用于判断临床治疗对膜性肾病疗效的标志物制造技术

本发明专利技术公开了一种用于判断临床治疗对膜性肾病疗效的标志物，该组标志物包括TCR Vβ4.1。具体地，统计样本中V基因的总使用频率，所述TCR Vβ4.1的使用频率所占比例>1.306％，预测临床治疗对膜性肾病具有疗效。以患者TCR编码基因中的TCR Vβ4.1为标志物，当TCR Vβ4.1的使用频率所占比例>1.306％，可预判临床治疗对于该膜性肾病患者具有疗效，预期经临床治疗后实现尿蛋白定性实验显示阴性，该判断方法的AUC为0.82，当阈值设定为1.306％时，灵敏度为0.625时，特异性为1.0。

A marker for judging the effect of clinical treatment on membranous nephropathy

【技术实现步骤摘要】
用于判断临床治疗对膜性肾病疗效的标志物
本专利技术涉及一种用于判断临床治疗对膜性肾病疗效的标志物。
技术介绍
机体免疫系统识别和清除肿瘤细胞主要依赖于T细胞介导的细胞免疫。T细胞受体(TCR)是T细胞表面特异性识别抗原和介导免疫应答的分子，是人类基因组中多态性最高的区域之一，决定着人的免疫系统如何适应环境的变化。T细胞受体库的多样性(包括基因重组以及选择性表达)直接反映了机体免疫应答的状态。TCR可分为TCRα/β和TCRγ/δ两种类型，人类外周血T细胞主要为TCRα/β的T细胞，是介导机体特异性细胞免疫反应的主要细胞。TCRβ基因由可变区(V)、多变区(D)、结合区(J)和恒定区(C)四部分基因片段组成，形成互补决定区(complementaritiesdeterminingregion,CDR)和间隔的4个骨架区(frameworkregion,FR)。在T细胞发育过程中CDR1，CDR2和FR区域相对保守，CDR3区由V、D和J进行重排而形成具有功能的TCR编码基因(T细胞克隆)，由于V(65种)、D(2种)、J(13种)基因片段本身具有多样性，此外，由于在重排的过程中，在VD及D-J的连接区经常有非模板的核苷酸的随机插入或删除，进一步增加了CDR3区的多样性(连接形成的多样性约为2×1011)。这种基因片段连接的不准确性使TCR的表达呈多样性(即TCR库的多样性),以识别各种不同的抗原。正常个体在无抗原刺激时，TCR基因重排是随机的，因此正常人外周T细胞呈多家族、多克隆性特点。在不同抗原(肿瘤、疫苗、病院微生物或者移植物等)刺激后，TCRV区基因可对该抗原产生特异性识别，并使带有这类基因的T细胞得到优势扩增，可用于分析不同TCRV亚家族T细胞的表达和利用。膜性肾病是一个病理形态学诊断名词，是导致成人肾病综合征的一个常见病因，其特征性的病理学改变是肾小球毛细血管袢上皮侧可见大量免疫复合物沉积。临床表现为肾病综合征(大量蛋白尿、低蛋白血症、高度水肿、高脂血症)，或无症状、非肾病范围的蛋白尿。诊断上要依靠临床表现及肾活检病理改变。其治疗方法主要分非免疫治疗和免疫治疗两种。临床治疗膜性肾病的方法通常是采用激素治疗，但其疗效只能通跟踪观察才能验证其是否对该患者有效。对于疗效的判断不一定达到完全缓解(尿蛋白量≤0.3g/天)，可能只能实现部分缓解(尿蛋白≤3.5g/天或尿蛋白下降>50％，血清白蛋白>30g/L)。
技术实现思路
