罹患食管基底细胞样鳞状细胞癌的鉴别方法技术

本发明专利技术提供一种容易且准确地鉴别食管癌患者的肿瘤是食管基底细胞样鳞状细胞癌还是其它的食管癌的方法。提供一种罹患食管基底细胞样鳞状细胞癌的辅助鉴别方法，该方法通过测定从受检者和健康人或健康人群采集的样本中的食管基底细胞样鳞状细胞癌标志物的表达水平，并基于得到的测定值，来判定受检者罹患食管基底细胞样鳞状细胞癌的可能性高。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】罹患食管基底细胞样鳞状细胞癌的鉴别方法
本专利技术涉及食管基底细胞样鳞状细胞癌标志物、和使用了该标志物的罹患食管基底细胞样鳞状细胞癌的鉴别方法。
技术介绍
基底细胞样鳞状细胞癌(Basaloidsquamouscellcarcinoma:BSC)是由Wain等人(非专利文献1)首先报告的咽喉区域的肿瘤，除咽喉区域以外，还报告有在食管、肺、肛门、子宫颈部、阴茎、膀胱等产生。食管基底细胞样鳞状细胞癌(Basaloidsquamouscellcarcinomaoftheesophagus：以下，在本说明书中，常简称为“BSCE”)是在食管癌中被分类为除食管鳞状细胞癌和食管腺癌以外的特殊组织学类型食管癌的较少见的癌，据说其在食管癌整体所占的比例在日本为1.0％～8.7％(非专利文献2～11)，在海外为0.4％～11.3％(非专利文献12～20)。BSCE的组织学特征被指出有：伴有中心坏死的实体性癌巢、筛状假腺泡状、导管样排列、腺样微囊肿样癌巢、玻璃样物质的沉积、鳞状细胞癌部分的并存等，但因组织学类型多样化，所以一般难以鉴别诊断。特别是需要与腺样囊性癌、小细胞癌、低分化型鳞状细胞癌、腺鳞癌进行正确的鉴别。另外，术前内窥镜活检中的BSCE诊断据说非常困难，准确率只不过为0～10％。目前为止，虽然有关于利用免疫染色(非专利文献3、6、10、12、14、15)、PCR(非专利文献21或22)来诊断BSCE的报告，但均未显示特异性。关于BSCE的预后，尚未获得一定的见解，但据说较食管鳞状细胞癌而言增殖能力、细胞学恶性程度高，并且对于晚期癌而言还有预后不良的报告(非专利文献23)。对于预后改善，认为除手术、放射线化学疗法以外，还需要确立新的多学科综合治疗法，但由于该疾病的稀少性和术前诊断的困难性，无法选择特征性治疗法，现状是按照常规型鳞状细胞癌进行治疗。因此，提高BSCE的术前诊断精度是必不可少的，但现有的方法无法解决该问题，希望确立一种精度高的BSCE诊断法。现有技术文献非专利文献非专利文献1:WainS.L.,etal.,1986,HumPathol17:1158-66非专利文献2:TakuboK.,etal.,1991,ActaPathologicaJaponica41:59-64非专利文献3:AbeK.,etal.,1996,AmericanJournalofSurgicalPathology20:453-461非专利文献4:KoideN.,etal.,1997,SurgeryToday27:685-691非专利文献5:KawaharaK.,etal.,2001,Reportofacase.SurgeryToday31:655-659非专利文献6:OhashiK.,etal.,2003,PathologyResearchandPractice199:713-721非专利文献7:YoshiokaS.,etal.,2004,JapaneseJournalofGastroenterologicalSurgery37:290-295非专利文献8:KobayashiY.,etal.,2009,DiseasesoftheEsophagus22:231-238非专利文献9:SaitoS.,etal.,2009,Esophagus6:177-181非专利文献10:ImamhasanA.,etal.,2012,HumanPathology43:2012-2023非专利文献11:TachimoriY.,etal.,2008,Esophagus12:130-157非专利文献12:SarbiaM.,etal.,1997,Cancer79:1871-1878非专利文献13:ZhangX.H.,etal.,1998,WorldJournalofGastroenterology4:397-403非专利文献14:ChoK.J.,etal.,2000,Histopathology36:331-340非专利文献15:HuangZ.,etal.,2001,Chinesemedicaljournal114:1084-1088非专利文献16:LamK.Y.,etal.,2001,JournalofPathology195:435-442非专利文献17:KlaaseJ.M.,etal.,2003,AnnalsofSurgicalOncology10:261-267非专利文献18:LiT.J.,etal.,2004,ArchivesofPathologyandLaboratoryMedicine128:1124-1130非专利文献19:ChenS.B.,etal.,2012,JournalofCancerResearchandClinicalOncology138:1165-1171非专利文献20:ZhangB.H.,etal.,2013,AsianPacificJournalofCancerPrevention14:1889-1894非专利文献21:SarbiaM.,etal.,1999,AmericanJournalofPathology155:1027-1032非专利文献22:BellizziA.M.,etal.,2009,AmericanJournalofSurgicalPathology33:1608-1614非专利文献23:AraiT.,etal.,2011,Esophagus8:169-177
技术实现思路
本专利技术开发并提供一种能够容易且准确地鉴别食管癌患者的肿瘤是BSCE还是其它的食管癌的方法。本专利技术人等为了解决上述课题，对从多个食管癌患者摘出的癌组织和正常组织使用全面广泛的基因表达分析技术而获取基因表达谱，找出在BSCE与除其以外的食管癌及正常部位之间表达水平有较大差异的70种基因的基因群。然后，开发出通过测定受检者和健康人的样本中的这些基因的表达水平，能够容易且准确地鉴别BSCE与其它食管癌的方法。本专利技术是基于该见解而进行的，提供以下技术。(1)一种罹患食管基底细胞样鳞状细胞癌的辅助鉴别方法，包括下述工序：测定工序，在从受检者和健康人或健康人群采集的样本中测定5种基因的每单位量的表达水平而获得其测定值，其中，该5种基因分别含有序列号141～145表示的碱基序列；计算工序，基于上述测定工序中得到的测定值，由受检者和健康人或健康人群的测定值计算各基因的表达比，得到该表达比的合计值，或者在受检者和健康人群中由各自的上述测定工序中测定的全部基因的测定值计算平均测定值；判定工序，基于上述计算工序中得到的值，在合计值大于从ROC曲线导出的规定的截断值的情况下，或者受检者的平均测定值在统计学上显著大于健康人群的平均测定值的情况下，判定该受检者罹患食管基底细胞样鳞状细胞癌的可能性高。(2)根据(1)所述的方法，其中，含有上述序列号141～145表示的碱基序列的基因分别编码由序列号71～75表示的氨基酸序列构成的蛋白质。(3)根据(2)所述的方法，其中，编码由上述序列号71～75表示的氨基酸序列构成的蛋白质的基因分别由序列号1～5表示的碱基序列构成。(4)根据(1)～(3)中任一项所述的方法，其中，在上述测定工序中，进一步测定一种以上的分别含有序列号本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种罹患食管基底细胞样鳞状细胞癌的辅助鉴别方法，包括下述工序：测定工序，在从受检者和健康人或健康人群采集的样本中测定5种基因的每单位量的表达水平而得到其测定值，所述5种基因分别含有序列号141～145表示的碱基序列；计算工序，基于所述测定工序中得到的测定值，由受检者和健康人或健康人群的测定值计算各基因的表达比，得到该表达比的合计值，或者在受检者和健康人群中由各自的所述测定工序中测定的全部基因的测定值计算平均测定值；判定工序，基于所述计算工序中得到的值，在合计值大于由ROC曲线导出的规定的截断值的情况下，或者受检者的平均测定值在统计学上显著大于健康人群的平均测定值的情况下，判定该受检者罹患食管基底细胞样鳞状细胞癌的可能性高。

