IARS2基因作为白血病检测的生物标志物的应用制造技术

本发明专利技术发现并确认了IARS2基因作为白血病检测的生物标志物的应用，具体可用于制备检测白血病的试剂或含有该试剂的试剂盒；相应的，某试剂中含有检测IARS2基因的相应试剂，或者包含有上述某试剂的试剂盒，即能够用于检测白血病。应用本发明专利技术检测白血病，灵敏度高、特异性强、快速简便，有望成为白血病早期诊断和预后预测的重要手段。

Application of IARS2 gene as a biomarker for leukemia detection

The invention discovers and confirms the application of IARS2 gene as a biomarker for leukemia detection, which can be used to prepare a reagent for leukemia detection or a reagent kit containing the reagent; correspondingly, a reagent containing the corresponding reagent for detecting IARS2 gene or a reagent kit containing the reagent can be used for detection. Leukemia. The method has the advantages of high sensitivity, strong specificity, fast and simple, and is expected to become an important means for early diagnosis and prognosis prediction of leukemia.

【技术实现步骤摘要】
IARS2基因作为白血病检测的生物标志物的应用
本专利技术属于生物医学领域，涉及一种特定基因作为检测白血病的标志物的应用。
技术介绍
白血病是一类常见的造血干祖细胞恶性克隆性疾病，因白血病细胞自我更新增强、增殖失控、分化障碍、凋亡受阻，而停留在细胞发育的不同阶段。白血病的发病率在中国为3-4/10万，在恶性肿瘤所致的死亡率位居第六位(男)、第七位(女)；在儿童及35岁以下成人中死亡率更是名列前茅，是严重危害人类身体健康的恶性疾病之一。我国急性白血病较慢性白血病多见(约5.5:1)，其中急性髓系白血病发病率最高(1.62/10万)。急性髓细胞白血病(AML)是成人确诊的最常见的急性白血病类型，在儿童最常见的白血病中位列第二，发病率约为15-20％，多达40％的AML患儿可以复发。细胞遗传学、分子生物学及治疗靶点识别技术的发展，推动了靶向治疗及分层治疗水平的进步，明显提高了AML临床疗效及总体生存率。但临床仍有部分难治性病例无法得到根治，同时对有些预后良好者又存在不同程度的过度治疗问题。随着研究的不断深入，细胞遗传学和分子生物学技术在临床白血病患者的诊断及治疗中的应用越来越广泛，已经成为白血病患者的常规检测项目之一。在疾病的诊断、治疗、微小残留病(mininalresidualdisease，MRD)的监测及预后判断等多个方面均发挥了重要作用。NCCN的AML指南和中国AML(非APL)诊疗指南中专家共识均指出AML预后分组中预后良好组细胞遗传学包括t(8；21)(q22；q22)、inv(16)(p13；q22)、t(16；16)(p13；q22)、t(15；17)，分子生物学包括正常核型伴NPM1突变，但在临床治疗中这类患者仍有部分难治和复发病例；预后不良组分子异常包括正常核型伴有单独的FLT3-ITD，而高危的FLT3-ITD阳性AML患者仍有明显的异质性，部分患者经常规诱导治疗可达完全缓解(completeremission，CR)，后续行造血干细胞移植(hematopoieticstemcelltransplantation，HSCT)可长期生存。因此需探究目前尚未明确的其他复杂因素的影响，如免疫因素、粘附分子及炎症因子表达等的作用。
技术实现思路
