适用于药物基因组学的生物样本库管理系统技术方案

本发明专利技术公开一种适用于药物基因组学的生物样本库管理系统，其包括数据库、样本信息采集模块、知识库模块、样本入库管理模块、样本出库管理模块以及样本应用服务模块，所述知识库模块分别与所述数据库、所述样本信息采集模块以及所述样本入库管理模块通信连接，所述样本入库管理模块分别与所述数据库和所述样本信息采集模块通信连接，所述样本出库管理模块和所述样本应用服务模块分别与所述数据库通信连接。本发明专利技术提供的适用于药物基因组学的生物样本库管理系统不仅能实现以药物分类或基因分类为中心的样本管理，而且在样本应用服务时能更好地满足临床药物基因组学的需求以及可结合疾病信息精准出库某一用药患者样本以提高科研效率。

Biosample library management system for pharmacogenomics

The invention discloses a method for pharmacogenomics biological sample library management system, including database, sample information acquisition module, knowledge base module, a sample storage management module, database management module and sample sample application service module, the knowledge base module respectively and the database, the information collection module and sample the sample storage management module communication connection, the sample storage management module is respectively connected with the database and the sample information acquisition module communication connection, the sample database management module and the service module is respectively connected with the sample should be in communication with the database. The invention provides a suitable in pharmacogenomics biological sample library management system can not only realize the sample management to classification of drug or gene classification as the center, and can better meet the clinical needs and pharmacogenomics can be combined with the precise information of a disease from the medication samples to improve the efficiency of scientific research in the sample application service.

