长链非编码RNA的测序文库构建单元和对长链非编码RNA进行测序的系统技术方案

本实用新型专利技术公开了长链非编码RNA的测序文库构建单元和对长链非编码RNA进行测序的系统。其中，该测序文库构建单元包括：去除rRNA装置、逆转录装置、第一扩增装置、片段化装置和第二扩增装置。该测序文库构建单元的去除rRNA装置先通过rRNA去除探针去除rRNA，再通过逆转录装置进行逆转录，避免了大量的rRNA对mRNA和lncRNA逆转录的影响，并且，利用rRNA去除探针去除rRNA，rRNA的去除率高，单元的稳定性好，尤其适用于微量RNA样本中的rRNA去除，从而，该单元尤其适用于单细胞的文库构建。

Construction unit of sequencing library for long-chain non coding RNA and system for sequencing long-chain non coding RNA

【技术实现步骤摘要】
长链非编码RNA的测序文库构建单元和对长链非编码RNA进行测序的系统
本技术涉及生物
，特别是基因测序领域。具体地，本技术涉及长链非编码RNA的测序文库构建方法及其应用。更具体地，本技术涉及长链非编码RNA的测序文库构建设备，以及对长链非编码RNA进行测序的系统。
技术介绍
全基因组范围内的转录组分析被广泛应用，早期的方法是从大量的组织样品中获取RNA进行测序。但此传统方法依赖于一次性总体分析数百万个细胞的基因表达，往往会掩盖特异组织中某些特化细胞具有生物学意义的基因表达差异。并且，在健康组织或肿瘤等病变组织中，某些细胞的数量稀少，除了单细胞方法没有任何其他的技术能够对它们进行分析。单细胞基因表达分析则克服了这些局限，可用于在全基因组范围内挖掘基因调节网络，尤其适用于存在高度异质性的干细胞及胚胎发育早期的细胞群体。与活细胞成像系统相结合，单细胞转录组分析更有助于深入理解细胞分化、细胞重编程及转分化等过程及相关的基因调节网络。将此技术应用于临床，理论上可以在生理或病理情况下连续追踪基因表达的动力学变化，从而监测疾病的进展。单细胞转录组分析的另一应用领域是发现亚细胞成分的基因表达谱，例如对在神经元的轴突或树突部分特异表达的基因的转录组进行分析，这些基因往往对细胞的生物学功能发挥着重要作用。目前常用的Smart-seq测序方法，产生的cDNA分子的链长更长并具有更高的产量，同时，覆盖度高并且有更低的技术偏差。但基于Smart-seq的真核细胞单细胞RNA-seq程序，仅限于检测具有poly(A)尾巴的mRNA(poly(A)+RNAs)。然而，有大量的非多聚腺苷酸RNA(poly(A)-RNA)在哺乳动物细胞中表达。标准的方法依赖于Oligo(dT)来启动逆转录(RT)。通过Oligo(dT)启动，可避免无信息核糖体RNA(rRNA)测序读长的优势，否则它们占哺乳动物细胞总RNA的90％。然而，这种方法不可避免地会排除其他没有poly(A)尾巴的RNA的信息。因此，基于RNA的高通量基因测序装置仍有待于进一步研究。
技术实现思路
本技术旨在至少解决现有技术中存在的技术问题之一。为此，本技术的一个目的在于提出一种长链非编码RNA的测序文库构建装置。根据本技术的一个方面，本技术提供了一种长链非编码RNA的测序文库构建单元。根据本技术的实施例，该单元包括：去除rRNA装置，所述去除rRNA装置含有rRNA去除探针，用于对所述待测样本进行去除rRNA处理，以便得到去除rRNA的产物；逆转录装置，所述逆转录装置与所述去除rRNA装置相连，所述逆转录装置含有逆转录引物，所述逆转录引物具有SEQIDNO：1所示的序列，用于基于所述去除rRNA的产物进行逆转录处理，以便得到单链DNA；第一扩增装置，所述第一扩增装置与所述逆转录装置相连，用于将所述单链DNA进行第一扩增处理，以便得到双链DNA；片段化装置，所述片段化装置与所述第一扩增装置相连，用于将所述双链DNA进行片段化处理，以便得到DNA片段；以及第二扩增装置，所述第二扩增装置与所述片段化装置相连，用于将所述DNA片段进行第二扩增处理，所述第二扩增的产物构成所述测序文库。根据本技术实施例的长链非编码RNA的测序文库构建单元，去除rRNA装置先通过rRNA去除探针去除rRNA，再通过逆转录装置进行逆转录，避免了大量的rRNA对mRNA和lncRNA逆转录的影响，并且，利用rRNA去除探针去除rRNA，rRNA的去除率高，单元的稳定性好，尤其适用于微量RNA样本中的rRNA去除，从而，该单元尤其适用于单细胞的文库构建。任选地，所述去除rRNA装置包括：杂交部件，所述杂交部件含有所述rRNA去除探针；去除rRNA部件，所述去除rRNA部件与所述杂交部件相连；以及去除DNA部件，所述去除DNA部件与所述去除rRNA部件相连。任选地，所述逆转录装置含有逆转录引物，所述逆转录引物具有SEQIDNO：1所示的序列。任选地，该单元进一步包括：酶切装置，所述酶切装置与所述片段化装置和所述第二扩增装置相连。任选地，所述酶切装置含有RsaI限制性内切酶。任选地，所述第二扩增装置包括:末端修复部件，所述末端修复部件与所述片段化装置相连；添加碱基A部件，所述添加碱基A部件与所述末端修复部件相连；以及接头连接部件，所述接头连接部件与所述添加碱基A部件相连；以及PCR仪，所述PCR仪与所述接头连接部件相连。根据本技术的另一方面，本技术提供了一种对长链非编码RNA进行测序的系统。根据本技术的实施例，该系统包括：测序文库构建单元，所述测序文库构建单元是前述的长链非编码RNA的测序文库构建单元；以及测序单元，所述测序单元与所述测序文库构建单元相连，用于对所述测序文库进行测序，以便获得所述待测样本的序列信息。根据本技术实施例的对长链非编码RNA进行测序的系统，其中，测序文库构建单元利用去除rRNA装置先通过rRNA去除探针去除rRNA，再通过逆转录装置进行逆转录，避免了大量的rRNA对mRNA和lncRNA逆转录的影响，并且，利用rRNA去除探针去除rRNA，rRNA的去除率高，文库构建单元的稳定性好，从而，该系统尤其适用于单细胞的测序，并且测序的效率更高，特异性和灵敏性好。本技术的附加方面和优点将在下面的描述中部分给出，部分将从下面的描述中变得明显，或通过本技术的实践了解到。附图说明本技术的上述和/或附加的方面和优点从结合下面附图对实施例的描述中将变得明显和容易理解，其中：图1显示了根据本技术一个实施例的长链非编码RNA的测序文库构建单元的结构示意图；图2显示了根据本技术一个实施例的长链非编码RNA的测序文库构建单元的结构示意图；图3显示了根据本技术一个实施例的第二扩增装置的结构示意图；图4显示了根据本技术一个实施例的对长链非编码RNA进行测序的系统的结构示意图。具体实施方式下面详细描述本技术的实施例，所述实施例的示例在附图中示出，其中自始至终相同或类似的标号表示相同或类似的元件或具有相同或类似功能的元件。下面通过参考附图描述的实施例是示例性的，仅用于解释本技术，而不能理解为对本技术的限制。长链非编码RNA的测序文库构建单元根据本技术的一个方面，本技术提供了一种长链非编码RNA的测序文库构建单元。根据本技术实施例的长链非编码RNA的测序文库构建单元，去除rRNA装置先通过rRNA去除探针去除rRNA，再通过逆转录装置进行逆转录，避免了大量的rRNA对mRNA和lncRNA逆转录的影响，并且，利用rRNA去除探针去除rRNA，rRNA的去除率高，单元的稳定性好，尤其适用于微量RNA样本中的rRNA去除，从而，该单元尤其适用于单细胞的文库构建。参考图1，根据本技术的实施例，对该长链非编码RNA的测序文本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种长链非编码RNA的测序文库构建单元，其特征在于，包括：/n去除rRNA装置，所述去除rRNA装置含有rRNA去除探针；/n逆转录装置，所述逆转录装置与所述去除rRNA装置相连，所述逆转录装置含有逆转录引物，所述逆转录引物具有SEQ ID NO：1所示的序列；/n第一扩增装置，所述第一扩增装置与所述逆转录装置相连；/n片段化装置，所述片段化装置与所述第一扩增装置相连；以及/n第二扩增装置，所述第二扩增装置与所述片段化装置相连。/n