申请人对IARS2基因进行了研究，具体如下：IARS2是编码异亮氨酰-tRNA合成酶的基因，属于I类氨酰-tRNA合成酶，位于1号染色体4区1带，其主要功能是在胞浆中合成异亮氨酸-tRNA合成酶，然后转运至线粒体，催化异亮氨酸与tRNA结合，完成mtDNA的翻译。研究显示，氨酰-tRNA合成酶除了其经典的参与蛋白质合成的功能外，还参与了多种生命活动，包括细胞调亡、新生血管形成、RNA剪接和免疫等[17]。另有研究表明，IARS2是一种促癌基因，沉默此基因可以抑制肿瘤细胞的增殖，与细胞凋亡关系密切。研究发现，IARS2基因高表达的胶质母细胞瘤患者的生存期明显低于IARS2低表达者。研究结果表明，IARS2在癌组织的表达明显高于周围的正常组织，而当抑制ISARS2基因表达后，癌细胞阻滞于G1期，S期细胞减少，增殖能力明显下降，凋亡率增加。另外，也有研究发现，沉默IARS2基因可通过下调P-Smad2、P-JUK等的细胞周期蛋白磷酸化，使胃癌细胞阻滞于G2/M期，从而达到抑制细胞增殖的目的，而P-JUK是MAPK信号通路的重要组成部分，与细胞增殖、凋亡及炎症的发生有关。在以上研究结论的基础上，本专利技术确立了IARS2基因可作为检测白血病的标志物，进而得出以下方案：第一方面，提供了IARS2基因的一种用途，用于制备检测白血病的试剂或试剂盒。进一步的，所述的检测为血清学检测或血液学检测。进一步的，所述的试剂包括引物、探针、核酸芯片等。第二方面，提供了一种用于检测白血病的试剂或试剂盒，所述的试剂或试剂盒中含有检测IARS2基因的相应试剂。进一步的，所述的检测IARS2基因的相应试剂选自下组：PCR检测试剂、分子杂交检测试剂等。可在试剂盒中添加标签或说明书，所述标签或说明书注明所述试剂盒用于检测白血病。本专利技术的效果如下：应用本专利技术进行白血病检测，灵敏度高、特异性强、快速简便，将成为白血病早期诊断和预后预测的重要手段。附图说明图1.IARS2基因在Jurkat，HL-60，THP-1和K562四种白血病模式细胞中mRNA的表达。图2.CCK8检测目的基因对于白血病模式细胞HL-60增殖的影响。图3.FACS检测IARS2基因对白血病模式细胞HL-60细胞周期的影响。图4.IARS2基因消减对白血病模式细胞HL-60Caspase3/7活性的影响。具体实施方式本领域的普通技术人员可以通过常规方法获得IARS2基因的核苷酸序列，例如从NCBI、Genebank等数据库获取。1.IARS2基因在白血病模式细胞中mRNA的表达使用含10％FBS的RPMI-1640培养液培养；白血病模式细胞使用含10％FBS的DMEM培养。培养条件均为37℃、5％CO2、饱和湿度培养箱。HL-60细胞呈悬浮生长，293TN细胞为贴壁生长。细胞接种密度为每毫升1×105个，每2-3d传代1次。收集细胞到一个离心管中，然后加入1-2倍吸取量的PBS充分混匀，室温1500rpm离心5min。离心结束后弃上清，重新加入1mlPBS重悬离心管中的细胞团块，并移至1.5ml的EP管中，室温1500rpm离心5min。尽可能的去除残留的PBS，根据EP管中团块的量进行分装。分别用于mRNA和蛋白质的检测。将需要提取总RNA的细胞室温静置5分钟，用12000g转速4℃离心5分钟，而后将上清转移至新的1.5mlRNase-free的EP管中。在新的EP管中加入200μl的氯仿，振荡混匀，室温静置5分钟，用12000g转速4℃离心15分钟。吸取上清液转移至新的1.5mlRNase-free的EP管中，加入600μl的异丙醇。上下颠倒数次后室温静置10分钟，用12000g转速4℃离心15分钟。小心弃去上清，加入1ml75％乙醇清洗沉淀，用7500g转速4℃离心5分钟。轻轻弃上清保留沉淀，打开EP管盖，室温干燥10分钟左右。而后加入适量的RNase-free水溶解沉淀。进行RNA纯度和浓度的测定。RNA纯度和浓度测定后，即可进行逆转录实验。按照PrimeScriptTMRTMasterMix(PerfectRealTime)试剂盒说明步骤将RNA逆转录为cDNA。逆转录的反应条件如下：37℃，15分钟；85℃，5秒；4℃，10秒。样本保存于-80℃冰箱中以供后续实验检测。该实验重复三次，最后数据做统计学分析。结果：以GAPDH为内参的QPCR结果提示IARS2基因在模式细胞HL-60中表达较高(图1)。上图纵坐标为ΔCt，ΔCt＝目的基因Ct值-内参基因Ct值，ΔCt相对较大的细胞，目的基因表达丰度相对较低。2.IARS2基因在白血病模式细胞增殖的影响NADPH氧化酶亚单位等参与白血病细胞凋亡的分子机制研究需要设计合成特异性siRNA，转染方法参照HiPerFectTMtransfectionreagent试剂盒说明书进行。本研究所用的目的基因siRNA以及阴性对照siRNA由美国Invitrogen公司设计和本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.IARS2基因的用途，用于制备检测白血病的试剂或含有该试剂的试剂盒。

【技术特征摘要】
1.IARS2基因的用途，用于制备检测白血病的试剂或含有该试剂的试剂盒。2.根据权利要求1所述的用途，其特征在于：所述的检测为血清学检测或血液学检测。3.根据权利要求1所述的用途，其特征在于：所述的试剂为引物、探针或核酸芯片。4.一种用于检测白血病...

【专利技术属性】
技术研发人员：李宏，董昌虎，田亚宁，
申请(专利权)人：陕西中医药大学第二附属医院，
类型：发明
国别省市：陕西,61