一种半自动生成用于指导精准用药的基因检测报告的方法技术

本发明专利技术提供一种半自动生成用于指导精准用药的基因检测报告的方法，所述方法包括使用一种用于指导精准用药的基因检测智能报告系统；所述方法包括如下步骤：第一步、第一用户上传实验结果文件；第二步、系统自动匹配和判定，若结果是系统无法判定；第三步、第三用户人工选填一个结果至系统中；第四步、系统自动生成待审核的基因检测报告，即待审报告；第五步、第四用户人工审核所述“待审报告”，生成最终用于指导精准用药的基因检测报告。本发明专利技术所述方法中能由系统自动给出待审核的基因检测报告。本发明专利技术所述方法能快速智能、准确地给出用于指导精准用药的基因检测报告。

A Semi-automatic Gene Detection Reporting Method for Guiding Accurate Drug Use

【技术实现步骤摘要】
一种半自动生成用于指导精准用药的基因检测报告的方法
本专利技术涉及基因检测领域，具体涉及一种半自动生成用于指导精准用药的基因检测报告的方法。
技术介绍
基因与人类的生活息息相关，一个主要方面体现在基因对人类健康的重大影响，先天性的基因缺陷或后天性的基因突变与个体的身体健康，疾病的发生、发展有着密不可分的联系。随着基因与人类机体健康的关系被越来越多地发现、证实，为了满足社会对更好地预防和治疗基因相关疾病的需求，国内外涌现了众多提供基因检测技术服务的机构。医学检测报告作为医学检测服务的产品，其准确性和时效性一直是医学检测服务行业的追求。医学分子生物学检测所涉及的检测方法或平台多种多样，对不同平台的结果进行分析，所需要的知识背景不尽相同，分析标准也不尽相同。而提供检测服务的不同机构或者是同一机构的不同项目对于检测平台的采取和检测报告的内容、样式会有自身的考虑和要求。目前，大部分检测机构，仍采用纯人工的方式进行检测结果的判读，检测报告的出具，而且在检测报告样式的选择时也是采用人工区分。纯人工的工作方式效率低下，知识局限，注释片面，当面临大批量数据处理时，容易疲劳，影响工作质量，而当业务内容涉及到多个检测方法或平台时，对参加检测结果解读和分析的人员的能力和数量要求会提高。可见，纯人工的工作方式在增加人力成本和时间成本的同时，还会影响检测报告的准确性和时效性。现有的一些医学检测报告系统多针对类似生化常规的传统医学检测业务，少有的涉及基因检测的报告系统，只能针对一种平台的检测结果进行自动分析甚至需要靠人工分析后录入检测结果，智能化不够，适用性不强；而更少有的涉及精准用药相关的报告系统，对项目的定义不清晰，不便于理解，无法达成业内共识。另外，自动化检测报告的生成也只能既定一种标准化的报告样式，而无法同时满足不同机构或项目的个性化需求，而且缺少人工审核流程的嵌入。综上所述，现有检测报告系统可分析的检测平台的局限性以及频繁的人工操作可能引起的失误都将影响检测报告的准确性和时效性。专利技术专利申请CN201710468430提供一种基因检测产品报告系统及方法，所述系统包括：移动端销售服务系统，用于用户选择基因检测产品并下单支付并采集受检者的基本信息和样本绑定信息；临床样本管理系统，用于接收来自移动端销售服务系统的受检者的基本信息和样本绑定信息；实验室数据管理系统，用于存储样本从下订单开始到测序数据从测序仪转到指定存储位置为止；报告生成系统生成报告后存储到实验室数据管理系统中，并推送到移动端销售服务系统发送给指定的报告接收人；报告生成系统，用于接收来自临床样本管理系统的受检者基本信息和样本绑定信息及来自实验室数据管理系统的检测结果，生成报告。但从说明书中可见，该专利技术中用药知识的给出和报告的生成都依赖于人工完成，并不能自动生成基因检测报告。专利技术专利申请CN201810594702提供了一种氯吡格雷用药相关基因检测报告的自动出具系统，涵盖了患者基本信息、检测结果、检测结论、个体化用药建议等众多信息，能够对大量信息进行有效整合、集中展示，个体化用药建议部分可以统一编辑好后直接套用，也可以单独添加个性化备注信息；即使在检测例数较多的情况下，也可以根据基因检测仪器上的相关基因(CYP2C19、PON1和ABCB1基因)的基因型的结果快速、高效、准确地出具氯吡格雷用药相关基因检测报告，只要录入患者基本临床信息和基因检测结果，便可自动出具检测报告。避免了出具繁琐的报告时耗费的大量人力，可节约大量的时间成本，并可降低出具报告时的错误发生率，从而便于医护人员临床工作中的使用。该系统仅针对氯吡格雷这种单一的药物和相应的基因检测有效。