一种生物标志物、预测肾细胞癌的复发和死亡风险的方法技术

本发明专利技术公开了一种生物标志物及预测复发和死亡风险的方法，属于肾细胞癌监测技术，所述生物标志物用于预测肾细胞癌患者切除肿瘤后的复发或死亡风险，所述标志物为以下特征性基因组中的一组：Sig2.5、Sig0.83、Sig0.83sub1、Sig0.83sub2和Sigcmbn，通过检测所述的生物标志物中特征性基因组的表达情况，可以预测肾细胞癌患者的复发或死亡风险。本发明专利技术提供的一种生物标志具有能够有效地预估肾细胞癌患者肾脏切除后复发和死亡风险的优点，进而利于更好的对病人进行管理，针对性的对部分复发或死亡风险高的病人进行新型辅助治疗或靶向治疗。

【技术实现步骤摘要】
一种生物标志物、预测肾细胞癌的复发和死亡风险的方法
本专利技术属于肾细胞癌监测技术，具体涉及一种可以用于预测肾细胞癌的复发和死亡风险的生物标志物、以及预测肾细胞癌的复发和死亡风险的的方法。
技术介绍
肾癌分别是男性中第九位和女性中第十四位常见的癌症。肾细胞癌(renalcellcarcinoma，RCC)占肾癌的85％，最常见的亚型为透明细胞癌ccRCC(80％)，乳突细胞癌pRCC(15％)和嫌色细胞癌chromophobeRCC、(5％)。其中，ccRCC是恶性程度最高的、造成最多人死亡的，对于原位ccRCC最主要的治疗方式是全部以及部分肾脏切除，这些患者中，30-40％术后都会发生复发和转移。目前，ccRCC转移癌还是无法治愈，面对这一状况，其中一个改善方法是对原位ccRCC患者根据复发、转移以及死亡的危险系数进行分类，为进行早期针对性治疗提供有力参考。虽然现在临床上已经使用肿瘤分期来预测预后情况，但是更完善的系统需要生物标志物的加入。目前，研究者们已经发现了一系列新的血清和尿液标志物，包括循环肿瘤细胞，不在细胞内的循环肿瘤DNA，循环RNA以及一些蛋白。这些标志物还需要大量的验证。最近，ccRCC的生物标志物领域被进行了系统的评估和升级。在被检查的28个标志物中，ccB是根据肿瘤分期分级调整后唯一一个独立标志物，更多有效的ccRCC标志物有待被开发。IQGAP1属于支架蛋白家族(IQmotifGTPase-activatingscaffoldproteins，IQGAPs)中的一员，IQGAP1可以促进细胞外调节蛋白激酶(extracellularregulatedproteinkinases，ERK)的活化，结合Cdc42蛋白和Rac1蛋白，稳定GTP的结合从而导致细胞骨架重组。研究还发现，IQGAP1可以促进肿瘤发生，它在许多肿瘤中呈现过表达，其过表达水平与肿瘤细胞的侵袭和转移之间存在着密切的相关性，但是它在ccRCC中的作用还没有被报道过，因此IQGAP1和其它相关的分子生物网络在有效地预测肾脏透明细胞癌患者的复发和死亡风险方面具有广阔的应用前景。
技术实现思路
为了克服上述现有技术的缺陷，本专利技术所要解决的技术问题是：提供一种生物标志物及利用该生物标志物预测肾细胞癌复发和死亡风险的方法。为了解决上述技术问题，本专利技术采用的技术方案为：一种生物标志物，所述标志物用于预测肾细胞癌患者肾脏切除术后的复发或死亡风险，所述标志物至少包括以下两个基因：NSMAF、EIF4G3、COPB2、CDK20、AMIGO1、CABLES1、SLC25A42、RAB17、PGGHG、PLA2G6、SPACA6、TROAP、PDXDC2P-NPIPB14P、SLC25A27、UBE2C、VAMP1、PARP10、LRRC61、TOP3B、CENPW、IFFO1、PTPRB、SHE、RSPRY1、SEMA3G、UTP14C、AKAP6、NRP1、PLPP3、ANK3、AMOT、CAVIN2、GHR、NCOA4、RARB、SORBS2和GNE。一种生物标志物，所述标志物用于预测肾细胞癌患者肾脏切除术后的复发或死亡风险，所述标志物为以下特征性基因组中的一组：Sig2.5、Sig0.83、Sig0.83sub1、Sig0.83sub2和Sigcmbn；所述Sig2.5包括以下基因：NSMAF、EIF4G3、COPB2、CDK20、AMIGO1、CABLES1、SLC25A42和RAB17；所述Sig0.83包括以下基因：PGGHG、PLA2G6、SPACA6、TROAP、PDXDC2P-NPIPB14P、SLC25A27、UBE2C、VAMP1、PARP10、LRRC61、TOP3B、CENPW、IFFO1、PTPRB、SHE、RSPRY1、SEMA3G、UTP14C、AKAP6、NRP1、PLPP3、ANK3、AMOT、CAVIN2、GHR、NCOA4、RARB、SORBS2和GNE；所述Sig0.83sub1包括以下基因：SPACA6、TROAP、CENPW和NCOA4；所述Sig0.83sub2包括以下基因：PLA2G6、SPACA6、TROAP、PDXDC2P-NPIPB14P、UBE2C、VAMP1、TOP3B、CENPW、IFFO1、PTPRB、SHE、SEMA3G、UTP14C、AKAP6、PLPP3、ANK3、AMOT、CAVIN2、NCOA4、SORBS2和GNE；所述Sigcmbn包括以下基因：NSMAF、EIF4G3、COPB2、CDK20、AMIGO1、CABLES1、SLC25A42、RAB17、PGGHG、PLA2G6、SPACA6、TROAP、PDXDC2P-NPIPB14P、SLC25A27、UBE2C、VAMP1、PARP10、LRRC61、TOP3B、CENPW、IFFO1、PTPRB、SHE、RSPRY1、SEMA3G、UTP14C、AKAP6、NRP1、PLPP3、ANK3、AMOT、CAVIN2、GHR、NCOA4、RARB、SORBS2和GNE。进一步的，将所述生物标志物用于预测肾细胞癌患者肾脏切除术后的复发或死亡风险，所述肾细胞癌包括透明细胞癌和乳突细胞癌。进一步的，将所述生物标志物用于预测透明细胞癌患者肾脏切除术后的复发风险。进一步的，将所述生物标志物用于预测乳突细胞癌患者肾脏切除术后的复发风险。进一步的，将所述生物标志物用于预测乳突细胞癌患者肾脏切除术后的复发风险。进一步的，将所述生物标志物用于预测乳突细胞癌患者肾脏切除术后的死亡风险。进一步的，将所述生物标志物用于预测透明细胞癌患者肾脏切除术后的转移风险。进一步的，通过检测上述的生物标志物中特征性基因组的表达情况来预测肾细胞癌复发或死亡风险。进一步的，采用PCR、microarray、Nanostring或RNA测序的方法，以预测生物标志物中特征性基因组中基因的mRNA高表达和mRNA低表达。进一步的，对于生物标志物诊断阳性的标准，可以根据不同的人群和族群，以及使用不同的统计和计算机学习方法进行调整。进一步的，这些包含在生物标志物的基因也可以是这些基因的同种型或者基因的其它家族成员。进一步的，预测对象是人或哺乳动物。本专利技术的有益效果在于：本专利技术提供的生物标志物，充分利用IQGAP1作为新型生物标志物的潜在价值，开发出多个组特征性基因组及子特征基因组，可以有效且高效地用于预测肾细胞癌的复发与死亡风险，进而利于更好的对病人进行管理，针对性的对部分复发或死亡风险高的病人进行新型辅助治疗或靶向治疗。附图说明图1所示为IQGAP1上调与ccRCC总体生存率(OS)间的关系；图2所示为IQGAP1下调与ccRCC总体生存率间的关系；图3所示为两个特征性基因组的建立；图4所示为Sig2.5组成基因的变化；图5所示为Sig0.83组成基因的变化；图6所示为Sig2.5和Sig0.83和总体生存率间的关系；图7所示为Sig2.5和ccRCC死亡风险的详细描述；图8所示为Sig0.83和ccRCC死亡风险关联的详细描述；图9所示为Sig0.83的组成基因对ccRCC死亡风险的预测；图10所示为Sig2.5，Sig0.83以及它们的亚特征本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种生物标志物，其特征在于，所述标志物用于预测肾细胞癌患者肾脏切除术后的复发或死亡风险，所述标志物至少包括以下两个基因：NSMAF、EIF4G3、COPB2、CDK20、AMIGO1、CABLES1、SLC25A42、RAB17、PGGHG、PLA2G6、SPACA6、TROAP、PDXDC2P‑NPIPB14P、SLC25A27、UBE2C、VAMP1、PARP10、LRRC61、TOP3B、CENPW、IFFO1、PTPRB、SHE、RSPRY1、SEMA3G、UTP14C、AKAP6、NRP1、PLPP3、ANK3、AMOT、CAVIN2、GHR、NCOA4、RARB、SORBS2和GNE。