由于目前临床尚无法预测临床治疗对不同个体的膜性肾病疗效，只能通过6-9个月的治疗观察，无效后再使用其他手段治疗或辅助缓解症状。本专利技术旨在提供一种用于判断临床治疗对膜性肾病疗效的标志物，通过检测患者标志物的使用频率可用于辅助预测，判断临床治疗是否对该患者的膜性肾病具有疗效。本专利技术所采取的技术方案是：用于判断临床治疗对膜性肾病疗效的标志物，该组标志物包括TCRVβ4.1。具体地，统计样本中V基因的总使用频率，所述TCRVβ4.1的使用频率所占比例>1.306％，预测临床治疗对膜性肾病具有疗效。定量TCRVβ4.1表达量的试剂在制备判断临床治疗对膜性肾病疗效试剂中应用。进一步，统计样本中V基因的总使用频率，所述TCRVβ4.1的使用频率所占比例>1.306％，预测临床治疗对膜性肾病具有疗效。本专利技术同时还提供了一种用于判断临床治疗对膜性肾病疗效的试剂盒，试剂盒中含有定量TCRVβ4.1表达量和65个V基因总表达量的试剂。基于上述技术方案，本专利技术所提供的标志物具有以下优点：以患者TCR编码基因中的TCRVβ4.1为标志物，当TCRVβ4.1的使用频率所占比例>1.306％，可预判临床治疗对于该膜性肾病患者具有疗效，预期经临床治疗后实现尿蛋白定性实验显示阴性，该判断方法的AUC为0.82，当阈值设定为1.306％时，灵敏度为0.625时，特异性为1.0。附图说明图1是治疗有效组和治疗无效组TCRVβ4.1的小提琴图；图2是治疗有效组TCRVβ4.1的ROC曲线。小提琴图结合了箱型图和密度图的特征，用于展示数据的分布形状。具体实施方式实施例1：以19例膜性肾病患者分别进行验证。对每例患者采集外周血，提取RNA，5'RACE逆转录，由β链外侧引物：5’-AGATCTCTGCTTCTGATGGCT-3’、β链内侧引物：5’-TGGCTCAAACACAGCGACCT-3’组成的引物进行PCR扩增样本的TCR库，然后使用第二代测序平台进行测序。根据测序数据，通过perl程序语言调用序列比对工具blat为内核与参考序列进行序列比对，基于TCR基因的参考坐标，注释比对结果，输出内容包含了当前TCR库分析中公认的各类指标，从而获得生物信息学分析统计各样本的V基因的使用频率。根据TCRVβ4.1基因的使用频率，判断19例患者其中5例检测标志物的使用频率符合要求，属于预判有效组；其余14例测得TCRVβ4.1的使用频率所占比例≤1.306％，属于预判无效组。针对19例患者使用泼尼松(1毫克/公斤体重)每天的临床治疗方案，经过6个月的治疗，跟踪观察预判有效组和预判无效组。预判有效组5例患者全部尿蛋白检验结果转为阴性。预判无效组14例中有3例患者尿蛋白检验结果转为阴性，11例仍然为阳性。具体数据见表1。表119例尿蛋白患者的TCRVβ4.1使用频率及跟踪结果编号TCRBV4.1分组治疗结果10.651％预判无效无效20.602％预判无效无效30.493％预判无效无效41.216％预判无效无效50.218％预判无效无效60.306％预判无效无效70.256％预判无效无效80.447％预判无效无效90.541％预判无效无效101.055％预判无效有效110.876％预判无效无效121.291％预判无效无效134.481％预判有效有效141.478％预判有效有效152.481％预判有效有效160.053％预判无效有效170.824％预判无效有效181.321％预判有本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.用于判断临床治疗对膜性肾病疗效的标志物，其特征在于：该组标志物包括TCR Vβ4.1。/n

【技术特征摘要】
1.用于判断临床治疗对膜性肾病疗效的标志物，其特征在于：该组标志物包括TCRVβ4.1。


2.根据权利要求1所述的标志物，其特征在于：统计样本中V基因的总使用频率，所述TCRVβ4.1的使用频率所占比例>1.306％，预测临床治疗对膜性肾病具有疗效。


3.定量TCRVβ4.1表达量的试剂在制备判断临床治疗对膜...

【专利技术属性】
技术研发人员：罗微，孔耀中，金亚彬，张豫，苏祖晖，陈湘萍，官展文，张丽芳，李惠施，谢超，刘笑芬，叶佩仪，
申请(专利权)人：佛山市第一人民医院中山大学附属佛山医院，
类型：发明
国别省市：广东;44