核酸片段的分子量校正方法及装置制造方法及图纸

本发明专利技术提供的核酸片段的分子量校正方法及装置，方法包括：从核酸片段分子量标准物的电泳信号中查找信号峰峰值大于一预设值的第一信号峰，并获得每个第一信号峰的峰位，根据核酸片段分子量标准物中各标记片段的分子量之间的间隔和每个第一信号峰的峰位从查找到的第一信号峰中确定与每个标记片段的分子量对应的第二信号峰，根据第二信号峰和与第二信号峰对应的标记片段的分子量对核酸片段分子量标准物中各标记片段进行处理得到分子量校正模型，以根据分子量校正模型对待校正核酸片段的分子量进行校正，通过采用上述方法，实现对待校正核酸片段的分子量进行可靠有效的校正，避免了在待校正核酸片段较长时存在的校正不准确的问题。

Molecular weight correction method and device for nucleic acid fragments

【技术实现步骤摘要】
核酸片段的分子量校正方法及装置
本专利技术涉及核酸片段校正
，具体而言，涉及一种核酸片段的分子量校正方法及装置。
技术介绍
现有的核酸片段的分子量校正，采用二阶多项式拟合得出片段分子量与迁移速率之间的关系，对于小于800bp的核酸片段，分子量与电泳迁移速率之间的关系基本满足二阶多项式关系。采用上述的校正方式对长片段的分子量校正存在校正不准确的问题。
技术实现思路
本专利技术提供一种核酸片段的分子量校正方法及装置。一种核酸片段的分子量校正方法，所述方法包括：从核酸片段分子量标准物的电泳信号中查找信号峰峰值大于一预设值的第一信号峰，并获得每个所述第一信号峰的峰值；根据所述核酸片段分子量标准物中各标记片段的分子量之间的间隔和每个所述第一信号峰的峰位从查找到的第一信号峰中确定与每个所述标记片段的分子量对应的第二信号峰，其中，所述核酸片段分子量标准物中包括多个标记片段的分子量；根据所述第二信号峰和与所述第二信号峰对应的标记片段的分子量对所述核酸片段分子量标准物中各标记片段进行处理得到分子量校正模型；根据分子量校正模型对待校正核酸片段的分子量进行校正。可选的，在上述核酸片段的分子量校正方法中，从核酸片段分子量标准物的电泳信号中查找信号峰峰值大于一预设值的第一信号峰的步骤包括：从核酸片段分子量标准物的毛细管电泳信号中查找信号峰峰值大于一预设值的第一信号峰。可选的，在上述核酸片段的分子量校正方法中，根据所述核酸片段分子量标准物中各标记片段的分子量之间的间隔和每个所述第一信号峰的峰位从查找到的第一信号峰中确定与每个所述标记片段的分子量对应的第二信号峰的步骤包括：获得电泳信号中查找到的所有第一信号峰中最后两个第一信号峰的峰位帧数，并计算所述最后两个第一信号峰的峰位帧数之间的间隔；计算核酸片段分子量标准物中最后两个标记片段的分子量间隔；将所述最后两个第一信号峰的峰位帧数之间的间隔除以所述最后两个标记片段的分子量间隔，得到单位分子量对应的电泳信号帧数；根据所述电泳信号帧数以及所述核酸片段分子量标准物中各标记片段分子量之间的间隔，依次查找出与所述核酸片段分子量标准物中各标记片段分子量对应的第二信号峰。可选的，在上述核酸片段的分子量校正方法中，根据所述第二信号峰和与所述第二信号峰对应的标记片段的分子量对所述核酸片段分子量标准物中各标记片段进行处理得到分子量校正模型的步骤包括：获得每个标记片段的分子量、核酸片段分子的净电荷、电泳凝胶的粘度、毛细管电泳电压、毛细管长度以及分子量相关的关系系数与电泳的迁移速率之间的第一预设关系，其中，所述第一预设关系满足v为所述电泳的迁移速率，Q为所述核酸片段分子的净电荷，VE为所述毛细管的电泳电压，η为所述电泳凝胶的粘度，L为所述毛细管长度，M为核酸片段分子量，α和β是与分子量相关的关系系数；获得所述毛细管的集束端到检测窗口之间的距离和该检测窗口处采集毛细管电泳的采集帧数之间的第二预设关系，其中，所述第二预设关系为v＝L0/Fn，L0为所述距离，Fn为所述采集帧数；基于所述第一预设关系和所述第二预设关系得到毛细管电泳采集帧数与分子量标准物标记片段的分子量之间的对应关系，其中，该对应关系为ε为常数；对所述核酸片段分子量标准物中各标记片段的电泳采集帧数和对应的分子量按照所述对应关系进行拟合得到分子量校正模型。