在边合成边测序中作为成像试剂的光保护混合物制造技术

技术编号:21855190 阅读:42 留言:0更新日期:2019-08-14 01:33
本发明专利技术涉及如本发明专利技术所述的方法、组合物、装置、系统和试剂盒,其包含,但不限于,用于使用例如通过边合成边测序方法来确定核苷酸序列中核酸的身份的试剂和混合物。特别地,本发明专利技术提供了化合物的光保护混合物作为成像试剂以提高包括但不限于带有荧光标记物的核苷酸的荧光化合物的稳定性和储存的用途。

Optical Protective Mixture as Imaging Reagent in Side Synthesis Side Sequencing

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】在边合成边测序中作为成像试剂的光保护混合物
本专利技术涉及如本专利技术所述的方法、组合物、装置、系统和试剂盒,其包含,但不限于,用于使用例如通过边合成边测序方法来确定核苷酸序列中核酸的身份的试剂和混合物。具体地,本专利技术提供了化合物的光保护混合物作为成像试剂以提高包括但不限于带有荧光标记物的核苷酸的荧光化合物的稳定性和储存的用途。
技术介绍
在过去25年中,已经产生并保存在Genbank中的DNA序列信息的量呈指数性增长。传统的测序方法(例如,如Sanger测序)正在被下一代测序技术替代,该下一代测序技术使用边合成边测序(SBS)的形式,其中使用专门设计的核苷酸和DNA聚合酶以受控的方式来读取芯片结合的单链DNA模板的序列。为了获得高通量,几百万个这样的模板斑点在测序芯片上组成阵列,它们的序列单独地被读出并记录。使用阵列进行DNA测序的系统是已知的(例如,Ju等人,美国专利号6,664,079)。然而,对于提高利用自动化测序对核酸序列进行测序的效率和/或试剂稳定性的方法和组合物一直存在着需求。
技术实现思路
本专利技术涉及如本专利技术所述的方法、组合物、装置、系统和试剂盒,其包含,但不本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种掺入标记的核苷酸的方法,所述方法包括:a)提供:i)多种核酸引物和模板分子,ii)聚合酶,iii)成像试剂,所述成像试剂包含化合物的光保护混合物,和iv)多种核苷酸类似物,其中所述核苷酸类似物的至少一部分用标记物标记,所述标记物通过可裂解接头连接到碱基;b)将所述引物的至少一部分与所述模板分子的至少一部分杂交,以产生杂交的引物;c)利用所述聚合酶将第一标记的核苷酸类似物掺入至所述杂交的引物的至少一部分中,以产生包含掺入的标记的核苷酸类似物的延伸引物;和d)在所述成像试剂的存在下将所述掺入的标记的核苷酸类似物成像。

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】2016.11.09 US 62/419,7021.一种掺入标记的核苷酸的方法,所述方法包括:a)提供:i)多种核酸引物和模板分子,ii)聚合酶,iii)成像试剂,所述成像试剂包含化合物的光保护混合物,和iv)多种核苷酸类似物,其中所述核苷酸类似物的至少一部分用标记物标记,所述标记物通过可裂解接头连接到碱基;b)将所述引物的至少一部分与所述模板分子的至少一部分杂交,以产生杂交的引物;c)利用所述聚合酶将第一标记的核苷酸类似物掺入至所述杂交的引物的至少一部分中,以产生包含掺入的标记的核苷酸类似物的延伸引物;和d)在所述成像试剂的存在下将所述掺入的标记的核苷酸类似物成像。2.权利要求1所述的方法,其中所述光保护混合物包含至少一种荧光猝灭抑制剂。3.权利要求2所述的方法,其中所述至少一种荧光猝灭抑制剂是奎诺二甲基丙烯酸酯。4.权利要求1所述的方法,其中所述光保护混合物进一步包括至少一种抗氧化剂和至少一种自由基清除化合物。5.权利要求4所述的方法,其中所述至少一种抗氧化剂选自2,5-二羟基苯甲酸、原儿茶酸和原儿茶酸乙酯。6.权利要求4所述的方法,其中所述至少一种自由基清除化合物是肉毒碱。7.权利要求1所述的方法,所述方法进一步包括步骤(e):利用所述聚合酶将第二核苷酸类似物掺入到所述延伸引物的至少一部分中。8.权利要求1所述的方法,其中所述标记物是荧光标记物。9.一种成像试剂,其包含至少一种抗氧化剂、至少一种荧光猝灭抑制剂和缓冲剂。10.权利要求9所述的成像试剂,其中所述至少一种抗氧化剂包含选自下组的化合物:2,5-二羟基苯甲酸、原儿茶酸和原儿茶酸乙酯。11.权利要求9所述的成像试剂,其进一步包含至少一种自由基清除剂。12.权利要求11所述的成像试剂,其中所述至少一种自由基清除剂是肉毒碱。13.权利要求9所述的成像试剂,其中所述荧光猝灭抑制剂是奎诺二甲基丙烯酸酯。14.权利要求9所述的成像试剂...

【专利技术属性】
技术研发人员:L·安德鲁齐M·佩尔博D·赫夫罗尼M·古普塔A·里克T·佩尔蒂埃
申请(专利权)人:奇根科学有限责任公司
类型:发明
国别省市:美国,US

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