一种用于检测前列腺肿瘤良恶性程度的分级模型及其应用制造技术

本发明专利技术涉及一种用于检测前列腺肿瘤的分级模型及其应用，所述模型通过计算印记基因缺失表达量、印记基因拷贝数异常表达量和印记基因总表达量对印记基因在前列腺肿瘤中的变化进行分级。本发明专利技术所述检测模型和装置，以直观的方法表现了印记缺失在前列腺肿瘤病人的组织和细胞样本上的表现，通过对印记基因原位标记的方法，客观、直观、早期、精确地检测出印记(迹)基因的变化，并可以提供量化的模型，为前列腺肿瘤的诊断做出巨大贡献。

A grading model for detecting benign and malignant degree of prostate tumor and its application

【技术实现步骤摘要】
一种用于检测前列腺肿瘤良恶性程度的分级模型及其应用
本专利技术涉及生物
，涉及基因诊断领域，涉及一种分级模型及其应用，涉及一种用于检测前列腺肿瘤良恶性程度的分级模型及其应用，具体涉及一组印记基因在检测前列腺肿瘤良恶性程度中的分级模型及其组成的装置。
技术介绍
前列腺癌是老年男性的重大健康威胁，在55岁以前发病率较低，55岁以后随年龄增大发病率逐渐升高。世界每年新增前列腺癌患者109.5万，死亡30.7万，主要集中在欧美发达国家，美国前列腺癌为男性癌症发病率的第一位。中国每年新增患者6.0万，死亡2.7万，远低于欧美，但是近年来有逐渐增长的趋势。前列腺癌患者的生存时间与确诊时的癌症分期密切相关，早期前列腺癌经治疗后五年生存率达到99％，十年生存率也能达到95％，而晚期前列腺癌的五年生存率只有28％，因此前列腺癌的早期诊断和早期治疗具有非常重要的意义。目前前列腺癌的早期诊断手段主要有直肠指诊和血清PSA检测。直肠指诊能够对较大的前列腺癌进行诊断，但是对较小的前列腺癌则容易漏诊，准确率约为50-75％；血清PSA检测通过血清中前列腺特异性抗原(本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种用于前列腺肿瘤的印记基因分级模型，其特征在于，所述模型通过计算印记基因的总表达量、印记基因缺失表达量和印记基因拷贝数异常表达量在前列腺肿瘤中的变化对印记基因的表达状态进行分级；/n其中，所述印记基因为Z1、Z8、Z11或Z16中的任意一个或至少两个的组合，所述印记基因Z1为Gnas，所述印记基因Z8为Dcn，所述印记基因Z11为Grb10，所述印记基因Z16为Snrpn/Snurf。/n

【技术特征摘要】
1.一种用于前列腺肿瘤的印记基因分级模型，其特征在于，所述模型通过计算印记基因的总表达量、印记基因缺失表达量和印记基因拷贝数异常表达量在前列腺肿瘤中的变化对印记基因的表达状态进行分级；
其中，所述印记基因为Z1、Z8、Z11或Z16中的任意一个或至少两个的组合，所述印记基因Z1为Gnas，所述印记基因Z8为Dcn，所述印记基因Z11为Grb10，所述印记基因Z16为Snrpn/Snurf。


2.根据权利要求1所述的印记基因分级模型，其特征在于，所述模型计算印记基因的方法如下：
计算Z1、Z8、Z11或Z16中的任意一个，优选为Z1、Z11或Z16中的任意一个，进一步优选为Z1或Z16；
优选地，所述模型计算印记基因的方法为：计算Z1、Z8、Z11或Z16中的任意两个，优选为Z1和Z8的组合，Z1和Z16的组合，Z8和Z16的组合或Z11和Z16的组合。


3.根据权利要求1或2所述的印记基因分级模型，其特征在于，所述印记基因还包括Z3、Z4、Z5、Z6、Z10或Z13中的任意一个或至少两个的组合；其中，所述印记基因Z3为Peg10，所述印记基因Z4为Igf2r，所述印记基因Z5为Mest，所述印记基因Z6为Plagl1，所述印记基因Z10为Gatm，所述印记基因Z13为Sgce；
优选地，所述模型计算印记基因的方法为：计算印记基因的组合，计算Z1、Z3、Z4、Z5、Z6、Z8、Z10、Z11、Z13和Z16的十个印记基因的组合。


