一种用于脊尾白虾科苏红1号分子鉴定的方法技术

本发明专利技术属于水产动物种质保护和应用领域，具体涉及一种用于脊尾白虾“科苏红1号”分子鉴定的方法。利用高通量测序技术和关联分析方法，开发了脊尾白虾“科苏红1号”新品种的2个特异性单核苷酸多态性(SNP)标记Ec53862‑167‑A/T和Ec53862‑181‑A/T，这两个标记均为A/T突变。这两个标记在“科苏红1号”个体中的基因型均为AA，而在普通脊尾白虾中均为TT或AT基因型。根据开发的这两个SNP标记，建立了通过SNP分型方法进行脊尾白虾“科苏红1号”新品种分子鉴定的方法。本发明专利技术为脊尾白虾“科苏红1号”的分子鉴定和品种保护提供了技术手段，也为脊尾白虾新品种的培育和推广应用提供了重要技术支撑。

【技术实现步骤摘要】
一种用于脊尾白虾科苏红1号分子鉴定的方法
本专利技术属于水产动物种质保护和应用领域，具体涉及一种用于脊尾白虾“科苏红1号”新品种的分子鉴定方法。
技术介绍
脊尾白虾又名小白虾，绒虾，迎春虾，系温热带海区底栖虾类。脊尾白虾具有繁殖能力强、生长速度快和环境适应性广等优点，近几年来已经发展成为我国东部沿海地区重要的养殖虾类品种。伴随着脊尾白虾养殖业的兴起，对于优质苗种的需求日益增长，然而目前脊尾白虾主要的养殖种质均来自于野生捕捞，经过多年的养殖后种质退化严重，制约了脊尾白虾养殖业的健康发展，脊尾白虾养殖产业急需性状优良的优良品种。人工选育是培育优良品种的有效途径，通过连续多代系统选育，能够显著提高目标性状，培育出性状优异的新品种。脊尾白虾“科苏红1号”是人工选育的脊尾白虾新品种，该品种2018年通过农业部审定，品种登记号为GS-01-004-2017。脊尾白虾“科苏红1号”新品种的特点是表皮和肌肉均为红色，且富含类胡萝卜素和虾青素，具有高营养、高附加值的优点，因此该品种具有广阔的推广应用前景。在推广应用过程中，为保护品种权和广大养殖户、消费者的利益，需要建立起准确的品种鉴定方法，从而保障品本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种用于脊尾白虾科苏红1号分子鉴定的方法，其特征在于：通过采用引物Ec53862F：CGACGACACATCAAAAATCGACA和Ec53862R：GTCTGTTTCACACTCAAGTCGAC扩增脊尾白虾基因组DNA序列并进行测序，获得SEQIDEc53862所示的核苷酸序列，根据测序结果对SEQIDEc53862序列167bp和181bp位置的SNP标记Ec53862‑167‑A/T和Ec53862‑181‑A/T进行分型，若两个标记的分型结果为AA纯合，则该脊尾白虾为“科苏红1号”新品种，若为AT杂合或者TT纯合，则为非“科苏红1号”的普通脊尾白虾。

【技术特征摘要】
1.一种用于脊尾白虾科苏红1号分子鉴定的方法，其特征在于：通过采用引物Ec53862F：CGACGACACATCAAAAATCGACA和Ec53862R：GTCTGTTTCACACTCAAGTCGAC扩增脊尾白虾基因组DNA序列并进行测序，获得SEQIDEc53862所示的核苷酸序列，根据测序结果对SEQIDEc53862序列167bp和181bp位置的SNP标记Ec53862-167-A/T和Ec53862-181-A/T进行分型，若两个标记的分型结果为AA纯合，则该脊尾白虾为“科苏红1号”新品种，若为AT杂合或者TT纯合，则为非“科苏红1号”的普通脊尾白虾。2.根据权利要求1所述的方法，其特征在于：用于鉴定脊尾白虾“科苏红1号”新品种的2个SNP标记Ec53862-167-A/T和Ec53862-181-A/T，该标记在脊尾白虾“科苏红1号”新品种中均为AA纯合，在普通脊尾白虾群体中为AT杂合或者TT纯合。3.根据权利要求1或2所述的方法，其特征在于：SEQIDEc53862具有序列表中SEQIDNO.1的脱氧核糖核酸(DNA)序列；SEQIDEc53862的核苷酸序列如下：ATTAAGTGAAAAGGTTGCTTTTATATACCCATAGACTTGACGACGACACATC...

【专利技术属性】
技术研发人员：李富花，于洋，金月，张成松，相建海，张晓军，
申请(专利权)人：中国科学院海洋研究所，
类型：发明
国别省市：山东,37