【技术实现步骤摘要】
适用于药物基因组学的生物样本库管理系统
本专利技术涉及药物基因组学领域，具体涉及一种适用于药物基因组学的生物样本库管理系统。
技术介绍
生物样本库(Biobank)又被称为生物银行，其作用在于对各类生物样本的收集、处理、存储和应用过程进行标准化管理，同时对与样本相关各类信息进行管理，如样本的临床信息、病人随访信息、样本质量管理信息等。上个世纪以来，越来越多的生物样本库被建立，这些生物样本库在基因组学研究和精准医疗研究红扮演着越来越重要的角色。随着生物样本库的不断发展状态，对于生物样本的管理工作愈显繁重，传统的人工管理方式难以满足对当前生物样本库的管理工作。同时，样本库数据的传输和交流也是当前解决的问题，传统样本数据库分散在不同地区，研究者和管理者难以对样本的信息进行整合和汇总统计。因此，需要提供一种适用于药物基因组学的生物样本库管理系统以解决上述问题。
技术实现思路
本专利技术的目的在于提供一种适用于药物基因组学的生物样本库管理系统，该系统能实现以药物分类或基因分类为中心的样本管理、在样本应用服务时能更好地满足临床药物基因组学的需求、以及可结合疾病信息精准出库某一用药患者样本以提高科研效率。本专利技术的技术方案如下：一种适用于药物基因组学的生物样本库管理系统，包括：数据库，包括样本表型数据库、疾病分类数据库、药物分类数据库以及样本数据库；样本信息采集模块，用于采集样本信息，所述样本信息包括样本基本信息以及与被采集样本对应的疾病信息和用药信息；知识库模块，包括基因本体单元、疾病ICD-10编码单元及药物ATC编码单元，所述基因本体单元通过访问所述样本表型数据库以获得所述样本基本信息的标准命名，所述疾病ICD-10编码单元通过访问所述疾病分类数据库以获得所述疾病信息的标准命名，所述药物ATC编码单元通过访问所述药物分类数据库以获得所述用药信息的标准命名；样本入库管理模块，用于根据所述样本基本信息、所述疾病信息及所述用药信息三者的标准命名生成入库管理信息，并将所述入库管理信息以及所述样本基本信息、所述疾病信息及所述用药信息三者的标准命名关联后储存于所述样本数据库中，所述入库管理信息包括样本编号信息以及储存位置信息；样本出库管理模块，用于生成样本出库信息以及修改样本出库后的样本状态；样本应用服务模块，用于访问所述样本数据库中的所述样本基本信息、所述疾病信息及所述用药信息中的任意一种或几种，以获得目标数据，所述目标数据包括所述入库管理信息以及与所述入库管理信息关联后的其他数据。优选地，所述适用于药物基因组学的生物样本库管理系统还包括样本质控管理模块，所述样本质控管理模块用于根据入库后样本的所述入库管理信息将样本质检信息与所述入库管理信息关联后录入至所述样本数据库中。优选地，所述样本质检信息包括样本编号、检测类别、实验员信息、检测结果以及实验日期。优选地，所述样本编号信息为数字、条码及二维码中的任意一种。优选地，所述样本信息采集模块还用于采集样本扩展信息，所述样本入库管理模块还用于将所述样本扩展信息与所述入库管理信息关联后储存至所述样本数据库中，所述样本扩展信息包括受试者的地址、姓名、性别及年龄。优选地，所述样本信息采集模块还用于采集样本处理信息，所述样本入库管理模块还用于将所述样本处理信息与所述入库管理信息关联后储存至所述样本数据库中，所述样本处理信息包括取样方法、取样结果、样本处理时长、样本处理情况以及样本处理条件。优选地，所述储存位置信息包括容器信息、冻存架信息、冻存盒信息以及样本盒信息。优选地，所述储存位置信息以图形化的方式显示样本的储存位置。优选地，所述样本出库信息包括出库单号、申请人信息、申请人部门、申请用途、申请日期、样本所属的项目信息及申请理由。优选地，所述样本应用服务模块还用于导出从所述样本数据库查询得到的目标数据，所述目标数据包括所述入库管理信息以及与所述入库管理信息关联后的其他数据。与相关技术相比，本专利技术提供的适用于药物基因组学的生物样本库管理系统的有益效果在于：所述适用于药物基因组学的生物样本库管理系统包括数据库、样本信息采集模块、知识库模块、样本入库管理模块、样本出库管理模块以及样本应用服务模块，所述数据库包括样本表型数据库、疾病分类数据库、药物分类数据库以及样本数据库，所述样本信息采集模块用于采集样本信息，所述样本信息包括样本基本信息以及与被采集样本对应的疾病信息和用药信息，所述知识库模块包括基因本体单元、疾病ICD-10编码单元及药物ATC编码单元，所述基因本体单元通过访问所述样本表型数据库以获得所述样本基本信息的标准命名，所述疾病ICD-10编码单元通过访问所述疾病分类数据库以获得所述疾病信息的标准命名，所述药物ATC编码单元通过访问所述药物分类数据库以获得所述用药信息的标准命名，所述样本入库管理模块，用于根据所述样本基本信息、所述疾病信息及所述用药信息三者的标准命名生成入库管理信息，并将所述入库管理信息以及所述样本基本信息、所述疾病信息及所述用药信息三者的标准命名储存于所述样本数据库中，所述入库管理信息包括样本编号信息以及储存位置信息，所述样本出库管理模块用于生成样本出库信息以及修改样本出库后的样本状态，所述样本应用服务模块用于访问所述样本数据库以查询所述样本基本信息、所述疾病信息及所述用药信息三者的标准命名生成入库管理信息，不仅能实现以药物分类或基因分类为中心的样本管理，而且在样本应用服务时能更好地满足临床药物基因组学的需求以及可结合疾病信息精准出库某一用药患者样本以提高科研效率。附图说明为了更清楚地说明本专利技术实施例中的技术方案，下面将对实施例描述中所需要使用的附图作简单地介绍，显而易见地，下面描述中的附图仅仅是本专利技术的一些实施例，对于本领域普通技术人员来讲，在不付出创造性劳动的前提下，还可以根据这些附图获得其它的附图，其中：图1为本专利技术提供的适用于药物基因组学的生物样本库管理系统的结构框图。具体实施方式下面将结合本专利技术实施例中的附图，对本专利技术实施例中的技术方案进行清楚、完整地描述，显然，所描述的实施例仅仅是本专利技术一部份实施例，而不是全部的实施例。基于本专利技术中的实施例，本领域普通技术人员在没有做出创造性劳动前提下所获得的所有其他实施例，都属于本专利技术保护的范围。请结合参阅图1，所述适用于药物基因组学的生物样本库管理系统包括数据库1、样本信息采集模块2、知识库模块3、样本入库管理模块4、样本出库管理模块5以及样本应用服务模块6。其中，所述知识库模块3分别与所述数据库1、所述样本信息采集模块2以及所述样本入库管理模块4通信连接，所述样本入库管理模块4分别与所述数据库1和所述样本信息采集模块2通信连接，所述样本出库管理模块5和所述样本应用服务模块6分别与所述数据库1通信连接。所述数据库1可以设置于终端服务器、中转服务器及备份服务器的任一种。所述数据库1包括样本表型数据库11、疾病分类数据库13、药物分类数据库15以及样本数据库17。其中，所述样本表型数据库11内储存有以基因表型分类的哺乳类动物(包括人)基因的表型数据，所述疾病分类数据库13内储存有以ICD-10分类的疾病信息，所述药物分类数据库15内储存有以ATC分类的药物信息。所述样本信息采集模块2用于采集样本信息，所述样本信息包括样本文档来自技高网...

