用于农业生产和性能管理的基因组技术制造技术

一种农业管理和分析系统，其用于分析、解释和显现遗传数据，以改善农业如家畜的生产、性能和管理。

Genome technology for agricultural production and performance management

An agricultural management and analysis system used to analyze, interpret and display genetic data in order to improve the production, performance and management of agriculture, such as domestic animals.

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】用于农业生产和性能管理的基因组技术相关申请的交叉引用本申请根据35U.S.C.§119(e)要求名称为“GENOMICTECHNOLOGIESFORAGRICULTUREPRODUCTIONANDPERFORMANCEMANAGEMENT”的美国临时专利申请序列号62/192,598的优先权，所述美国临时专利申请于2015年7月15日提交，通过引用整体并入本文。
本公开涉及用于农业生产和性能管理的基因组技术。更具体而言，本公开涉及用于分析、解释和显现遗传数据的农业管理和分析系统，以便改善农业(例如家畜和作物)的生产、性能和管理。
技术介绍
尽管其不稳定和不可预测的性质，农业(如生长作物、饲养家畜等)仍对跨越全球的经济至关重要。凭借其自然资源和土地条件，美国(U.S.)是世界上主要的农业生产国之一，特别是因为它涉及作物和家畜。例如，美国是世界上最大的牛肉生产国和第二大牛肉出口国。实际上，在2012年，美国农业总销售额为3946亿美元，其中该总数中的1822亿美元归于家畜销售收入(美国农业部(UnitedStatesDepartmentofAgriculture,USDA)国家农业统计服务(NationalAgriculturalStatisticsService,NASS)，2012年农业普查)。这些销售大部分来自家畜或家畜产品，例如牛/小牛(例如牛肉和牛奶)、家禽(例如鸡蛋和鸡肉)和公猪(例如猪肉)。然而，由于估计到2050年人口为约100亿，对于家畜生产系统仍有满足日益增长的食物需求以及预期全球上升60%的全球家畜生产系统的可预知挑战。由于预计全世界要多供养30亿人，对于食物(例如家畜和乳制品)的全球需求只会继续指数增加。为了满足这一需求，农场主将不得不在遇到不可预知的环境和经济挑战的同时增加其农业生产，所述挑战例如土地流失、水荒、污染增加、政治不稳定性、有限的生物能源资源和气候变化。农业是经常受气候变化打击最严重的经济部门。例如，由于全球气候变化导致的较高温度引起的热应激可以严重影响作物和家畜，并且随着时间过去会增加对寄生虫和疾病的易感性。同样有害的是，干旱会减少家畜可用的优质饲料的量，并且因此抑制健康和良好状态，以及最终家畜的经济价值。相应地，美国食品和药物管理局(U.S.FoodandDrugAdministration,FDA)近期已要求动物健康公司主动改变其产品标签，以防止农场主在饲料中使用抗生素来促进家畜的增强生长。在家畜中使用抗生素已经流行了四十多年。迄今为止，许多家畜生产者对动物饲喂低剂量的抗生素以促进更快的生长。所提议的美国FDA法规要求牧场主获得兽医处方，以使用抗生素来预防动物中的疾病，并且家畜生产者将不再被允许使用抗生素来增强生长速率或改善饲料效率。相应地，新的美国FDA法规将很可能对通常薄利运营的家畜生产者造成经济困难。所提议的对家畜中的抗生素使用的政府限制连同全球食品需求中的预期增加一起，使得农业生产者的当前决策甚至更昂贵和关键。传统上，家畜农场主已习惯于借助于一些标准操作程序(SOP)，基于长期经验做出畜牧和农业管理决定。因而，在过去十年中，基因组工具已逐渐被大型农业公司和业务采用。公司例如Zoetis、Cargill和Alltech已涉及帮助大型生产者在涉及家畜生产时更高效。但是，设计用于大规模家畜生产者的这种遗传服务的成本通常超出大多数农场主所能及的范围。