用于癌症的诊断和治疗方法技术

本发明专利技术提供用于癌症的诊断和治疗方法和组合物。本发明专利技术提供基于本发明专利技术的生物标志物的表达水平(例如DUSP6，ETV4，SPRY2，SPRY4，PHLDA1，ETV5，DUSP4，CCND1，EPHA2，和EPHA4的表达水平)，确定具有癌症的患者是否有可能响应包含MAPK信号传导抑制剂的治疗的方法，预测具有癌症的患者对包含一种或多种MAPK信号传导抑制剂的治疗的响应性的方法，为具有癌症的患者选择疗法的方法，和治疗癌症的方法。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】用于癌症的诊断和治疗方法序列表本申请含有序列表，已经以ASCII格式电子提交且据此通过援引完整收录。2017年4月10日创建的所述ASCII拷贝命名为50474-133WO2_Sequence_Listing_4_10_17_ST25，而且大小为100,570个字节。专利
本专利技术涉及用于使用MAPK(例如丝裂原活化的蛋白质激酶)信号传导抑制剂治疗增殖性细胞病症(例如癌症)的诊断和治疗方法。还提供的是相关试剂盒和组合物。专利技术背景癌症仍然是人类健康的最致命威胁之一。某些癌症能以不受控制的方式快速生长和转移，使得及时检测和治疗极其困难。在美国，癌症每年侵袭几乎130万新患者，而且是位居心脏病之后的第二位死亡原因，大约占四例死亡中的一例。丝裂原活化的蛋白质激酶(MAPK)信号传导途径在超过30％的人癌症中，最常见在该途径的MEK/ERK分支中经由KRAS中和/或BRAF中的突变受到激活。RAS突变以90％的频率在胰腺肿瘤中发生，肺腺癌(非小细胞肺癌(NSCLC))肿瘤中35％，结肠直肠肿瘤中45％，和黑素瘤肿瘤中15％。BRAF突变在66％的黑素瘤肿瘤和12％的结肠直肠肿瘤中发生本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种鉴定可能受益于包含一种或多种MAPK(丝裂原活化的蛋白质激酶)信号传导抑制剂的治疗的具有癌症的患者的方法，该方法包括测定自该患者获得的样品中至少一种选自由DUSP6，ETV4，SPRY2，SPRY4，PHLDA1，ETV5，DUSP4，CCND1，EPHA2，和EPHA4组成的组的基因的表达水平，其中与参照水平相比该样品中该至少一种基因的升高的表达水平将该患者鉴定为可能受益于包含一种或多种MAPK信号传导抑制剂的治疗的患者。