【技术保护点】
一种适用于药物基因组学的生物样本库管理系统，其特征在于，包括：数据库，包括样本表型数据库、疾病分类数据库、药物分类数据库以及样本数据库；样本信息采集模块，用于采集样本信息，所述样本信息包括样本基本信息以及与被采集样本对应的疾病信息和用药信息；知识库模块，包括基因本体单元、疾病ICD‑10编码单元及药物ATC编码单元，所述基因本体单元通过访问所述样本表型数据库以获得所述样本基本信息的标准命名，所述疾病ICD‑10编码单元通过访问所述疾病分类数据库以获得所述疾病信息的标准命名，所述药物ATC编码单元通过访问所述药物分类数据库以获得所述用药信息的标准命名；样本入库管理模块，用于根据所述样本基本信息、所述疾病信息及所述用药信息三者的标准命名生成入库管理信息，并将所述入库管理信息以及所述样本基本信息、所述疾病信息及所述用药信息三者的标准命名关联后储存于所述样本数据库中，所述入库管理信息包括样本编号信息以及储存位置信息；样本出库管理模块，用于生成样本出库信息以及修改样本出库后的样本状态；样本应用服务模块，用于访问所述样本数据库中的所述样本基本信息、所述疾病信息及所述用药信息中的任意一种或几种，以获得目标数据，所述目标数据包括所述入库管理信息以及与所述入库管理信息关联后的其他数据。...

【技术特征摘要】
1.一种适用于药物基因组学的生物样本库管理系统，其特征在于，包括：数据库，包括样本表型数据库、疾病分类数据库、药物分类数据库以及样本数据库；样本信息采集模块，用于采集样本信息，所述样本信息包括样本基本信息以及与被采集样本对应的疾病信息和用药信息；知识库模块，包括基因本体单元、疾病ICD-10编码单元及药物ATC编码单元，所述基因本体单元通过访问所述样本表型数据库以获得所述样本基本信息的标准命名，所述疾病ICD-10编码单元通过访问所述疾病分类数据库以获得所述疾病信息的标准命名，所述药物ATC编码单元通过访问所述药物分类数据库以获得所述用药信息的标准命名；样本入库管理模块，用于根据所述样本基本信息、所述疾病信息及所述用药信息三者的标准命名生成入库管理信息，并将所述入库管理信息以及所述样本基本信息、所述疾病信息及所述用药信息三者的标准命名关联后储存于所述样本数据库中，所述入库管理信息包括样本编号信息以及储存位置信息；样本出库管理模块，用于生成样本出库信息以及修改样本出库后的样本状态；样本应用服务模块，用于访问所述样本数据库中的所述样本基本信息、所述疾病信息及所述用药信息中的任意一种或几种，以获得目标数据，所述目标数据包括所述入库管理信息以及与所述入库管理信息关联后的其他数据。2.根据权利要求1所述的适用于药物基因组学的生物样本库管理系统，其特征在于，所述适用于药物基因组学的生物样本库管理系统还包括样本质控管理模块，所述样本质控管理模块用于根据入库后样本的所述入库管理信息将样本质检信息与所述入库管理信息关联后录入至所述样本数据库中。3.根据权利要求2所述的适用于药物基因...

【专利技术属性】
技术研发人员：滕祥云，李琦，张璇，黄少亚，张戈，杨雪佳，
申请(专利权)人：长沙三济生物科技有限公司，
类型：发明
国别省市：湖南,43