4.根据权利要求1-3中任一项所述的印记基因分级模型，其特征在于，所述计算印记基因的总表达量、印记基因缺失表达量和印记基因拷贝数异常表达量的公式如下：
总表达量＝(b+c+d)/(a+b+c+d)×100％；
正常印记基因表达量＝b/(b+c+d)×100％；
印记基因缺失基因表达量＝c/(b+c+d)×100％；
印记基因拷贝数异常的基因表达量＝d/(b+c+d)×100％；
其中，所述a为将细胞进行苏木素染色后，细胞核内不存在标记，印记基因没有表达的细胞核；所述b为将细胞进行苏木素染色后，细胞核内存在一个红色/棕色标记，印记基因存在的细胞核；所述c为将细胞进行苏木素染色后，细胞核内存在两个红色/棕色标记，印记基因缺失的细胞核；所述d为将细胞进行苏木素染色后，细胞核内存在两个以上红色/棕色标记，印记基因拷贝数异常的细胞核。


5.根据权利要求1-4中任一项所述的印记基因分级模型，其特征在于，所述印记基因缺失表达量、印记基因拷贝数异常表达量和印记基因总表达量分成五个不同的等级；
优选地，所述五个不同的等级为针对Z1、Z3、Z4、Z5、Z6、Z8、Z10、Z11、Z13和Z16的十个印记基因的印记基因缺失表达量、印记基因拷贝数异常表达量和印记基因总表达量分别进行划分的五个不同的等级；
优选地，所述针对Z1的印记基因缺失表达量、印记基因拷贝数异常表达量和总表达量划分的五个不同的等级为：
0级：所述印记基因Z1的印记基因缺失表达量小于10％、所述印记基因Z1的印记基因拷贝数异常表达量小于1％或所述印记基因Z1的总表达量小于20％中的任意一种或至少两种的组合；
I级：所述印记基因Z1的印记基因缺失表达量为10-15％、所述印记基因Z1的印记基因拷贝数异常表达量为1-2％或所述印记基因Z1的总表达量为20-30％中的任意一种或至少两种的组合；
II级：所述印记基因Z1的印记基因缺失表达量为15-20％、所述印记基因Z1的印记基因拷贝数异常表达量为2-3％或所述印记基因Z1的总表达量为30-40％中的任意一种或至少两种的组合；
III级：所述印记基因Z1的印记基因缺失表达量为20-25％、所述印记基因Z1的印记基因拷贝数异常表达量为3-5％或所述印记基因Z1的总表达量为40-50％中的任意一种或至少两种的组合；
IV级：所述印记基因Z1的印记基因缺失表达量大于25％、所述印记基因Z1的印记基因拷贝数异常表达量大于5％或所述印记基因Z1的总表达量大于50％中的任意一种或至少两种的组合；
优选地，所述针对Z8的印记基因缺失表达量、印记基因拷贝数异常表达量和总表达量划分的五个不同的等级为：
0级：所述印记基因Z8的印记基因缺失表达量小于10％、所述印记基因Z8的印记基因拷贝数异常表达量小于1％或所述印记基因Z8的总表达量小于15％中的任意一种或至少两种的组合；
I级：所述印记基因Z8的印记基因缺失表达量为10-15％、所述印记基因Z8的印记基因拷贝数异常表达量为1-2％或所述印记基因Z8的总表达量为15-20％中的任意一种或至少两种的组合；
II级：所述印记基因Z8的印记基因缺失表达量为15-20％、所述印记基因Z8的印记基因拷贝数异常表达量为2-5％或所述印记基因Z8的总表达量为20-30％中的任意一种或至少两种的组合；
III级：所述印记基因Z8的印记基因缺失表达量为20-25％、所述印记基因Z8的印记基因拷贝数异常表达量为5-8％或所述印记基因Z8的总表达量为30-40％中的任意一种或至少两种的组合；
IV级：所述印记基因Z8的印记基因缺失表达量大于25％、所述印记基因Z8的印记基因拷贝数异常表达量大于8％或所述印记基因Z8的总表达量大于40％中的任意一种或至少两种的组合；
