一组用于预测鼻咽癌转移风险的标志物及其应用制造技术

本发明专利技术公开了一组用于预测鼻咽癌转移风险的标志物及其应用。标志物包括ANXA1、CBR3、CLASP1、CXCL10、DCTN1、FNDC3B、LRIG1、FNDC3B、HDLBP、POLR2M、WSB2、WNK1、YBX3。本发明专利技术13个基因表达构成的分子标签，可以反映鼻咽癌患者的生物学特异性，可以更准确地预测鼻咽癌患者的转移风险及预后，更好地指导临床用药，对无远处生存的预测效能要优于传统N分期。

A set of markers for predicting the risk of metastasis of nasopharyngeal carcinoma and its application

The present invention discloses a set of markers for predicting the risk of metastasis of nasopharyngeal carcinoma and its application. The markers include ANXA1, CBR3, CLASP1, CXCL10, DCTN1, FNDC3B, LRIG1, FNDC3B, HDLBP, POLR2M, WSB2, WNK1, etc. The expression of 13 genes molecular tag, can reflect the biological specificity of nasopharyngeal carcinoma patients, can more accurately predict the risk of metastasis and prognosis of patients with nasopharyngeal carcinoma, to better guide the clinical medication, is superior to the traditional N stage to predict efficacy without distant survival.

【技术实现步骤摘要】
一组用于预测鼻咽癌转移风险的标志物及其应用
本专利技术涉及鼻咽癌的预后标志物，特别涉及一组用于预测鼻咽癌转移风险的标志物及其应用。
技术介绍
全球40％的鼻咽癌(NPC)发生在中国，广东省等华南地区最为高发，70％患者就诊时已属中晚期，严重威胁着我国人民的生命健康。近年来，随着现代影像技术的应用和调强放射治疗技术的进步，鼻咽癌的局部控制率明显提高，远处转移成为治疗失败的主要模式。根据文献报道，鼻咽癌患者在初诊根治性治疗后的远处转移率高达30～40％，且转移性鼻咽癌患者对治疗的反应性差，预后不良，其中位生存期约12个月，3年生存率不到10％。目前，临床上主要是根据解剖学分期(TNM，T是原发灶，N是淋巴结，M是远处转移)来预测鼻咽癌远处转移，并根据分期决定不同的治疗策略。TNM分期最大的问题在于仅仅基于肿瘤的解剖学侵犯范围，而完全没有考虑肿瘤的生物学异质性。同样大小的肿瘤，其内在的生物学特性和转移潜能可能存在很大差异。临床分期相同的患者接受了相同的治疗，预后却可能截然不同。比如淋巴结分期为N3的鼻咽癌患者有35％会发生转移，另外的65％却不会发生转移；而治疗前没有淋巴结转移(N0期)的患者，有10％会在治疗中或治疗后发生转移。显然，仅仅依靠临床分期并不能非常准确地区分患者的转移风险，从而给予针对性的治疗，一部分患者可能接受了过度治疗，另一部分患者的治疗强度却可能不足。为了更准确地预测转移，提高治疗的针对性和有效性，亟需寻找新的反映肿瘤转移潜能的生物学标志物。甄别具有“转移潜能”的鼻咽癌患者，做到提前预测并给予有效的治疗，可以显著改善这部分患者的预后。专利技术内容本专利技术的目的在于提供一组可以有效预测NPC转移风险的标志物。本专利技术的另一个目的在于该组标志物在制备NPC预后试剂中的应用。本专利技术所采取的技术方案是：一组用于预测鼻咽癌转移风险的标志物，该组标志物包括ANXA1、CBR3、CLASP1、CXCL10、DCTN1、FNDC3B、LRIG1、FNDC3B、HDLBP、POLR2M、WSB2、WNK1、YBX3。作为上述标志物的进一步改进，用于NPC风险预测的评分公式根据Cox风险比例模型确定。作为上述标志物的进一步改进，用于NPC风险预测的评分公式为：分值＝(0.1846×YBX3表达量)-(0.3007×CBR3表达量)-(0.1383×CXCL10表达量)-(0.3661×CLASP1表达量)+(0.2381×DCTN1表达量)-(0.4004×FNDC3B表达量)+(0.6×WSB2表达量)+(0.1093×LRIG1表达量)-(0.1162×GRM4表达量)+(0.1327×ANXA1表达量)+(0.1485×WNK1表达量)+(0.0714×HDLBP表达量)+(0.1774×POLR2M表达量)。用于确定标志物相对表达量的内参基因选自ACTB、B2M、PGK1、RPL19、RPLP0。特别的，上述标志物的表达量基于ACTB、B2M、PGK1、RPL19、RPLP0五个内参基因的几何均数进行计算。通过定量标志物的表达情况，可以更准确地预测鼻咽癌患者的转移风险及预后，更好地指导临床用药。因此，定量标志物表达情况的试剂可以用于制备预测鼻咽癌患者的转移风险及预后试剂。特别的，定量标志物表达量的试剂选自核酸探针试剂。本专利技术的有益效果是：本专利技术13个基因表达构成的分子标签，可以反映鼻咽癌患者的生物学特异性，可以更准确地预测鼻咽癌患者的转移风险及预后，更好地指导临床用药，对无远处生存的预测效能要优于传统N分期。附图说明图1：K-M生存分析显示DMGN高风险组鼻咽癌患者无远处转移生存在(A)训练组，n＝410，(B)内部验证组，n＝204，(C)外部组1，n＝165，和(D)外部组2n＝158均较差；图2：K-M生存分析显示DMGN高风险组鼻咽癌患者无疾病生存在(A)训练组，n＝410，(B)内部验证组，n＝204，(C)外部组1，n＝165，和(D)外部组2n＝158均较差；图3：K-M生存分析显示DMGN高风险组鼻咽癌患者总生存在(A)训练组，n＝410，(B)内部验证组，n＝204，(C)外部组1，n＝165，和(D)外部组2，n＝158均较差；图4：ROC曲线比较列线图，DMGN，性别，LDH，CRP，N分期对于局部晚期鼻咽癌患者无远处转移风险预测的敏感性和特异性；图5：K-M生存分析显示DMGN高风险组鼻咽癌患者是否接受同期化疗的无远处转移生存(A)内部组中高风险患者，n＝312，(B)内部组中低风险患者，n＝302，(C)外部组中高风险患者1，n＝183，和(D)外部组中低风险患者，n＝140；图6：预测局部晚期鼻咽癌无远处转移生存的线列图。具体实施方式下面结合实验，进一步说明本专利技术的技术方案。病例筛选：专利技术人选取了937例病人作为非转移性初治的局部晚期鼻咽癌患者的样本，这些患者病人都接受是经过了根治性放射性治疗。其中的56.6％的患者病人(530例)还接受过以顺铂为基础的同期化疗。经过68.1个月(四分位数IQR44.6～84.4)其中209人在随访期间发生了转移。专利技术人采用AffymetrixHumanGene2.0ST表达谱芯片检测了24例高转移风险(初诊无转移，但在根治性治疗后2年内出现远处转移)和24例低转移风险(初诊无转移，且根治性治疗后随访5年未出现转移及复发)鼻咽癌患者的初诊活检石蜡组织标本，通过筛选得到137个差异表达基因。鼻咽癌转移分子靶标的发现专利技术人利用NanoStringnCounter技术平台在训练组410例标本(来自中山大学肿瘤防治中心)中检测这137个差异表达基因和5个内参基因，筛选出与DMFS(无远处转移生存)最为相关的13个基因构建模型，专利技术人将这组13个基因构成的标志物命名为DMGN(distantmetastasisgenesignatureforLA-NPC，局部晚期鼻咽癌基因标签)，其计算公式为：DMGN评分公式＝(0.1846×YBX3表达量)-(0.3007×CBR3表达量)-(0.1383×CXCL10表达量)-(0.3661×CLASP1表达量)+(0.2381×DCTN1表达量)-(0.4004×FNDC3B表达量)+(0.6×WSB2表达量)+(0.1093×LRIG1表达量)-(0.1162×GRM4表达量)+(0.1327×ANXA1表达量)+(0.1485×WNK1表达量)+(0.0714×HDLBP表达量)+(0.1774×POLR2M表达量)，式中，表达量没有单位，基于ACTB、B2M、PGK1、RPL19、RPLP0五个内参基因的几何均数进行计算。用X-tile软件生成阈值为5.01，由此将203例(49.5％)患者分为高风险组，207例(50.5％)分为低风险组；这两组患者五年的无远处转移生存率在高风险组为63％(95％CI置信区间56.1-69.6)，在低风险组为91％(95％置信区间85.9-94.2；HR风险比4.93,95％CI2.99-8.16；p<0.001；图1)。与低风险组患者相比，高风险组患者的无疾病生存(HR3.51，95％CI2.43-5.07；p<0.001；图2)和本文档来自技高网...

