一种用于检测肝肿瘤良恶性程度的分级模型及其应用制造技术

本发明专利技术涉及一种用于检测肝肿瘤的分级模型及其应用，所述模型通过计算印记基因缺失表达量、印记基因拷贝数异常表达量和印记基因总表达量对印记基因在肝肿瘤中的变化进行分级。本发明专利技术所述检测模型和装置，以直观的方法表现了印记缺失在肝肿瘤病人的组织和细胞样本上的表现，通过对印记基因原位标记的方法，客观、直观、早期、精确地检测出印记(迹)基因的变化，并可以提供量化的模型，为肝肿瘤的诊断做出巨大贡献。

A grading model for detecting the benign and malignant degree of liver tumor and its application

【技术实现步骤摘要】
一种用于检测肝肿瘤良恶性程度的分级模型及其应用
本专利技术涉及生物
，涉及基因诊断领域，涉及一种分级模型及其应用，涉及一种用于检测肝肿瘤良恶性程度的分级模型及其应用，具体涉及一组印记基因在检测肝肿瘤良恶性程度中的分级模型及其组成的装置。
技术介绍
肝癌是一种恶性程度很高的恶性肿瘤，全球每年新增肝癌患者78.2万，发病率为癌症中的第五位，但每年死亡74.5万，是仅次于肺癌的第二大杀手。东亚和东南亚地区是肝癌的高发区域，中国每年新增肝癌患者46.6万，死亡42.1万，均占全球的一半以上。肝癌患者的5年生存率普遍较低，只有欧美和日本等少数发达国家超过20％，中国的肝癌5年生存率仅有14.5％，主要原因是肝癌具有极高的复发率。但是如果能够在早期发现肝癌，并及时切除或进行肝移植，5年生存率可以达到60％-70％，因此早期诊断对挽救肝癌患者的生命具有重要意义。早期肝癌通常没有明显的症状，约70％的肝癌患者在确诊时已经是中晚期。目前肝癌的早期检测手段主要是B超、CT和血清甲胎蛋白(AFP)检测，但是早期肝癌在B超和CT影像上与肝硬化结节非常相似，同时早本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种用于肝肿瘤的印记基因分级模型，其特征在于，所述模型通过计算印记基因的总表达量、印记基因缺失表达量和印记基因拷贝数异常表达量在肝肿瘤中的变化对印记基因的表达状态进行分级；/n其中，所述印记基因为Z1、Z4、Z13或Z16中的任意一个或至少两个的组合，所述印记基因Z1为Gnas，所述印记基因Z4为Igf2r，所述印记基因Z13为Sgce，所述印记基因Z16为Snrpn/Snurf。/n

【技术特征摘要】
1.一种用于肝肿瘤的印记基因分级模型，其特征在于，所述模型通过计算印记基因的总表达量、印记基因缺失表达量和印记基因拷贝数异常表达量在肝肿瘤中的变化对印记基因的表达状态进行分级；
其中，所述印记基因为Z1、Z4、Z13或Z16中的任意一个或至少两个的组合，所述印记基因Z1为Gnas，所述印记基因Z4为Igf2r，所述印记基因Z13为Sgce，所述印记基因Z16为Snrpn/Snurf。


2.根据权利要求1所述的印记基因分级模型，其特征在于，所述模型计算印记基因的方法如下：
计算Z1、Z4、Z13或Z16中的任意一个，优选为Z1、Z13或Z16中的任意一个，进一步优选为Z1或Z16；
优选地，所述模型计算印记基因的方法为：计算Z1、Z4、Z13或Z16中的任意两个，优选为Z1和Z13的组合，Z1和Z16的组合或Z13和Z16的组合。


3.根据权利要求1或2所述的印记基因分级模型，其特征在于，所述印记基因还包括Z5和/或Z6；其中，所述印记基因Z5为Mest，所述印记基因Z6为Plagl1；优选地，所述模型计算印记基因的方法为：计算印记基因的组合，计算Z1、Z4、Z5、Z6、Z13和Z16的六个印记基因的组合。


4.根据权利要求1-3中任一项所述的印记基因分级模型，其特征在于，所述计算印记基因的总表达量、印记基因缺失表达量和印记基因拷贝数异常表达量的公式如下：
总表达量＝(b+c+d)/(a+b+c+d)×100％；
正常印记基因表达量＝b/(b+c+d)×100％；
印记基因缺失基因表达量＝c/(b+c+d)×100％；
印记基因拷贝数异常的基因表达量＝d/(b+c+d)×100％；
其中，所述a为将细胞进行苏木素染色后，细胞核内不存在标记，印记基因没有表达的细胞核；所述b为将细胞进行苏木素染色后，细胞核内存在一个红色/棕色标记，印记基因存在的细胞核；所述c为将细胞进行苏木素染色后，细胞核内存在两个红色/棕色标记，印记基因缺失的细胞核；所述d为将细胞进行苏木素染色后，细胞核内存在两个以上红色/棕色标记，印记基因拷贝数异常的细胞核。