另外，个体生产者的家畜遗传数据的递送、分析和解释的方法可能非常复杂、耗时且难以解码或破译，尤其是对于可能并非技术精通的小农场主。事实上，这样的农场主通常不具有可得的资源，以使用这种高水平技术来评价决定。相反，小生产者被束缚于基本实践集合，具有有限的误差窗口以响应市场、天气、成本波动等做出调整。例如，对小生产者的主要挑战是确定如何依靠通常是不准确或难以理解的商业估价数据，来评价活的动物的品质。同样，小农场主基于高水平的基因数据做出明智的决定可能是不太可能的。本公开涉及解决该问题，并且具体涉及软件系统或工具，以帮助用户分析、解释和显现从动物收集的遗传数据以帮助做出关键的决策，并且提供关于其的意见和建议。特别地，本公开涉及提供遗传信息的平台技术，所述遗传信息包括作物和动物的遗传概况和育种、营养、谱系追踪以及估价。最终，本公开的技术帮助促进最佳动物营养和农业性能和利润率的管理。专利技术概述本公开涉及用于管理农业农场中的农产品的方法。该方法包括通过远程计算和存储服务器从用户接收登记细节，其中所述登记细节限定农产品的一个或多个特征。该方法还包括通过远程计算和存储服务器从用户接收遗传数据，其中所述遗传数据限定待分析的农产品的一种或多种基因标记。另外，该方法包括分析遗传数据。该方法还包括基于遗传数据生成农产品的遗传概况。此外，该方法包括通过远程计算和存储服务器基于遗传数据的分析来生成农产品的遗传概况。最后，该方法包括通过远程计算和存储服务器呈现基于登记细节和遗传概况的反馈。本方法的分析遗传数据的一个实施方案包括分析至少一个遗传测试样品，其包括从农产品获得的一种或多种基因标记。分析遗传测试样品的另外的实施方案包括经由特异性标识符来识别农产品，其中所述特异性标识符包含条形码。本方法的接收限定农产品的一个或多个特征的登记细节的一个实施方案包括接收限定作物或家畜的一个或多个特征的登记细节。本方法的呈现反馈的一个实施方案包括呈现营养建议、育种意见、市场估价、市场预测和谱系追踪中的至少一个。本方法的接收遗传细节的一个实施方案包括接收基因组数据、蛋白质组数据、代谢组学数据和生物信息学数据中的至少一种。另外，本公开的基因组数据可以是DNA测序数据、RNA测序数据或基因表达数据中的至少一种。用于在农业农场中管理农产品的本方法还可以包括通过远程计算和存储服务器分析遗传概况，并且通过远程计算和存储服务器基于遗传概况的分析来确定反馈。该方法可以进一步包括通过远程计算和存储服务器基于遗传概况的分析结果来执行自动化功能。本方法的执行自动化功能可以包括生成且传输以下中的至少一个：(i)对用户的通知，和(ii)对与农业农场的机械化装置相关的执行器的命令。本方法的生成对用户的通知可以包括生成电子邮件、文本消息和应用程序内通知中的至少一个。该方法可以进一步包括基于遗传概况的分析结果，经由计算装置的显示器呈现对用户的反馈。用于管理农业农场中的农产品的本方法还可以包括通过远程计算和存储服务器接收与农产品相关的更新的农产品数据。该方法可以进一步包括通过远程计算和存储服务器分析遗传概况和更新的农产品数据。另外，该方法可以包括通过远程计算和存储服务器基于遗传概况和更新的农产品数据的分析来确定反馈。本专利技术的方法可以进一步包括通过远程计算和存储服务器基于遗传概况和更新的农产品数据的分析结果来执行自动化功能。本方法的执行自动化功能可以包括以下中的至少一个：(i)生成且传输对用户的通知，以及(ii)生成且传输对与农业农场的机械化装置相关的执行器的命令。另外，生成对用户的通知可以包括生成电子邮件、文本消息和应用内通知中的至少一个。本方法可以进一步包括基于遗传概况和更新的农产品数据的分析结果，经由计算装置的显示器呈现对用户的反馈。本方法的用于管理农业农场中的农产品的远程计算和本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种用于管理农业农场中的农产品的方法，所述方法包括：通过远程计算和存储服务器从用户接收登记细节，其中所述登记细节限定农产品的一个或多个特征；通过远程计算和存储服务器从用户接收遗传数据，其中所述遗传数据限定待分析的农产品的一种或多种基因标记；分析所述遗传数据；基于所述遗传数据，生成所述农产品的遗传概况；通过所述远程计算和存储服务器，基于所述遗传数据的分析来生成所述农产品的遗传概况；和通过所述远程计算和存储服务器，基于所述登记细节和所述遗传概况来呈现反馈。