【技术特征摘要】
20181229 CN 20182227266731.一种长链非编码RNA的测序文库构建单元，其特征在于，包括：
去除rRNA装置，所述去除rRNA装置含有rRNA去除探针；
逆转录装置，所述逆转录装置与所述去除rRNA装置相连，所述逆转录装置含有逆转录引物，所述逆转录引物具有SEQIDNO：1所示的序列；
第一扩增装置，所述第一扩增装置与所述逆转录装置相连；
片段化装置，所述片段化装置与所述第一扩增装置相连；以及
第二扩增装置，所述第二扩增装置与所述片段化装置相连。


2.根据权利要求1所述的长链非编码RNA的测序文库构建单元，其特征在于，所述去除rRNA装置包括：
杂交部件，所述杂交部件含有所述rRNA去除探针；
去除rRNA部件，所述去除rRNA部件与所述杂交部件相连；以及
去除DNA部件，所述去除DNA部件与所述去除rRNA部件相连。


3.根据权利要求1所述的长链非编码RNA的测序文库构建单元，其特征在于，所述逆转录装置含有逆转...

【专利技术属性】
技术研发人员：王娟，陈雪，韩典霖，潘伟业，李大为，玄兆伶，王海良，肖飞，
申请(专利权)人：安诺优达义乌医学检验有限公司，浙江安诺优达生物科技有限公司，安诺优达生命科学研究院，安诺优达基因科技北京有限公司，
类型：新型
国别省市：浙江;33