优选地，所述针对Z16的印记基因缺失表达量、印记基因拷贝数异常表达量和总表达量划分的五个不同的等级为：
0级：所述印记基因Z16的印记基因缺失表达量小于15％、所述印记基因Z16的印记基因拷贝数异常表达量小于1％或所述印记基因Z16的总表达量小于30％中的任意一种或至少两种的组合；
I级：所述印记基因Z16的印记基因缺失表达量为15-20％、所述印记基因Z16的印记基因拷贝数异常表达量为1-3％或所述印记基因Z16的总表达量为30-40％中的任意一种或至少两种的组合；
II级：所述印记基因Z16的印记基因缺失表达量为20-25％、所述印记基因Z16的印记基因拷贝数异常表达量为3-5％或所述印记基因Z16的总表达量为40-50％中的任意一种或至少两种的组合；
III级：所述印记基因Z16的印记基因缺失表达量为25-30％、所述印记基因Z16的印记基因拷贝数异常表达量为5-8％或所述印记基因Z16的总表达量为50-60％中的任意一种或至少两种的组合；
IV级：所述印记基因Z16的印记基因缺失表达量大于30％、所述印记基因Z16的印记基因拷贝数异常表达量大于8％或所述印记基因Z16的总表达量大于60％中的任意一种或至少两种的组合；
优选地，所述针对Z3、Z11和Z13的印记基因缺失表达量、印记基因拷贝数异常表达量和总表达量划分的五个不同的等级为：
0级：所述印记基因Z3、Z11和Z13的印记基因缺失表达量小于10％、所述印记基因Z3、Z11和Z13的印记基因拷贝数异常表达量小于1％或所述印记基因Z3、Z11和Z13的总表达量小于15％中的任意一种或至少两种的组合；
I级：所述印记基因Z3、Z11和Z13的印记基因缺失表达量为10-15％、所述印记基因Z3、Z11和Z13的印记基因拷贝数异常表达量为1-1.5％或所述印记基因Z3、Z11和Z13的总表达量为15-20％中的任意一种或至少两种的组合；
II级：所述印记基因Z3、Z11和Z13的印记基因缺失表达量为15-20％、所述印记基因Z3、Z11和Z13的印记基因拷贝数异常表达量为1.5-2.5％或所述印记基因Z3、Z11和Z13的总表达量为20-30％中的任意一种或至少两种的组合；
III级：所述印记基因Z3、Z11和Z13的印记基因缺失表达量为20-25％、所述印记基因Z3、Z11和Z13的印记基因拷贝数异常表达量为2.5-4％或所述印记基因Z3、Z11和Z13的总表达量为30-40％中的任意一种或至少两种的组合；
IV级：所述印记基因Z3、Z11和Z13的印记基因缺失表达量大于25％、所述印记基因Z3、Z11和Z13的印记基因拷贝数异常表达量大于4％或所述印记基因Z3、Z11和Z13的总表达量大于40％中的任意一种或至少两种的组合；
优选地，所述针对Z4、Z5、Z6和Z10的印记基因缺失表达量、印记基因拷贝数异常表达量和总表达量划分的五个不同的等级为：
0级：所述印记基因Z4、Z5、Z6和Z10的印记基因缺失表达量小于10％、所述印记基因Z4、Z5、Z6和Z10的印记基因拷贝数异常表达量小于0.5％或所述印记基因Z4、Z5、Z6和Z10的总表达量小于15％中的任意一种或至少两种的组合；
I级：所述印记基因Z4、Z5、Z6和Z10的印记基因缺失表达量为10-15％、所述印记基因Z4、Z5、Z6和Z10的印记基因拷贝数异...

【专利技术属性】
技术研发人员：成彤，周宁，
申请(专利权)人：立森印迹诊断技术无锡有限公司，
类型：发明
国别省市：江苏;32