应用iTRAQ技术研究三阴性乳腺癌外泌体差异表达蛋白的方法技术

技术编号:19852101 阅读:290 留言:0更新日期:2018-12-22 10:10
本发明专利技术公开了一种应用iTRAQ技术研究三阴性乳腺癌外泌体差异表达蛋白的方法,包含以下步骤:(1)外泌体及外泌体蛋白质的提取处理;(2)对步骤(1)所得外泌体蛋白样品进行酶解和除盐得到多肽;(3)对步骤(2)所得多肽进行iTRAQ标记、混合;(4)对步骤(3)标记的多肽肽段混合物进行HPLC分离及LC‑MS分析;(5)对上述所得到质谱鉴定结果进行生物信息学分析、定量分析获取三阴性乳腺癌外泌体的差异表达蛋白。本发明专利技术提供的iTRAQ技术结合MS/MS技术能快速有效进行三阴性乳腺癌外泌体蛋白质组的研究,为研究三阴性乳腺癌的疾病机制以及发现三阴性乳腺癌相关的生物标志物提供参考。

【技术实现步骤摘要】
应用iTRAQ技术研究三阴性乳腺癌外泌体差异表达蛋白的方法
本专利技术涉及三阴性乳腺癌领域,具体涉及一种应用iTRAQ技术研究三阴性乳腺癌外泌体差异表达蛋白的方法。
技术介绍
三阴性乳腺癌(triple-negativebreastcancer,TNBC)是指雌激素受体(estrogenreceptor,ER)、孕激素受体(progesteronereceptor,PR)及人类上皮细胞生长因子受体2(humanepidermalgrowthfactorreceptor2,Her2)均无表达的一类乳腺癌,具有发病低龄化、恶性程度高,侵袭性强,仅有部分对放化疗敏感,具有治疗棘手及易复发的特征,在治疗后1~3年内为复发高峰期,大多数患者死于治疗的最初5年,是目前乳腺癌治疗最棘手的亚型之一。三阴性乳腺癌的致病机制和互作蛋白十分复杂,至今所知甚少。外泌体(exosomes)是一种由细胞分泌的、大小在30-120nm的膜状结构。其广泛存在于血液、尿液、唾液,等各种体液中。在外泌体被发现的初期,许多研究者认为外泌体可能是作为“垃圾袋”,用来存放细胞中各种不再需要的物质,然而,现在越来越多的实验证据本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.应用iTRAQ技术研究三阴性乳腺癌外泌体差异表达蛋白的方法,其特征在于,该方法包含以下步骤:(1)外泌体及外泌体蛋白质的提取处理;(2)对步骤(1)所得外泌体蛋白样品进行酶解和除盐得到多肽;(3)对步骤(2)所得多肽进行iTRAQ标记、混合;(4)对步骤(3)标记的多肽肽段混合物进行HPLC分离及LC‑MS分析;(5)对上述所得到质谱鉴定结果进行生物信息学分析、定量分析获取三阴性乳腺癌外泌体差异表达蛋白。

【技术特征摘要】
1.应用iTRAQ技术研究三阴性乳腺癌外泌体差异表达蛋白的方法,其特征在于,该方法包含以下步骤:(1)外泌体及外泌体蛋白质的提取处理;(2)对步骤(1)所得外泌体蛋白样品进行酶解和除盐得到多肽;(3)对步骤(2)所得多肽进行iTRAQ标记、混合;(4)对步骤(3)标记的多肽肽段混合物进行HPLC分离及LC-MS分析;(5)对上述所得到质谱鉴定结果进行生物信息学分析、定量分析获取三阴性乳腺癌外泌体差异表达蛋白。2.如权利要求1所述的应用iTRAQ技术研究三阴性乳腺癌外泌体差异表达蛋白的方法,其特征在于,外泌体及外泌体蛋白的提取处理分为实验组和对照组,实验组A为三阴性乳腺癌患者血液样品、对照组B为HER2阳性的乳腺癌患者血液样品、对照组C为正常人血液样品。3.如权利要求1所述的应用iTRAQ技术研究三阴性乳腺癌外泌体差异表达蛋白的方法,其特征在于,步骤(1)中外泌体的提取采用美国101Bio的试剂盒ExosomeIsolationKit从血浆中提取外泌体,外泌体蛋白的提取和处理包括蛋白裂解液裂解,DTT还原和IAM烷基化处理。4.如权利要求1所述的应用iTRAQ技术研究三阴性乳腺癌外泌体差异表达蛋白的方法,其特征在于,步骤(2)中蛋白质酶解除盐方法为利用胰蛋白酶对蛋白质进行酶解,利用C18柱对酶解后的肽段进行脱盐,真空冷冻干燥脱盐后的肽段得到多肽。5.如权利要求1所述的应用iTRAQ技术研究三阴性乳腺癌外泌体差异表达蛋白的方法,其特征在于,步骤(3)中多肽标记方法为采用iTRAQ-8标试剂盒对多肽进行标记。6.如权利要求1所述的应用iTRAQ技术研究三阴性乳腺癌外泌体差异表达蛋白的方法,其特征在于,步骤(4)具体包括:a)HPLC分离多肽肽段混合物;色谱仪:Ultimate3000HPLC系统;色谱柱:DurashellC18柱;流动相:流动相A为2%乙腈/0.1%甲酸/98%H2O,缓冲液B为98%乙腈/0.1%甲酸/2%H2O;流速:1ml/min;样品采集:每分钟收集一个样品,共收集42个样品组分,合并样品组分为12个组分,并用Strata-X柱进行脱盐,真空干燥脱盐后的样品即得到多肽样品;b)步骤a)真空干燥后的多肽样品溶解后进行质谱鉴定;质谱仪:TripleTOF5600plus+EksigentnanoLC系统;多肽样品溶液配制和捕获柱上样:将步骤a)真空干燥后的多肽样品溶解于2%...

【专利技术属性】
技术研发人员:李丽仙郑晓东辇伟奇廖斌杨薇伍青庞才双
申请(专利权)人:重庆市肿瘤研究所
类型:发明
国别省市:重庆,50

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