鉴定、评估、预防以及治疗肺疾病的方法及试剂盒技术

本发明专利技术提供了用于诊断肺疾病如非小细胞肺癌或反应性气道疾病的生物标记物及生物标记物的组合。本发明专利技术还提供了基于生物标记物及生物标记物组合的表达程度区分肺疾病的方法，监测治疗的方法，以及预测受试者对治疗性干预的应答的方法。还提供了包含用于检测生物标记物及生物标记物组合的试剂的试剂盒。

Identification, evaluation, prevention and treatment of lung diseases and kits

The invention provides a combination of biomarkers and biomarkers for diagnosing lung diseases such as non-small cell lung cancer or reactive airway diseases. The invention also provides a method for differentiating lung disease based on the expression of biomarkers and biomarkers, monitoring the treatment method, and predicting the response of the subjects to the therapeutic intervention. A kit containing a reagent for detecting the combination of biomarkers and biomarkers is also provided.

【技术实现步骤摘要】
鉴定、评估、预防以及治疗肺疾病的方法及试剂盒本申请是国际申请PCT/US2010/027243，国际申请日2010年3月12日，中国国家阶段申请号201080017220.5的专利技术专利申请的分案申请。专利技术背景(a)专利
本专利技术涉及使用生物标记物及其试剂盒对肺疾病的检测、鉴定、评估、预防、诊断和处理。更具体地，本专利技术涉及通过测量及定量特异性标记物的表达水平对非小细胞癌和反应性气道疾病的诊断。本专利技术还涉及对人类血清或其它生物学液体中存在的生物标记物的鉴定，当发现这些标志物的表达水平与发现于正常群体中的水平不同时则提示与人类肺组织和人类呼吸系统相关病理学状态(pathology)。通过鉴定与这些病理学状态相关的标记物、定量这些生物标记物的表达水平以及将表达水平与通常预期存在于正常人血清中的水平相比较，有可能经过简单的血液测试在其进展早期检测到病理学状态的存在并定性所述病理学状态的进展，以及区分病理学状态。(b)相关领域描述呼吸系统的病理学状态，如哮喘和肺癌，影响了数百万的美国人。事实上，美国肺科协会(AmericanLung)报道指出几乎2,000万美国人饱受哮喘之苦。据美国癌症协会(AmericanCancerSociety)估计，仅2007年就有229,400例新发呼吸系统癌症及164,840例死于呼吸系统癌症。尽管当检测到癌症而其仍然为局部时的所有癌症病例的五年存活率为46％，而肺癌病人的五年存活率仅为13％。对应地，只有16％的癌症是在疾病扩散之前发现的。肺癌通常基于癌细胞的病理学状态而归类为两种主要类型。每种类型根据转化为癌性的细胞类型命名。小细胞肺癌源自人肺组织中的小细胞，而非小细胞肺癌通常包括不是小细胞类型的所有肺癌。因为对于所有非小细胞类型的处理通常相同，故将非小细胞肺癌分组到一起。综合地，非小细胞肺癌，或NSCLC，占据所有肺癌的约75％。肺癌患者低存活率的一个主要因素是基于肺癌难以在早期进行诊断这一事实。目前的诊断肺癌或鉴定其在人中的存在的方法局限于进行X射线、计算机断层扫描(CT)和类似的肺测试以从物理上确定肿瘤存在或不存在。因此，肺癌诊断经常仅仅是应答已经存在显著的一段时间的症状而进行，并且在此疾病已经在人中存在足够长时间以产生物理可检测的团块后才进行。类似地，目前检测哮喘的方法一般是在如反复气喘、咳嗽和胸部紧束感等症状出现已久之后进行。目前检测哮喘的方法一般局限于肺功能测试如呼吸量测量测试或激发测试(challengetest)。此外，医师经常要求这些测试与多种其他测试一并进行以排除其他病理学状态或反应性气道疾病如慢性阻碍性肺病(COPD)、支气管炎、肺炎和充血性心力衰竭。本领域不存在一种简单可靠的方法在发展早期诊断人肺组织病理学状态。进一步地，如今没有可用的能够只是具体肺组织病理学状态存在的血液测试。因此，需要开发一种方法以在疾病进展早期确定肺癌的存在。