专利技术专利申请CN201810883463提供了一种基于基因检测的健康指导报告生成方法、装置及服务器，包括首先获取用户基因检测结果及用户输入的待查询疾病的输入操作；然后根据预设的疾病与基因位点之间的对应关系确定与待查询疾病对应的基因位点信息；然后在用户基因检测结果中确定与基因位点信息对应的基因型信息；然后基于基因位点信息、基因型信息和预设的计算公式计算用户的健康指数；最后根据健康指数和预设的健康报告生成方式生成健康指导报告，以便于用户根据健康指导报告进行待查询疾病的预防和控制，解决了由于不了解基因情况难以准确的进行疾病预防和控制的技术问题，达到了帮助用户了解自身基因情况和健康情况，更好的进行疾病的预防和控制的技术效果。专利技术专利CN201410487501公开了一种自动生成基因检测报告的方法及装置，该方法包括：获取受检对象的遗传信息和样本信息；通过遗传信息查询基因数据库，获取与遗传信息对应的表征信息；调用基因检测报告的标准化模板，并将样本信息和与遗传信息对应的表征信息导入标准化模板中，自动生成基因检测报告。通过上述方式，本专利技术能够节约大量时间，保证准确性，及时使基因检测报告得到更新。上述系统均不能针对不同的基因检测项目自动出具含用药指导知识的检测报告。因此，本领域需要一种精准用药智能报告系统及生成报告的方法。
技术实现思路
本专利技术提供一种半自动生成用于指导精准用药的基因检测报告的方法，所述方法包括使用一种用于指导精准用药的基因检测智能报告系统，所述系统包括信息分析及处理模块(2)，所述信息分析及处理模块(2)包括信息自动匹配模块(21)和样本信息处理及分析模块(256)；所述信息自动匹配模块(21)包括实验文件信息自动匹配模块(254)、基因信息自动匹配模块(258)、用药知识信息自动匹配模块(261)和待审报告自动生成模块(255)，所述信息自动匹配模块(21)用于将系统中的信息与用户上传至系统中的实验结果文件进行自动匹配和解析；所述样本信息处理及分析模块(256)用于用户将实验结果文件上传至系统中以及在系统对实验结果文件进行自动解析之后用于人工处理样本信息；所述方法包括如下步骤：第一步、第一用户在样本信息处理及分析模块(256)中上传实验结果文件；第二步、系统中的实验文件信息自动匹配模块(254)和基因信息自动匹配模块(258)自动匹配和判定，若结果是系统无法判定；第三步、第三用户在样本信息处理及分析模块(256)中人工选填一个结果至系统中；第四步、系统中的用药知识信息自动匹配模块(261)和待审报告自动生成模块(255)自动生成待审核的基因检测报告，即待审报告；第五步、第四用户在样本信息处理及分析模块(256)中人工审核所述“待审报告”，生成最终用于指导精准用药的基因检测报告。在一种具体的实施方式中，最后一步中人工审核“待审报告”的步骤包括两个不同的第四用户先后审核，且具体为初审和复审；优选所述初审的第四用户与第三用户为同一用户，而与其余的第一用户和复审的第四用户均为不同的用户；更优选的，所述第一用户为“实验员用户”、第三用户为“数据分析用户”或“管理员用户”，第四用户为“数据分析用户”或“管理员用户”。在一种具体的实施方式中，所述系统还包括信息管理模块(1)，所述信息管理模块(1)包括药物基因对项目信息管理模块(149)；所述信息管理模块(1)主要用于提供整理后的信息资料以供系统选择和匹配；所述药物基因对项目信息管理模块(149)用于使用系统的用户在系统中新增和/或编辑管理药物基因对项目信息，所述药物基因对项目本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种半自动生成用于指导精准用药的基因检测报告的方法，所述方法包括使用一种用于指导精准用药的基因检测智能报告系统，所述系统包括信息分析及处理模块(2)，所述信息分析及处理模块(2)包括信息自动匹配模块(21)和样本信息处理及分析模块(256)；所述信息自动匹配模块(21)包括实验文件信息自动匹配模块(254)、基因信息自动匹配模块(258)、用药知识信息自动匹配模块(261)和待审报告自动生成模块(255)，所述信息自动匹配模块(21)用于将系统中的信息与用户上传至系统中的实验结果文件进行自动匹配和解析；所述样本信息处理及分析模块(256)用于用户将实验结果文件上传至系统中以及在系统对实验结果文件进行自动解析之后用于人工处理样本信息；所述方法包括如下步骤：第一步、第一用户在样本信息处理及分析模块(256)中上传实验结果文件；第二步、系统中的实验文件信息自动匹配模块(254)和基因信息自动匹配模块(258)自动匹配和判定，若结果是系统无法判定；第三步、第三用户在样本信息处理及分析模块(256)中人工选填一个结果至系统中；第四步、系统中的用药知识信息自动匹配模块(261)和待审报告自动生成模块(255)自动生成待审核的基因检测报告，即待审报告；第五步、第四用户在样本信息处理及分析模块(256)中人工审核所述“待审报告”，生成最终用于指导精准用药的基因检测报告。...

