSR位点；
第十一SSR引物对，用于扩增所述第十一SSR位点；
第十二SSR引物对，用于扩增所述第十二SSR位点；
第十三SSR引物对，用于扩增所述第十三SSR位点；
第十四SSR引物对，用于扩增所述第十四SSR位点；
第十五SSR引物对，用于扩增所述第十五SSR位点；
第十六SSR引物对，用于扩增所述第十六SSR位点；
第十七SSR引物对，用于扩增所述第十七SSR位点；
第十八SSR引物对，用于扩增所述第十八SSR位点；
第十九SSR引物对，用于扩增所述第十九SSR位点；
第二十二SSR引物对，用于扩增所述第二十二SSR位点。


3.根据权利要求2所述SSR引物组，其特征在于：
所述第一SSR引物对，与序列表中的SEQIDNO：1和SEQIDNO：2的核苷酸序列的同一性大于等于85％、90％、95％、96％、97％、98％或99％，优选为100％；
所述第二SSR引物对，与序列表中的SEQIDNO：3和SEQIDNO：4的核苷酸序列的同源性大于等于85％、90％、95％、96％、97％、98％或99％，优选为100％；
所述第三SSR引物对，与序列表中的SEQIDNO：5和SEQIDNO：6的核苷酸序列的同源性大于等于85％、90％、95％、96％、97％、98％或99％，优选为100％；
所述第四SSR引物对，与序列表中的SEQIDNO：7和SEQIDNO：8的核苷酸序列的同源性大于等于85％、90％、95％、96％、97％、98％或99％，优选为100％；
所述第五SSR引物对，与序列表中的SEQIDNO：9和SEQIDNO：10的核苷酸序列的同源性大于等于85％、90％、95％、96％、97％、98％或99％，优选为100％；
所述第六SSR引物对，与序列表中的SEQIDNO：11和SEQIDNO：12的核苷酸序列的同源性大于等于85％、90％、95％、96％、97％、98％或99％，优选为100％；
所述第七SSR引物对，与序列表中的SEQIDNO：13和SEQIDNO：14的核苷酸序列的同源性大于等于85％、90％、95％、96％、97％、98％或99％，优选为100％；
所述第八SSR引物对，与序列表中的SEQIDNO：15和SEQIDNO：16的核苷酸序列的同源性大于等于85％、90％、95％、96％、97％、98％或99％，优选为100％；
所述第九SSR引物对，与序列表中的SEQIDNO：17和SEQIDNO：18的核苷酸序列的同源性大于等于85％、90％、95％、96％、97％、98％或99％，优选为100％；
所述第十SSR引物对，与序列表中的SEQIDNO：19和SEQIDNO：20的核苷酸序列的同源性大于等于85％、90％、95％、96％、97％、98％或99％，优选为100％；
所述第十一SSR引物对，与序列表中的SEQIDNO：21和SEQIDNO：22的核苷酸序列的同源性大于等于85％、90％、95％、96％、97％、98％或99％，优选为100％；
所述第十二SSR引物对，与序列表中的SEQIDNO：23和SEQIDNO：24的核苷酸序列的同源性大...

【专利技术属性】
技术研发人员：温常龙，杜和山，杨静静，张建，罗江，
申请(专利权)人：北京市农林科学院，
类型：发明
国别省市：北京;11