类似地，也需要开发一种方法以在症状最早出现时诊断哮喘及非小细胞肺癌，以及将其相互之间区分并与其他肺疾病如感染进行区分。进一步需要鉴定人类血液中存在的特异性蛋白质，当其在相对表达强度上发生改变时指示非小细胞肺癌和/或反应性气道疾病的存在。专利技术概述本专利技术已经鉴定了大量可用于定性受试者有关肺疾病如非小细胞肺癌或反应性气道疾病的生理学状态的生物标记物。这些生物标记物在表1-23中显示。表1A列出了这样的生物标记物，已经发现当在具有一种或多种肺疾病的个体中测量时其表达水平不同于正常个体中的水平。表1B列出了这样的生物标记物，已经发现当在具有非小细胞肺癌或反应性气道疾病的个体中测量时其表达水平不同于正常个体中的水平，并发现其在非小细胞肺癌和反应性气道疾病之间显示出差异化表达水平。表1C列出了这样的生物标记物，已经发现当测量时其具有非小细胞肺癌或反应性气道疾病的个体中的表达不同于正常个体中的水平。表2列出了这样的生物标记物，已经发现当在具有反应性气道疾病的个体中测量时其表达不同于正常个体中的水平。表3列出了这样的生物标记物，已经发现当在具有非小细胞肺癌的个体中测量时其表达不同于正常个体中的水平。表4列出了这样的生物标记物，已经发现测量时其在具有非小细胞肺癌和反应性气道疾病的个体之间表达水平不同。表5A列出了这样的生物标记物，已经发现当在具有一种或多种肺疾病的男性中测量时其表达水平不同于正常男性中的水平。表5B列出了这样的生物标记物，已经发现当在具有非小细胞肺癌或反应性气道疾病的男性中测量时其表达水平不同于正常男性中的水平，并发现其在非小细胞肺癌和反应性气道疾病之间显示出差异化表达水平。表5C列出了这样的生物标记物，已经发现当在具有非小细胞肺癌及反应性气道疾病的男性中测量时其表达不同于正常男性中的水平。表6列出了这样的生物标记物，已经发现当在具有反应性气道疾病的男性中测量时其表达不同于正常男性中的水平。表7列出了这样的生物标记物，已经发现当在具有非小细胞肺癌的男性中测量时其表达水平不同于正常男性中的水平。表8列出了这样的生物标记物，已经发现测量时其在具有非小细胞肺癌和反应性气道疾病的男性之间表达水平不同。表9A列出了这样的生物标记物，已经发现当在具有一种或多种肺疾病的女性中测量时其表达水平不同于正常女性中的水平。表9B列出了这样的生物标记物，已经发现当在具有非小细胞肺癌或反应性气道疾病的女性中测量时其表达水平不同于正常女性中的水平，并发现其在非小细胞肺癌和反应性气道疾病之间显示出差异化表达水平。表9C列出了这样的生物标记物，已经发现当在具有非小细胞肺癌及反应性气道疾病的女性中测量时其表达不同于正常女性中的水平。表10列出了这样的生物标记物，已经发现当在具有反应性气道疾病的女性中测量时其表达不同于正常女性中的水平。表11列出了这样的生物标记物，已经发现当在具有非小细胞肺癌的女性中测量时其表达不同于正常女性中的水平。表12列出了这样的生物标记物，已经发现测量时其在具有非小细胞肺癌或反应性气道疾病的女性之间表达水平不同。表13A列出了这样的生物标记物，其表达在男性和女性反应性气道疾病群体之间差异显著。表13B列出了生物标志物，其表达在男性和女性反应性气道疾病群体之间差异不显著。表14A列出了这样的生物标记物，其表达在男性和女性非小细胞肺癌群体之间差异显著。表14B列出了生物标志物，其表达在男性和女性非小细胞肺癌群体之间差异不显著。表15A列出了这样的生物标记物，其通过正常群体荧光强度的相对标准差排序。表15B列出了这样的生物标记物，其通过正常女性群体荧光强度的相对标准差排序。表15C列出了这样的生物标记物，其通过正常男性群体荧光强度的相对标准差排序。表16A列出了这样的生物标记物，已经发现当在具有一种或多种肺疾病的男性中测量时其表达水平不同于正常男性中的水平。表16B列出了这样的生物标记物，已经发现当在具有非小细胞肺癌或反应性气道疾病的男性中测量时其表达水平不同于正常男性中的水平，并发现其在非小细胞肺癌和反应性气道疾病之间显示出差异化表达水平。表16C列出了这样的生物标记物，已经发现当在具有非小细胞肺癌及反应性气道疾病的男性中测量时其表达不同于正常男性中的水平。表17列出了这样的生物标记物，已经发现当在具有反应性气道疾病的男性中测量时本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.测定受试者生物学液体中一个具体生物标记物亚组的表达程度的工具用于制造在受试者中进行生理学定性的试剂盒的用途，所述亚组包括以下生物标记：IL‑8、MMP‑9、抵抗素和MPO，其中所述生物标记物亚组的表达程度指示非小细胞肺癌，所述生物学液体为血清或血浆。

