用于检测BRAF相关融合基因的探针组、试剂盒及其应用制造技术

本发明专利技术公开了一种用于检测BRAF相关融合基因的探针组，包括用于检测BRAF/KIAA1549、BRAF/SRGAP3、BRAF/FAM131B、BRAF/AKAP9融合基因的探针对，探针对中一个探针靶向BRAF基因，另一个探针靶向KIAA1549、SRGAP3、FAM131B、AKAP9基因中的一个，探针组每一个探针均采用phi29 DNA聚合酶进行探针标记。本发明专利技术还公开了一种用于检测BRAF相关融合基因的试剂盒，包括上述探针组和杂交缓冲液，杂交缓冲液中含有二甲基亚砜。本发明专利技术通过筛选到最优的BRAF基因和相关伙伴基因融合基因检测探针及其组合，采用FISH方法进行融合基因检测，信号计数行准确、快速，且结果的重复性好；本发明专利技术中首次将phi29 DNA聚合酶用于探针标记，建立phi29 DNA随机引物标记方法；结合精细的组分调整，其标记效果优于目前常用的缺口平移法。

Probe sets, kits and applications for detecting BRAF-related fusion genes

【技术实现步骤摘要】
用于检测BRAF相关融合基因的探针组、试剂盒及其应用
本专利技术涉及基因检测
，尤其是一种用于检测BRAF相关融合基因的探针组、试剂盒及其应用。
技术介绍
恶性原发性脑肿瘤约占恶性肿瘤的2％，发病高峰年龄为5～10岁及50～55岁。星形细胞瘤具高度侵袭性，据WHO规定，以肿瘤分化程度进行分级。与高度恶性特征的恶性胶质瘤(GBM；WHOIV级)和分化不良具不典型增生的间变性星形细胞瘤(WHOIII级)相比，纤维状细胞星形细胞瘤(I级)和毛细胞性星形细胞瘤(WHOI级)侵袭性较低，表现局限性，不易进展至间变期，多见于儿童和青少年。在低级别神经中枢肿瘤中常存在BRAF异常，异常涉及7q34区BRAF基因的随机重复和融合。研究认为BRAF基因异常激活MAPK通路，可能与低级别星形细胞瘤的发病相关，可能成为潜在的治疗靶点[1]。在低级别少突胶质瘤中也检测到BRAF拷贝数增加和BRAF-KIAA1549融合，回归分析显示BRAF拷贝数增加与1p/19q缺失显著正相关(P＝0.0032)，与TP53突变负相关(P＝0.0042)[2]。低级别星形细胞瘤中，BRAF-KIAA1549融合的患者本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.用于检测BRAF相关融合基因的探针组，其特征在于，所述探针组包括用于检测BRAF/KIAA1549、BRAF/SRGAP3、BRAF/FAM131B、BRAF/AKAP9融合基因的探针对，所述探针对中一个探针靶向BRAF基因，另一个探针靶向KIAA1549、SRGAP3、FAM131B、AKAP9基因中的一个，所述探针组每一个探针均采用phi29 DNA聚合酶进行探针标记。

【技术特征摘要】
1.用于检测BRAF相关融合基因的探针组，其特征在于，所述探针组包括用于检测BRAF/KIAA1549、BRAF/SRGAP3、BRAF/FAM131B、BRAF/AKAP9融合基因的探针对，所述探针对中一个探针靶向BRAF基因，另一个探针靶向KIAA1549、SRGAP3、FAM131B、AKAP9基因中的一个，所述探针组每一个探针均采用phi29DNA聚合酶进行探针标记。2.根据权利要求1所述的探针组，其特征在于，所述探针组进行探针标记时，采用随机六聚体引物进行扩增。3.根据权利要求1所述的探针组，其特征在于，所述探针组进行探针标记时，扩增温度为30℃，扩增时间为12小时。4.根据权利要求1所述的探针组，其特征在于，所述phi29DNA聚合酶在反应体系中的浓度为3U/uL。5.用于检测BRAF相关融合基因的试剂盒，其特征在...

【专利技术属性】
技术研发人员：陈绍宇，何瑰，
申请(专利权)人：广州安必平医药科技股份有限公司，
类型：发明
国别省市：广东,44