一种评估微生物群落宏基因（或普通生物群落宏遗传）多样性和相似性的概念和方法技术

本发明专利技术公开了一种评估微生物群落宏基因（或普通生物群落宏遗传）多样性和相似性的概念和方法，包括用Hill numbers度量单基因水平(Metagenomic Gene：MG)和功能基因群(Metagenomic Functional Gene Cluster：MFGC)水平的宏基因多样性及其相似性。其中多样性包括alpha‑宏基因多样性、beta‑宏基因多样性和gamma‑宏基因多样性，相似性用于比较两个或两个以上群落宏基因多样性。宏基因多样性指数能有效评估和监测人体、动物以及环境微生物群落的宏基因多样性和相似性，并为菌群相关疾病的研究和诊断治疗以及环境微生物宏基因监测提供科学依据和技术体系。本发明专利技术同样适用于宏遗传多样性(Metagenetic Diversity)，可用于评估和监测任何生物群落的宏遗传多样性和相似性。

A Concept and Method for Evaluating the Diversity and Similarity of Macro Genes (or Macro Genetics) in Microbial Communities

【技术实现步骤摘要】
一种评估微生物群落宏基因(或普通生物群落宏遗传)多样性和相似性的概念和方法
本专利技术涉及微生物群落宏基因(或普通生物群落宏遗传)多样性和相似性评估概念和方法，特别是涉及一种在单基因水平和功能基因群水平综合评估和监测微生物群落宏基因(或普通生物群落宏遗传)多样性和相似性的概念和方法，并将其应用于评估和检测人体、动物以及环境微生物群落的宏基因多样性和相似性，并为人体(或动物)菌群相关疾病的研究和诊断治疗以及环境微生物宏基因监测提供科学依据和技术体系。
技术介绍
生态群落的多样性维持机制一直是生态学研究的核心问题，群落物种多样性的度量指数也随着研究的深入不断发展。在一个生态群落中，不同物种扮演着各自的角色，它们各自的个体数——丰度(Abundance)，能够在一定程度上反映出各个物种的多寡，从而反映出微生物群落的组成结构。目前对生物群落(包括微生物群落)从物种角度研究生态多样性(也称生物多样性)和相似性已经有诸多方法和技术，但从宏基因角度研究群落宏基因多样性和相似性尚无报道。因此，本专利技术并不涉及物种多样性以及传统的生态(生物)多样性领域人体时时刻刻被微生物所包围，人体各个部位诸如：肠本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种度量微生物群落宏基因(或普通生物群落宏遗传)多样性和相似性(Similarity)的概念和方法。

【技术特征摘要】
1.一种度量微生物群落宏基因(或普通生物群落宏遗传)多样性和相似性(Similarity)的概念和方法。2.按照权利要求1所述的方法，度量、评估和监测微生物群落宏基因(或普通生物群落宏遗传)多样性和相似性包括单基因水平(MetagenomicGene：MG)和功能基因群水平(MetagenomicFunctionalGeneCluster)的多样性指数评估概念和方法。3.按照权利要求2所述的方法，度量、评估和监测微生物群落宏基因(或普通生物群落宏遗传)多样性群落或集合群落的alpha-宏基因多样性、beta-宏基因多样性和gamma-宏基因多样性。...

【专利技术属性】
技术研发人员：马占山，李连伟，
申请(专利权)人：中国科学院昆明动物研究所，
类型：发明
国别省市：云南,53