【技术特征摘要】
2009.03.12 US 12/403,369;2009.08.26 US 61/237,1981.测定受试者生物学液体中一个具体生物标记物亚组的表达程度的工具用于制造在受试者中进行生理学定性的试剂盒的用途，所述亚组包括以下生物标记：IL-8、MMP-9、抵抗素和MPO，其中所述生物标记物亚组的表达程度指示非小细胞肺癌，所述生物学液体为血清或血浆。2.如权利要求1所述的用途，所述生物标记物是多肽。3.如权利要求1或2所述的用途，其中生物学液体为血浆。4.如权利要求1-3中任一项所述的用途，所述生物学液体是血清。5.如权利要求1-4中任一项所述的用途，其中受试者为哺乳动物。6.如权利要求5所述的用途，所述哺乳动物为人。7.如权利要求6所述的用途，所述受试者为男性。8.如权利要求6所述的用途，所述受试者为女性。9.如权利要求1-8中任一项所述的用途，所述测定表达程度包括进行免疫测定。10.如权利要求9所述的用途，其中测定表达程度包括进行定量复合免疫测定。11.如权利要求1-10中任一项所述的用途，所述受试者表现出一种或多种非小细胞肺癌的症状。12.如权利要求1-11中任一项所述的用途，所述生物标记物还包括：MMP-7、IL-5、IL-10、MCP-1、瘦素、HGF、sCD40配体、IL-7、MIF、sICAM-1、IL-2、SAA、IL12(p70)和IL-4。13.如权利要求1-12中任一项所述的用途，所述生物标记物还包括至少一个选自以下所述的生物标记：IL-13、1-TAC、MMP-1、嗜酸细胞活化趋化因子、IP-10、sVCAM-1、脂联素、CRP、C-肽、MMP-3、SAP、IL-1ra、IL-15、EGF、MMP-8、IL-6、MMP-12、PAI-1、淀粉不溶素(总)、IL-1α、sFSl、MIP-1β、SE-选择素、IL-17、GM-CSF、G-CSF、TGF-α、IFN-γ、Fractalkine、VEGF、IL-12(p40)、Sfas、IL-1β、MIP-1α、胰岛素、GLP-1、TNF-α、MMP-2、MMP-13、IL-12(p40)游离、I-TAC，或它们的任选组合。14.设计用于在受试者中诊断非小细胞肺癌的试剂盒的方法，包括(a)选择一个具体生物标记物亚组，所述亚组包括IL-8、MMP-9、抵抗素和MPO；(b)选择测定所述生物标记物表达程度的工具；以及(c)设计包含所述测定表达程...

【专利技术属性】
技术研发人员：R·T·斯特里佩，E·伊兹比卡，S·H·贝克，
申请(专利权)人：癌症预防和治疗有限公司，
类型：发明
国别省市：美国,US