测序数据存储方法、装置、设备及计算机可读存储介质制造方法及图纸

技术编号:24462415 阅读:24 留言:0更新日期:2020-06-10 17:24
本发明专利技术公开了一种测序数据存储方法,该方法包括以下步骤:对接收到的测序处理项目请求进行解析,得到待测序处理项目中各分业务的业务处理顺序信息;分别获取各分业务对应的测序下机数据;按照业务处理顺序信息分别将各分业务对应的测序下机数据发送到对应的第一级存储或第二级存储中进行处理操作,输出处理结果;将各处理结果和对应的各测序下机数据发送到第三级存储;其中,第一级存储的性能高于第二级存储,且第二级存储的性能高于第三级存储。应用本发明专利技术实施例所提供的技术方案,较大地提升了测序数据的处理效率。本发明专利技术还公开了一种测序数据存储装置、设备及存储介质,具有相应技术效果。

Sequencing data storage method, device, equipment and computer readable storage medium

【技术实现步骤摘要】
测序数据存储方法、装置、设备及计算机可读存储介质
本专利技术涉及存储
,特别是涉及一种测序数据存储方法、装置、设备及计算机可读存储介质。
技术介绍
测序即测定DNA、RNA序列的技术,一般叫做基因测序技术。具体来讲,是指用双脱氧链末端终止法或化学降解法分析特定序列片段的碱基,并最终获得片段的碱基序列信息。测序数据处理泛指从测序仪得到测序数据后,对测序数据的一系列存储、管理、分析等所有操作步骤。具体有测序数据的存储、数据过滤与质量控制、序列比对、序列组装、排序、去重复、突变检测、结构变异检测、基因注释等操作步骤。新一代测序的发展和推广应用使生物序列数据增长迅速。研究人员将深入分析各种基因组数据的特点,针对性地研究高效数据压缩和传输的方法,研究新型的数据存储系统构架。研究在压缩空间上进行数据处理的方法,将存储、压缩和处理、应用结合起来考虑,发展适应超大规模基因组数据的搜索方法。探索新的软硬件模型和可能的新型体系结构,探索新的计算服务模型在测序数据存储、传输和处理上的应用。现有的对测序数据的存储是对测序数据进行统一存储,影响测序数据的处本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种测序数据存储方法,其特征在于,包括:/n对接收到的测序处理项目请求进行解析,得到待测序处理项目中各分业务的业务处理顺序信息;/n分别获取各所述分业务对应的测序下机数据;/n按照所述业务处理顺序信息分别将各所述分业务对应的测序下机数据发送到对应的第一级存储或第二级存储中进行处理操作,输出处理结果;/n将各所述处理结果和对应的各所述测序下机数据发送到第三级存储;/n其中,所述第一级存储的性能高于所述第二级存储,且所述第二级存储的性能高于所述第三级存储。/n

【技术特征摘要】
1.一种测序数据存储方法,其特征在于,包括:
对接收到的测序处理项目请求进行解析,得到待测序处理项目中各分业务的业务处理顺序信息;
分别获取各所述分业务对应的测序下机数据;
按照所述业务处理顺序信息分别将各所述分业务对应的测序下机数据发送到对应的第一级存储或第二级存储中进行处理操作,输出处理结果;
将各所述处理结果和对应的各所述测序下机数据发送到第三级存储;
其中,所述第一级存储的性能高于所述第二级存储,且所述第二级存储的性能高于所述第三级存储。


2.根据权利要求1所述的测序数据存储方法,其特征在于,按照所述业务处理顺序信息分别将各所述分业务对应的测序下机数据发送到对应的第一级存储或第二级存储中进行处理操作,包括:
分别获取各所述分业务的业务属性信息;
根据各所述业务属性信息分别判断各所述分业务的处理操作是否需进行数据索引;
若是,则按照所述业务处理顺序信息,分别将需进行数据索引的各所述分业务对应的预先发送到所述第二级存储的测序下机数据调整到所述第一级存储的数据处理分区中进行处理操作;其中,所述第一级存储的数据存储分区中预存有包含参考基因组数据和数据库数据的待索引数据;
若否,则按照所述业务处理顺序信息,分别将不需进行数据索引的各所述分业务对应的测序下机数据发送到所述第二级存储中进行处理操作。


3.根据权利要求1或2所述的测序数据存储方法,其特征在于,将各所述处理结果发送到第三级存储,包括:
在各所述分业务处理过程中,将各所述处理结果暂存至所述第一级存储;
当存在分业务处理完成时,将处理完成的所述分业务对应的处理结果迁移至所述第二级存储;
当检测到所述待测序处理项目中各所述分业务均处理完成时,将各所述处理结果从所述第二级存储迁移到所述第三级存储。


4.根据权利要求3所述的测序数据存储方法,其特征在于,分别获取各所述分业务对应的测序下机数据,包括:
通过IB网络分别获取各所述分业务对应的测序下机数据;
按照所述业务处理顺序信息分别将各所述分业务对应的测序下机数据发送到对应的第一级存储或第二级存储中进行处理操作,输出处理结果,包括:
按照所述业务处理顺序信息分别将各所述分业务对应的测序下机数据通过IB网络发送到对应的第一级存储或第二级存储中进行处理操作,输出处理结果;
将各所述处理结果和对应的各所述测序下机数据发送到第三级存储,包括:
通过IB网络将各所述处理结果和对应的各所述测序下机数据发送到第三级存储。


5.一种测序数据存储装置,其特征在于,包括:
处理顺序获得模块,用于对接收到的测序处理项目请求进行解析,得到待测序处理项目中各分业务的业务处理顺序信息;
下机数据获取...

【专利技术属性】
技术研发人员:崔坤磊刘羽张敏杨振宇于占乐李龙翔王倩
申请(专利权)人:苏州浪潮智能科技有限公司
类型:发明
国别省市:江苏;32

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