【技术保护点】
一组用于预测鼻咽癌转移风险的标志物，该组标志物包括ANXA1、CBR3、CLASP1、CXCL10、DCTN1、FNDC3B、LRIG1、FNDC3B、HDLBP、POLR2M、WSB2、WNK1、YBX3。

【技术特征摘要】
1.一组用于预测鼻咽癌转移风险的标志物，该组标志物包括ANXA1、CBR3、CLASP1、CXCL10、DCTN1、FNDC3B、LRIG1、FNDC3B、HDLBP、POLR2M、WSB2、WNK1、YBX3。2.根据权利要求1所述的标志物，其特征在于：用于NPC风险预测的评分公式根据Cox风险比例模型确定。3.根据权利要求1所述的标志物，其特征在于：用于NPC风险预测的评分公式为：分值＝(0.1846×YBX3表达量)-(0.3007×CBR3表达量)-(0.1383×CXCL10表达量)-(0.3661×CLASP1表达量)+(0.2381×DCTN1表达量)-(0.4004×FNDC3B表达量)+(0.6×WSB2表达量)+(0.1093×LRIG1表达量)-(0.1162×GRM4表达量)+(0.1327×ANXA1表达量)+(0.1485×WNK1表达量)+(0.0714×HDLBP表达量)+(0.1774×POLR2M表达量)。4.根据权利要求1或3所述的标志物，其特征在于：用于确定标志物相对表达量的内参基因选自ACTB、B2M、PGK1、RPL1...

【专利技术属性】
技术研发人员：马骏，柳娜，唐欣然，黎映琴，孙颖，唐玲珑，毛燕萍，何庆梅，杨晓静，张磐磐，云径平，曾敬，
申请(专利权)人：中山大学肿瘤防治中心，
类型：发明
国别省市：广东,44