条形编码核酸制造技术

本文提供了条形编码核酸，如基因组DNA的方法。本发明专利技术另一方面提供了测序带双重条形码的核酸分子群的方法。在一些实施方案中，基因组DNA的片段可以包含第一条形码和第二条形码。

Bar encoded nucleic acid

A method for encoding nucleic acids, such as genomic DNA, is provided herein. Another aspect of the invention provides a nucleic acid molecular group of a double bar code of a sequencing band. In some embodiments, fragments of genomic DNA may contain first bar codes and second bar codes.

【技术实现步骤摘要】
条形编码核酸本申请是申请日为2013年11月5日、申请人为鲁比康基因组学公司、专利技术名称为“条形编码核酸”的中国专利申请201380069090.3的分案申请。本申请要求2012年11月5日提交的美国临时申请号61/722,357的优先权权益，该美国临时申请的全部内容以引用的方式并入本文。序列表通过电子提交而随本文一起提交并且以引用的方式并入本文，所述序列表被包含在被命名为“RUBCP0031WO_ST25.txt”的文件中，所述文件是2KB(如在Microsoft中所测量)并且在2013年11月5日创建。
本专利技术大体上涉及分子生物学和核酸测序的领域。更具体地说，它涉及条形编码(barcoding)核酸的方法。
技术介绍
条形码可以被用于鉴定核酸分子，例如其中测序可以揭示与所关注的核酸分子连接的特定条形码。在一些情况下，可以使用序列特异性事件来鉴定核酸分子，其中所述条形码的至少一部分在所述序列特异性事件中被识别出，例如所述条形码的至少一部分可以参与连接反应或延伸反应。所述条形码因此可以允许对与其连接的gDNA分子进行鉴定、选择或扩增。一种使条形码与所关注的核酸分子结合的方法包括本文档来自技高网...

【技术保护点】
一种测序带双重条形码的核酸分子群的方法，所述方法包括：(a)获得靶核酸分子群；(b)使衔接子的一条链与各靶核酸分子的至少一端结合以形成第一条形码结合的核酸分子群，其中各衔接子包含第一条形码；(c)通过链置换或通过切口平移聚合将所述衔接子的一条链从所述第一条形码结合的核酸分子中置换以形成带第一条形码的核酸分子群；(d)使引物与所述带第一条形码的核酸分子退火，其中各引物包含与所述带第一条形码的核酸分子互补的第一部分和包含第二条形码的第二部分；(e)使所述退火的引物延伸以形成带双重条形码的核酸分子群，各带双重条形码的核酸分子包含所述第二条形码、所述第一条形码、以及靶核酸分子的至少一部分；以及(f)测...

【技术特征摘要】
2012.11.05 US 61/722,3571.一种测序带双重条形码的核酸分子群的方法，所述方法包括：(a)获得靶核酸分子群；(b)使衔接子的一条链与各靶核酸分子的至少一端结合以形成第一条形码结合的核酸分子群，其中各衔接子包含第一条形码；(c)通过链置换或通过切口平移聚合将所述衔接子的一条链从所述第一条形码结合的核酸分子中置换以形成带第一条形码的核酸分子群；(d)使引物与所述带第一条形码的核酸分子退火，其中各引物包含与所述带第一条形码的核酸分子互补的第一部分和包含第二条形码的第二部分；(e)使所述退火的引物延伸以形成带双重条形码的核酸分子群，各带双重条形码的核酸分子包含所述第二条形码、所述第一条形码、以及靶核酸分子的至少一部分；以及(f)测序所述带双重条形码的核酸分子群，由此根据单次测序反应针对所述群的成员获得所述第一条形码、所述第二条形码和所述靶核酸分子的至少一部分的序列。2.如权利要求1所述的方法，其中使衔接子的一条链与靶核酸分子的至少一端结合被进一步限定为使所述衔接子的3'端与所述靶核酸分子的5'端连接。3.如权利要求2所述的方法，其中所述连接被进一步定义为平末端连接。4.如权利要求2所述的方法，其中所述衔接子的5'端缺少磷酸酯。5.如权利要求1所述的方法，其中所述靶核酸分子是双链的，并且其中步骤(b)包括使衔接子的一条链与所述靶核酸分子的每一端结合。6.如权利要求5所述的方法，其中附接到所述靶核酸分子的每一端的所述衔接子内的所述第一条形码包含相同...

【专利技术属性】
技术研发人员：T·栗原，E·卡姆贝罗，T·泰斯默，J·朗格莫尔，
申请(专利权)人：鲁比康基因组学公司，
类型：发明
国别省市：美国,US