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】2016.04.15 US 62/323,2101.一种鉴定可能受益于包含一种或多种MAPK(丝裂原活化的蛋白质激酶)信号传导抑制剂的治疗的具有癌症的患者的方法，该方法包括测定自该患者获得的样品中至少一种选自由DUSP6，ETV4，SPRY2，SPRY4，PHLDA1，ETV5，DUSP4，CCND1，EPHA2，和EPHA4组成的组的基因的表达水平，其中与参照水平相比该样品中该至少一种基因的升高的表达水平将该患者鉴定为可能受益于包含一种或多种MAPK信号传导抑制剂的治疗的患者。2.一种为具有癌症的患者的治疗优化治疗功效的方法，该方法包括测定自该患者获得的样品中至少一种选自由DUSP6，ETV4，SPRY2，SPRY4，PHLDA1，ETV5，DUSP4，CCND1，EPHA2，和EPHA4组成的组的基因的表达水平，其中与参照水平相比该样品中该至少一种基因的升高的表达水平指示该患者具有升高的可能性受益于包含一种或多种MAPK信号传导抑制剂的治疗。3.一种预测具有癌症的患者对包含一种或多种MAPK信号传导抑制剂的治疗的响应性的方法，该方法包括测定自该患者获得的样品中至少一种选自由DUSP6，ETV4，SPRY2，SPRY4，PHLDA1，ETV5，DUSP4，CCND1，EPHA2，和EPHA4组成的组的基因的表达水平，其中与参照水平相比该样品中该至少一种基因的升高的表达水平指示该患者具有升高的可能性受益于包含一种或多种MAPK信号传导抑制剂的治疗。4.一种为具有癌症的患者选择治疗的方法，该方法包括测定自该患者获得的样品中至少一种选自由DUSP6，ETV4，SPRY2，SPRY4，PHLDA1，ETV5，DUSP4，CCND1，EPHA2，和EPHA4组成的组的基因的表达水平，其中与参照水平相比该样品中该至少一种基因的升高的表达水平指示该患者具有升高的可能性受益于包含一种或多种MAPK信号传导抑制剂的治疗。5.权利要求1-4任一项的方法，其中该方法包括测定至少四种选自DUSP6，ETV4，SPRY2，SPRY4，PHLDA1，ETV5，DUSP4，CCND1，EPHA2，和EPHA4的基因的表达水平。6.权利要求5的方法，其中该至少四种基因包含DUSP6，ETV4，SPRY2，和SPRY4。7.权利要求5或6的方法，其中该方法包括测定至少五种选自DUSP6，ETV4，SPRY2，SPRY4，PHLDA1，ETV5，DUSP4，CCND1，EPHA2，和EPHA4的基因的表达水平。8.权利要求7的方法，其中该至少五种基因包含DUSP6，ETV4，SPRY2，SPRY4，和PHLDA1。9.权利要求5-8任一项的方法，其中该方法包括测定至少六种选自DUSP6，ETV4，SPRY2，SPRY4，PHLDA1，ETV5，DUSP4，CCND1，EPHA2，和EPHA4的基因的表达水平。10.权利要求9的方法，其中该至少六种基因包含DUSP6，ETV4，SPRY2，SPRY4，PHLDA1，和ETV5。11.权利要求5-10任一项的方法，其中该方法包含测定至少七种选自DUSP6，ETV4，SPRY2，SPRY4，PHLDA1，ETV5，DUSP4，CCND1，EPHA2，和EPHA4的基因的表达水平。12.权利要求11的方法，其中该至少七种基因包含DUSP6，ETV4，SPRY2，SPRY4，PHLDA1，ETV5，和DUSP4。13.权利要求5-12任一项的方法，其中该方法包括测定至少八种选自DUSP6，ETV4，SPRY2，SPRY4，PHLDA1，ETV5，DUSP4，CCND1，EPHA2，和EPHA4的基因的表达水平。14.权利要求13的方法，其中该至少八种基因包含DUSP6，ETV4，SPRY2，SPRY4，PHLDA1，ETV5，DUSP4，和CCND1。15.权利要求5-14任一项的方法，其中该方法包括测定至少九种选自DUSP6，ETV4，SPRY2，SPRY4，PHLDA1，ETV5，DUSP4，CCND1，EPHA2，和EPHA4的基因的表达水平。16.权利要求15的方法，其中该至少九种基因包含DUSP6，ETV4，SPRY2，SPRY4，PHLDA1，ETV5，DUSP4，CCND1，和EPHA2。17.权利要求5-16任一项的方法，其中该方法包括测定DUSP6，ETV4，SPRY2，SPRY4，PHLDA1，ETV5，DUSP4，CCND1，EPHA2，和EPHA4的表达水平。18.权利要求1-17任一项的方法，进一步包括确定MAPK活性得分，其中该MAPK活性得分是依照算法确定的，其中zi是在所有样品间或针对持家基因集合标准化的，每种基因的z得分，且n是构成该集合的基因的数目。19.权利要求18的方法，其中大于中值MAPK活性得分的MAPK活性得分是高MAPK活性得分且鉴定具有升高的可能性受益于包含一种或多种MAPK信号传导抑制剂的治疗的患者。20.权利要求18的方法，其中小于中值MAPK活性得分的MAPK活性得分是低MAPK活性得分且鉴定具有降低的可能性受益于包含一种或多种MAPK信号传导抑制剂的治疗的患者。21.权利要求1-20任一项的方法，其中该患者具有高MAPK活性得分且该方法进一步包括对该患者施用治疗有效量的一种或多种MAPK信号传导抑制剂。22.权利要求21的方法，其中施用一种或多种MAPK信号传导抑制剂是在测定至少一种基因的表达水平之后。23.权利要求21的方法，其中施用一种或多种MAPK信号传导抑制剂是在测定至少一种基因的表达水平之前。24.一种治疗具有癌症的患者的方法，其包括对该患者施用治疗有效量的一种或多种MAPK信号传导抑制剂，其中自该患者获得的样品中至少一种选自由DUSP6，ETV4，SPRY2，SPRY4，PHLDA1，ETV5，DUSP4，CCND1，EPHA2，和EPHA4组成的组的基因的表达水平已经测定是与参照水平相比升高的。25.权利要求24的方法，其中至少四种基因的表达水平已经测定是在该患者样品中相对于参照水平升高。26.权利要求25的方法，其中DUSP6，ETV4，SPRY2，和SPRY4的表达水平已经测定是在该患者样品中相对于参照水平升高。27.权利要求25或26的方法，其中至少五种基因的表达水平已经测定是在该患者样品中相对于参照水平升高。28.权利要求27的方法，其中DUSP6，ETV4，SPRY2，SPRY4，和PHLDA1的表达水平已经测定是在该患者样品中相对于参照水平升高。29.权利要求25-28任一项的方法，其中至少六种基因的表达水平已经测定是在该患者样品中相对于参照水平升高。30.权利要求29的方法，其中DUSP6，ETV4，SPRY2，SPRY4，PHLDA1，和ETV5的表达水平已经测定是在该患者样品中相对于参照水平升高。31.权利要求25-30任一项的方法，其中至少七种基因的表达水平已经测定是在该患者样品中相对于参照水平...

【专利技术属性】
技术研发人员：D·C·基鲁克，MC·瓦格尔，SM·黄，
申请(专利权)人：豪夫迈·罗氏有限公司，
类型：发明
国别省市：瑞士,CH