【技术实现步骤摘要】
用于结核分枝杆菌耐药检测的突变基因、及其检测方法和试剂盒
本专利技术涉及生物检验领域，具体涉及结核分枝杆菌的耐药基因突变位点，以及结核分枝杆菌的耐药检验方法。
技术介绍
目前针对结核分枝杆菌的药敏检测方法主要为培养与荧光定量PCR(qPCR)。培养法是将结核分枝菌涂布在培养板上，待结核分枝杆菌铺满整个平板后，在菌板上放置不同剂量的药物。继续培养一段时间后观察药物周围出现菌斑的大小判断细菌耐受程度。该技术需要在有较严格的生物安全实验室进行，同时需要2-3个月的时间才能出结果。qPCR法是将结合分枝杆菌进行核酸提取后，通过特异的引物进行扩增荧光检测核酸序列突变的信息提示细菌的药物耐受性。该方法耗时只需要半天至一天的时间，但目前市面上只有一线的药物相应的检测试剂盒。由于培养法耗时长，给病人造成严重的经济负担，同时也耽误了病人的最佳诊疗时间，而荧光定量PCR法通量低，无法检测移码突变或者无突变热点的突变，且覆盖药物的种类少，无法检测二、三线药物。因此，开发一款可用于快速、全面且准确的结核分枝杆菌耐药检测试剂盒，有助于...
【技术保护点】
1.一种结核分枝杆菌耐药相关的突变基因，其特征在于，所述突变基因选自如下任一基因的任一突变：/n(1)katG基因，其与野生型基因相比存在如下表所示至少一种突变：/n
【技术特征摘要】
1.一种结核分枝杆菌耐药相关的突变基因，其特征在于，所述突变基因选自如下任一基因的任一突变：
(1)katG基因，其与野生型基因相比存在如下表所示至少一种突变：
基因
突变名称
katG
Q88P及M257V
katG
W91R
katG
A122D
katG
Q127P
katG
A312E
katG
D419Y
(2)rpoB基因，其与野生型基因相比存在如下表所示突变：
基因
突变名称
rpoB
1291gcc_in
(3)gidB基因，其与野生型基因相比存在如下表所示至少一种突变：
基因
突变名称
gidB
102g_del
gidB
386g_in
gidB
351g_del
(4)pncA基因，其与野生型基因相比存在如下表所示至少一种突变：
2.根据权利要求1所述的突变基因，其特征在于，所述katG突变基因的序列如SEQIDNO：1～6中的任一序列所示。
3.一种用于结核分枝杆菌耐药检测的方法，其特征在于，所述方法包括检测受试者的结核分枝杆菌是否存在如权利要求1或2所述的突变基因中的突变，如果存在所述突变，则受试者被鉴定为对异烟肼、利福平、链霉素或吡嗪酰胺耐药。
4.根据权利要求3所述的方法，其特征在于，所述方法进一步包括检测受试者的结核分枝杆菌katG基因或inhA基因与野生型基因相比是否存在如下表所示至少一种突变：
基因
突变名称
katG
S315T
katG
S315N
inhA
c-15t
如果存在突变，则受试者被鉴定为对异烟肼耐药；
任选地，所述方法进一步包括检测受试者的结核分枝杆菌rpoB基因与野生型基因相比是否存在如下表所示至少一种突变：
基因
突变名称
rpoB
S450L
rpoB
S450F
rpoB
S450W
rpoB
H445D
rpoB
H445L
rpoB
H445Y
rpoB
D435V
rpoB
D435G
rpoB
D435A
rpoB
L430P
rpoB
L452P
如果存在突变，则受试者被鉴定为对利福平耐药；
任选地，所述方法进一步包括检测受试者的结核分枝杆菌pncA基因与野生型基因相比是否存在如下表所示至少一种突变：
如果存在突变，则受试者进一步被鉴定为对吡嗪酰胺耐药；
任选地，所述方法进一步包括检测受试者的结核分枝杆菌gyrA基因与野生型基因相比是否存在如下表所示至少一种突变：
基因
突变名称
gy...
【专利技术属性】
技术研发人员：李英镇，陈嘉臻，张文宏，吴红龙，
申请(专利权)人：华大生物科技武汉有限公司，复旦大学，
类型：发明
国别省市：湖北;42
还没有人留言评论。发表了对其他浏览者有用的留言会获得科技券。