【技术特征摘要】
1.一种半自动生成用于指导精准用药的基因检测报告的方法，所述方法包括使用一种用于指导精准用药的基因检测智能报告系统，所述系统包括信息分析及处理模块(2)，所述信息分析及处理模块(2)包括信息自动匹配模块(21)和样本信息处理及分析模块(256)；所述信息自动匹配模块(21)包括实验文件信息自动匹配模块(254)、基因信息自动匹配模块(258)、用药知识信息自动匹配模块(261)和待审报告自动生成模块(255)，所述信息自动匹配模块(21)用于将系统中的信息与用户上传至系统中的实验结果文件进行自动匹配和解析；所述样本信息处理及分析模块(256)用于用户将实验结果文件上传至系统中以及在系统对实验结果文件进行自动解析之后用于人工处理样本信息；所述方法包括如下步骤：第一步、第一用户在样本信息处理及分析模块(256)中上传实验结果文件；第二步、系统中的实验文件信息自动匹配模块(254)和基因信息自动匹配模块(258)自动匹配和判定，若结果是系统无法判定；第三步、第三用户在样本信息处理及分析模块(256)中人工选填一个结果至系统中；第四步、系统中的用药知识信息自动匹配模块(261)和待审报告自动生成模块(255)自动生成待审核的基因检测报告，即待审报告；第五步、第四用户在样本信息处理及分析模块(256)中人工审核所述“待审报告”，生成最终用于指导精准用药的基因检测报告。2.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，最后一步中人工审核“待审报告”的步骤包括两个不同的第四用户先后审核，且具体为初审和复审；优选所述初审的第四用户与第三用户为同一用户，而与其余的第一用户和复审的第四用户均为不同的用户；更优选的，所述第一用户为“实验员用户”、第三用户为“数据分析用户”或“管理员用户”，第四用户为“数据分析用户”或“管理员用户”。3.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述系统还包括信息管理模块(1)，所述信息管理模块(1)包括药物基因对项目信息管理模块(149)；所述信息管理模块(1)主要用于提供整理后的信息资料以供系统选择和匹配；所述药物基因对项目信息管理模块(149)用于使用系统的用户在系统中新增和/或编辑管理药物基因对项目信息，所述药物基因对项目信息管理模块(149)中包含多个药物基因对项目，每个所述药物基因对项目包含一种或一类药物和一个或多个基因，所述药物基因对项目信息用于为系统自动识别和匹配实验文件信息和基因信息提供前提。4.根据权利要求3所述的方法，其特征在于，所述信息管理模块(1)还包括用药知识库信息管理模块(150)，且所述用药知识库信息管理模块(150)用于使用系统的用户新增和/或编辑管理用药知识库信息，所述用药知识库信息用于为系统在给出基因检测报告前自动获...

【专利技术属性】
技术研发人员：辛盛，孟海波，袁鹏，李琦，陈瑶顺，
申请(专利权)人：北京中佰耀因医药科技有限公司，
类型：发明
国别省市：北京,11