5.根据权利要求1-4中任一项所述的印记基因分级模型，其特征在于，所述印记基因缺失表达量、印记基因拷贝数异常表达量和印记基因总表达量分成五个不同的等级；
优选地，所述五个不同的等级为针对Z1、Z4、Z5、Z6、Z13和Z16的六个印记基因的印记基因缺失表达量、印记基因拷贝数异常表达量和印记基因总表达量分别进行划分的五个不同的等级；
优选地，所述针对Z1的印记基因缺失表达量、印记基因拷贝数异常表达量和总表达量划分的五个不同的等级为：
0级：所述印记基因Z1的印记基因缺失表达量小于12％、所述印记基因Z1的印记基因拷贝数异常表达量小于2％或所述印记基因Z1的总表达量小于20％中的任意一种或至少两种的组合；
I级：所述印记基因Z1的印记基因缺失表达量为12-16％、所述印记基因Z1的印记基因拷贝数异常表达量为2-4％或所述印记基因Z1的总表达量为20-30％中的任意一种或至少两种的组合；
II级：所述印记基因Z1的印记基因缺失表达量为16-20％、所述印记基因Z1的印记基因拷贝数异常表达量为4-7％或所述印记基因Z1的总表达量为30-40％中的任意一种或至少两种的组合；
III级：所述印记基因Z1的印记基因缺失表达量为20-25％、所述印记基因Z1的印记基因拷贝数异常表达量为7-10％或所述印记基因Z1的总表达量为40-50％中的任意一种或至少两种的组合；
IV级：所述印记基因Z1的印记基因缺失表达量大于25％、所述印记基因Z1的印记基因拷贝数异常表达量大于10％或所述印记基因Z1的总表达量大于50％中的任意一种或至少两种的组合；
所述针对Z4、Z5和Z6的印记基因缺失表达量、印记基因拷贝数异常表达量和总表达量划分的五个不同的等级为：
0级：所述印记基因Z4、Z5和Z6的印记基因缺失表达量小于10％、所述印记基因Z4、Z5和Z6的印记基因拷贝数异常表达量小于1％或所述印记基因Z4、Z5和Z6的总表达量小于15％中的任意一种或至少两种的组合；
I级：所述印记基因Z4、Z5和Z6的印记基因缺失表达量为10-13％、所述印记基因Z4、Z5和Z6的印记基因拷贝数异常表达量为1-2％或所述印记基因Z4、Z5和Z6的总表达量为15-20％中的任意一种或至少两种的组合；
II级：所述印记基因Z4、Z5和Z6的印记基因缺失表达量为13-16％、所述印记基因Z4、Z5和Z6的印记基因拷贝数异常表达量为2-4％或所述印记基因Z4、Z5和Z6的总表达量为20-30％中的任意一种或至少两种的组合；
III级：所述印记基因Z4、Z5和Z6的印记基因缺失表达量为16-20％、所述印记基因Z4、Z5和Z6的印记基因拷贝数异常表达量为4-6％或所述印记基因Z4、Z5和Z6的总表达量为30-40％中的任意一种或至少两种的组合；
IV级：所述印记基因Z4、Z5和Z6的印记基因缺失表达量大于20％、所述印记基因Z4、Z5和Z6的印记基因拷贝数异常表达量大于6％或所述印记基因Z4、Z5和Z6的总表达量大于40％中的任意一种或至少两种的组合；
优选地，所述针对Z13的印记基因缺失表达量、印记基因拷贝数异常表达量和总表达量划分的五个不同的等级为：
0级：所述印记基因Z13的印记基因缺失表达量小于10％、所述印记基因Z13的印记基因拷贝数异常表达量小于1.5％或所述印记基因Z13的总表达量小于15％中的任意一种或至少两种的组合；
I级：所述印记基因Z13的印记基因缺失表达量为10-15％、所述印记基因Z13的印记基因拷贝数异常表达量为1.5-2.5％或所述印记基因Z13的总表达量为15-20％中的任意一种或至少两种的组合；
II级：所述印记基因Z13的印记基因缺失表达量为15-20％、所述印记基因Z13的印记基因拷贝数异常表达量为2.5-5％或所述印记基因Z13的总表达量为20-30％中的任意一种或至少两种的组合；
III级：所述印记基因Z13的印记基因缺失表达量为20-25％、所述印记基因Z13的印记基因拷贝数异常表达量为5-10％或所述印记基因Z13的总表达量为30-40％中的任意一种或至少两种的组合；
IV级：所述印记基因Z13的印记基因缺失表达量大于25％、所述印记基因Z13的印记基因拷贝数异常表达量大于10％或所述印记基因Z13的总表达量大于40％中的任意一种或至少两种的组合；
优选地，所述针对Z16的印记基因缺失表达量、印记基因拷贝数异常表达量和总表达量划分的五个不同的等级为：
0级：所述印记基因Z16的印记基因缺失表达量小于15％、所述印记基因Z16的印记基因拷贝数异常表达量小于2％或所述印记基因Z16的总表达量小于20％中的任意一种或至少两种的组合；
I级：所述印记基因Z16的印记基因缺失表达量为15-18％、所述印记基因Z16的印记基因拷贝数异常表达量为2-4％或所述印记基因Z16的总表达量为20-30％中的任意一种或至少两种的组...

【专利技术属性】
技术研发人员：成彤，周宁，
申请(专利权)人：立森印迹诊断技术无锡有限公司，
类型：发明
国别省市：江苏;32