可选的，在上述核酸片段的分子量校正方法中，所述核酸片段分子量标准物中标记片段为100bp-1000bp之间。本专利技术还提供一种核酸片段的分子量校正装置，所述装置包括：第一信号峰获得模块，用于从核酸片段分子量标准物的电泳信号中查找信号峰峰值大于一预设值的第一信号峰，并获得每个所述第一信号峰的峰值；第二信号峰获得模块，用于根据所述核酸片段分子量标准物中各标记片段的分子量之间的间隔和每个所述第一信号峰的峰位从查找到的第一信号峰中确定与每个所述标记片段的分子量对应的第二信号峰，其中，所述核酸片段分子量标准物中包括多个标记片段的分子量；模型获得模块，用于根据所述第二信号峰和与所述第二信号峰对应的标记片段的分子量对所述核酸片段分子量标准物中各标记片段进行处理得到分子量校正模型；校正模块，用于根据分子量校正模型对待校正核酸片段的分子量进行校正。可选的，在上述核酸片段的分子量校正装置中，所述第一信号峰获得模块，还用于从核酸片段分子量标准物的毛细管电泳信号中查找信号峰峰值大于一预设值的第一信号峰。可选的，在上述核酸片段的分子量校正装置中，所述第二信号峰获得模块包括：第一间隔获得子模块，用于获得电泳信号中查找到的所有第一信号峰中最后两个第一信号峰的峰位帧数，并计算所述最后两个第一信号峰的峰位帧数之间的间隔；第二间隔获得子模块，用于计算核酸片段分子量标准物中最后两个标记片段的分子量间隔；计算子模块，用于将所述最后两个第一信号峰的峰位帧数之间的间隔除以所述最后两个标记片段的分子量间隔，得到单位分子量对应的电泳信号帧数；第二信号峰获得子模块，用于根据所述电泳信号帧数以及所述核酸片段分子量标准物中各标记片段分子量之间的间隔，依次查找出与所述核酸片段分子量标准物中各标记片段分子量对应的第二信号峰。可选的，在上述核酸片段的分子量校正装置中，所述模型获得模块包括：第一预设关系获得子模块，用于获得每个标记片段的分子量、核酸片段分子的净电荷、电泳凝胶的粘度、毛细管电泳电压、毛细管长度以及分子量相关的关系系数与电泳的迁移速率之间的第一预设关系，其中，所述第一预设关系满足v为所述电泳的迁移速率，Q为所述核酸片段分子的净电荷，VE为所述毛细管的电泳电压，η为所述电泳凝胶的粘度，L为所述毛细管长度，M为核酸片段分子量，α和β是与分子量相关的关系系数；第二预设关系获得子模块，用于获得所述毛细管的集束端到检测窗口之间的距离和该检测窗口处采集毛细管电泳的采集帧数之间的第二预设关系，其中，所述第二预设关系为v＝L0/Fn，L0为所述距离，Fn为所述采集帧数；对应关系获得子模块，用于基于所述第一预设关系和所述第二预设关系得到毛细管电泳采集帧数与分子量标准物标记片段的分子量之间的对应关系，其中，该对应关系为ε为常数；模型获得子模块，用于对所述核酸片段分子量标准物中各标记片段的电泳采集帧数和对应的分子量按照所述对应关系进行拟合得到分子量校正模型。可选的，在上述核酸片段的分子量校正装置中，所述核酸片段分子量标准物中标记片段为100bp-1000bp之间。本专利技术提供的核酸片段的分子量校正方法及装置，方法包括：从核酸片段分子量标准物的电泳信号中查找信号峰峰值大于一预设值的第一信号峰，并获得每个所述第一信号峰的峰位，根据所述核酸片段分子量标准物中各标记片段的分子量之间的间隔和每个所述第一信号峰的峰位从查找到的第一信号峰中确定与每个所述标记片段的分子量对应的第二信号峰，根据所述第二信号峰和与所述第二信号峰对应的标记片本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种核酸片段的分子量校正方法，其特征在于，所述方法包括：/n从核酸片段分子量标准物的电泳信号中查找信号峰峰值大于一预设值的第一信号峰，并获得每个所述第一信号峰的峰位；/n根据所述核酸片段分子量标准物中各标记片段的分子量之间的间隔和每个所述第一信号峰的峰位，从查找到的第一信号峰中确定与每个所述标记片段的分子量对应的第二信号峰，其中，所述核酸片段分子量标准物中包括多个标记片段的分子量；/n根据所述第二信号峰和与所述第二信号峰对应的标记片段的分子量对所述核酸片段分子量标准物中各标记片段进行处理得到分子量校正模型；/n根据分子量校正模型对待校正核酸片段的分子量进行校正。/n

