【技术实现步骤摘要】
一种新型多发性骨髓瘤诺模图构建方法
本专利技术涉及一种基于十基因特征、血清β2-微球蛋白和LDH的多发性骨髓瘤诺模图构建方法。
技术介绍
多发性骨髓瘤(MM)是一种恶性浆细胞病,其肿瘤细胞起源于骨髓中的浆细胞,而浆细胞是B淋巴细胞发育到最终功能阶段的细胞。目前,多发性骨髓瘤的异质性日益受到重视,然而,世界上还没有建立有效、简便的MM预后模型。
技术实现思路
本专利技术提供了一种基于十基因特征、血清β2-微球蛋白和LDH的多发性骨髓瘤诺模图构建方法,可以有效解决上述问题。本专利技术是这样实现的:一种基于十基因特征、血清β2-微球蛋白和LDH的多发性骨髓瘤诺模图构建方法,包括以下步骤:S1,从GEO数据库中获取MM患者的基因表达谱GSE24080,并对所述基因表达谱GSE24080中的基因进行预处理,获得表达值方差最大的前25%的5413个基因;S2,对所述5413个基因进行WGCNA基因共表达网络分析,以识别共表达的功能模块;S3,通过Pearson相关检验将所述功能模块与临床信息之间的相关性进行评估,以确定最显著的模块;S4,使用Cox比例危险度模型对最显著的模块中的 ...
【技术保护点】
1.一种基于十基因特征、血清β2‑微球蛋白和LDH的多发性骨髓瘤诺模图构建方法,其特征在于,包括以下步骤:S1,从GEO数据库中获取MM患者的基因表达谱GSE24080,并对所述基因表达谱GSE24080中的基因进行预处理,获得表达值方差最大的前25%的5413个基因;S2,对所述5413个基因进行WGCNA基因共表达网络分析,以识别共表达的功能模块;S3,通过Pearson相关检验将所述功能模块与临床信息之间的相关性进行评估,以确定最显著的模块;S4,使用Cox比例危险度模型对最显著的模块中的基因进行单变量生存分析,并通过LASSO回归筛选出由10个最佳基因组成的评分模型 ...
【技术特征摘要】
1.一种基于十基因特征、血清β2-微球蛋白和LDH的多发性骨髓瘤诺模图构建方法,其特征在于,包括以下步骤:S1,从GEO数据库中获取MM患者的基因表达谱GSE24080,并对所述基因表达谱GSE24080中的基因进行预处理,获得表达值方差最大的前25%的5413个基因;S2,对所述5413个基因进行WGCNA基因共表达网络分析,以识别共表达的功能模块;S3,通过Pearson相关检验将所述功能模块与临床信息之间的相关性进行评估,以确定最显著的模块;S4,使用Cox比例危险度模型对最显著的模块中的基因进行单变量生存分析,并通过LASSO回归筛选出由10个最佳基因组成的评分模型如下:风险评分=0.239*ZNRF3的表达水平+0.219*UBE2T的表达水平+0.164*CCSAP的表达水平+0.161*CENPE的表达水平+0.152*PMS2P5的表达水平+0.147*TMEM97的表达水平+0.131*CDKN2A的表达水平+0.123*SLC39A10的表达水平+0.107*KIF21B的表达水平+0.002*FABP5的表达水平;S5,建立基于所述评分模型、血清β...
【专利技术属性】
技术研发人员:曾志勇,陈君敏,
申请(专利权)人:福建医科大学附属第一医院,
类型:发明
国别省市:福建,35
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