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】2015.07.15 US 62/1925981.一种用于管理农业农场中的农产品的方法，所述方法包括：通过远程计算和存储服务器从用户接收登记细节，其中所述登记细节限定农产品的一个或多个特征；通过远程计算和存储服务器从用户接收遗传数据，其中所述遗传数据限定待分析的农产品的一种或多种基因标记；分析所述遗传数据；基于所述遗传数据，生成所述农产品的遗传概况；通过所述远程计算和存储服务器，基于所述遗传数据的分析来生成所述农产品的遗传概况；和通过所述远程计算和存储服务器，基于所述登记细节和所述遗传概况来呈现反馈。2.权利要求1的方法，其中分析所述遗传数据包括分析至少一个遗传测试样品，其包括从所述农产品获得的一种或多种基因标记。3.权利要求1的方法，其中接收限定所述农产品的一个或多个特征的登记细节包括接收限定作物或家畜的一个或多个特征的登记细节。4.权利要求1的方法，其中接收遗传数据包括接收基因组数据、蛋白质组数据、代谢组学数据和生物信息学数据中的至少一种。5.权利要求4的方法，其中接收基因组数据包括接收DNA测序数据、RNA测序数据或基因表达数据中的至少一种。6.权利要求1的方法，其中呈现所述反馈包括呈现营养建议、育种意见、市场估价、市场预测和谱系追踪中的至少一个。7.权利要求1的方法，其中分析所述遗传测试样品包括经由特异性标识符来识别所述农产品，其中所述特异性标识符包含条形码。8.权利要求1的方法，其进一步包括：通过所述远程计算和存储服务器，分析所述遗传概况；和通过所述远程计算和存储服务器，基于所述遗传概况的分析来确定反馈。9.权利要求8的方法，其进一步包括通过所述远程计算和存储服务器，基于所述遗传概况的分析结果来执行自动化功能。10.权利要求9的方法，其中执行自动化功能包括生成且传输以下中的至少一个：(i)对用户的通知，和(ii)对与所述农业农场的机械化装置相关的执行器的命令。11.权利要求10的方法，其中生成对用户的通知包括生成电子邮件、文本消息和应用程序内通知中的至少一个。12.权利要求8的方法，其进一步包括基于所述遗传概况的分析结果，经由所述计算装置的显示器呈现对所述用户的反馈。13.权利要求1的方法，其进一步包括：通过所述远程计算和存储服务器，接收与所述农产品相关的更新的农产品数据；通过所述远程计算和存储服务器，分析所述遗传概况和所述更新的农产品数据；和通过所述远程计算和存储服务器，基于所述遗传概况和所述更新的农产品数据的分析来确定反馈。14.权利要求13的方法，其进一步包括通过所述远程计算和存储服务器，基于所述遗传概况和所述更新的农产品数据的分析结果来执行自动化功能。15.权利要求14的方法，其中执行自动化功能包括以下中的至少一个：(i)生成且传输对用户的通知，以及(ii)生成且传输对与所述农业农场的机械化装置相关的执行器的命令。16.权利要求15的方法，其中生成对用户的通知包括生成电子邮件、文本消息和应用程序内通知中的至少一个。17.权利要求13的方法，其进一步包括基于所述遗传概况和所述更新的农产品数据的分析结果，经由所述计算装置的显示器呈现对所述用户的...

【专利技术属性】
技术研发人员：S阿卡迪里，
申请(专利权)人：农业生物信息有限责任公司，
类型：发明
国别省市：美国,US