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】2016.02.10 JP 2016-0241291.一种罹患食管基底细胞样鳞状细胞癌的辅助鉴别方法，包括下述工序：测定工序，在从受检者和健康人或健康人群采集的样本中测定5种基因的每单位量的表达水平而得到其测定值，所述5种基因分别含有序列号141～145表示的碱基序列；计算工序，基于所述测定工序中得到的测定值，由受检者和健康人或健康人群的测定值计算各基因的表达比，得到该表达比的合计值，或者在受检者和健康人群中由各自的所述测定工序中测定的全部基因的测定值计算平均测定值；判定工序，基于所述计算工序中得到的值，在合计值大于由ROC曲线导出的规定的截断值的情况下，或者受检者的平均测定值在统计学上显著大于健康人群的平均测定值的情况下，判定该受检者罹患食管基底细胞样鳞状细胞癌的可能性高。2.根据权利要求1所述的方法，其中，含有所述序列号141～145表示的碱基序列的基因分别编码由序列号71～75表示的氨基酸序列构成的蛋白质。3.根据权利要求2所述的方法，其中，编码由所述序列号71～75表示的氨基酸序列构成的蛋白质的基因分别由序列号1～5表示的碱基序列构成。4.根据权利要求1～3中任一项所述的方法，其中，在所述测定工序中，进一步测定一种以上的分别含有序列号146～148表示的碱基序列的基因的每单位量所含的表达量。5.根据权利要求4所述的方法，其中，含有所述序列号146～148表示的碱基序列的基因分别编码由序列号76～78表示的氨基酸序列构成的蛋白质。6.根据权利要求5所述的方法，其中，编码由所述序列号76～78表示的氨基酸序列构成的蛋白质的基因分别由序列号6～8表示的碱基序列构成。7.根据权利要求1～6中任一项所述的方法，其中，在所述测定工序中，进一步测定一种以上的分别含有序列号149～153表示的碱基序列的基因的每单位量所含的表达量。8.根据权利要求7所述的方法，其中，含有所述序列号149～153表示的碱基序列的基因分别编码由序列号79～83表示的氨基酸序列构成的蛋白质。9.根据权利要求8所述的方法，其中，编码由所述序列号79～83表示的氨基酸序列构成的蛋白质的基因分别由序列号9～13表示的碱基序列构成。10.根据权利要求1～9中任一项所述的方法，其中，在所述测定工序中，进一步测定一种以上的分别含有序列号154～210表示的碱基序列的基因的每单位量所含的表达量。11.根据权利要求10所述的方法，其中，含有所述序列号154～210表示的碱基序列的基因分别编码由序列号84～140表示的氨基酸序列构成的蛋白质。12.根据权利要求11所述的方法，其中，编码由所述序列号84～140表示的氨基酸序列构成的蛋白质的基因分别由序列号14～70表示的碱基序列构成。13.根据权利要求1～12中任一项所述的方法，其中，所述基因的每单位量的表达水平以该基因的mRNA或其核苷酸片段、或者该基因所编码的蛋白质或其肽片段的每单位量的绝对量或相对量的形式来测定。14.根据权利要求1～13中任一项所述的方法，其中，在所述判定工序中，受检者的...

【专利技术属性】
技术研发人员：渡边慎哉，今井顺一，伊藤惠美，森泽学，多田武志，后藤满一，木暮道彦，富樫玲子，西川晓，松仓进，
申请(专利权)人：公立大学法人福岛县立医科大学，株式会社日本基因，株式会社梅迪克罗姆，
类型：发明
国别省市：日本,JP