【技术特征摘要】
1.一种核酸片段的分子量校正方法，其特征在于，所述方法包括：
从核酸片段分子量标准物的电泳信号中查找信号峰峰值大于一预设值的第一信号峰，并获得每个所述第一信号峰的峰位；
根据所述核酸片段分子量标准物中各标记片段的分子量之间的间隔和每个所述第一信号峰的峰位，从查找到的第一信号峰中确定与每个所述标记片段的分子量对应的第二信号峰，其中，所述核酸片段分子量标准物中包括多个标记片段的分子量；
根据所述第二信号峰和与所述第二信号峰对应的标记片段的分子量对所述核酸片段分子量标准物中各标记片段进行处理得到分子量校正模型；
根据分子量校正模型对待校正核酸片段的分子量进行校正。


2.根据权利要求1所述的核酸片段的分子量校正方法，其特征在于，从核酸片段分子量标准物的电泳信号中查找信号峰峰值大于一预设值的第一信号峰的步骤包括：
从核酸片段分子量标准物的毛细管电泳信号中查找信号峰峰值大于一预设值的第一信号峰。


3.根据权利要求2所述的核酸片段的分子量校正方法，其特征在于，根据所述核酸片段分子量标准物中各标记片段的分子量之间的间隔和每个所述第一信号峰的峰位从查找到的第一信号峰中确定与每个所述标记片段的分子量对应的第二信号峰的步骤包括：
获得电泳信号中查找到的所有第一信号峰中最后两个第一信号峰的峰位帧数，并计算所述最后两个第一信号峰的峰位帧数之间的间隔；
计算核酸片段分子量标准物中最后两个标记片段的分子量间隔；
将所述最后两个第一信号峰的峰位帧数之间的间隔除以所述最后两个标记片段的分子量间隔，得到单位分子量对应的电泳信号帧数；
根据所述电泳信号帧数以及所述核酸片段分子量标准物中各标记片段分子量之间的间隔，依次查找出与所述核酸片段分子量标准物中各标记片段分子量对应的第二信号峰。


4.根据权利要求3所述的核酸片段的分子量校正方法，其特征在于，根据所述第二信号峰和与所述第二信号峰对应的标记片段的分子量对所述核酸片段分子量标准物中各标记片段进行处理得到分子量校正模型的步骤包括：
获得每个标记片段的分子量、核酸片段分子的净电荷、电泳凝胶的粘度、毛细管电泳电压、毛细管长度以及分子量相关的关系系数与电泳的迁移速率之间的第一预设关系，其中，所述第一预设关系满足v为所述电泳的迁移速率，Q为所述核酸片段分子的净电荷，VE为所述毛细管的电泳电压，η为所述电泳凝胶的粘度，L为所述毛细管长度，M为核酸片段分子量，α和β是与分子量相关的关系系数；
获得所述毛细管的集束端到检测窗口之间的距离和该检测窗口处采集毛细管电泳的采集帧数之间的第二预设关系，其中，所述第二预设关系为v＝L0/Fn，L0为所述距离，Fn为所述采集帧数；
基于所述第一预设关系和所述第二预设关系得到毛细管电泳采集帧数与分子量标准物标记片段的分子量之间的对应关系，其中，该对应关系为ε为常数；
对所述核酸片段分子量标准物中各标记片段的电泳采集帧数和对应的分子量按照所述对应关系进行拟合得到分子量校正模型。


5.根据权利要求1所述的核酸片段的分子量校正方法，其特征在于，所述核酸片段分子量标准物中标记片段为100bp-1000b...

【专利技术属性】
技术研发人员：张吉华，吕华，
申请(专利权)人：南京溯远基因科技有限公司，
类型：发明
国别省市：江苏;32