【技术特征摘要】
1.一种生物标志物，其特征在于，所述标志物用于预测肾细胞癌患者肾脏切除术后的复发或死亡风险，所述标志物至少包括以下两个基因：NSMAF、EIF4G3、COPB2、CDK20、AMIGO1、CABLES1、SLC25A42、RAB17、PGGHG、PLA2G6、SPACA6、TROAP、PDXDC2P-NPIPB14P、SLC25A27、UBE2C、VAMP1、PARP10、LRRC61、TOP3B、CENPW、IFFO1、PTPRB、SHE、RSPRY1、SEMA3G、UTP14C、AKAP6、NRP1、PLPP3、ANK3、AMOT、CAVIN2、GHR、NCOA4、RARB、SORBS2和GNE。2.根据权利要求1所述的生物标志物，其特征在于，所述标志物用于预测肾细胞癌患者肾脏切除术后的复发或死亡风险，所述标志物为以下特征性基因组中的一组：Sig2.5、Sig0.83、Sig0.83sub1、Sig0.83sub2和Sigcmbn；所述Sig2.5包括以下基因：NSMAF、EIF4G3、COPB2、CDK20、AMIGO1、CABLES1、SLC25A42和RAB17；所述Sig0.83包括以下基因：PGGHG、PLA2G6、SPACA6、TROAP、PDXDC2P-NPIPB14P、SLC25A27、UBE2C、VAMP1、PARP10、LRRC61、TOP3B、CENPW、IFFO1、PTPRB、SHE、RSPRY1、SEMA3G、UTP14C、AKAP6、NRP1、PLPP3、ANK3、AMOT、CAVIN2、GHR、NCOA4、RARB、SORBS2和GNE；所述Sig0.83sub1包括以下基因：SPACA6、TROAP、CENPW和NCOA4；所述Sig0.83sub2包括以下基因：PLA2G6、SPACA6、TROAP、PDXDC2P-NPIPB14P、UBE2C、VAMP1、TOP3B、CENPW、IFFO1、PTPRB、SHE...

【专利技术属性】
技术研发人员：唐大木，何立智，陈争，陈婧，林小曾，
申请(专利权)人：深圳市颐康生物科技有限公司，
类型：发明
国别省市：广东,44