数据获取方法及装置制造方法及图纸

技术编号:15437717 阅读:41 留言:0更新日期:2017-05-26 03:44
本发明专利技术实施例提供一种数据获取方法及装置,属于数据处理领域。其中,所述方法包括:从待测样品中获取基因在所述待测样品中的表达情况;基于所述基因的表达情况以及预先创建好的二分类模型,对所述待测样品进行检测,获取所述待测样品的检测结果;通过从所述待测样品中获取基因在该待测样品中的表达情况,再基于所述基因的表达情况以及预先创建好的二分类模型,从而来对所述待测样品进行检测,以获取所述待测样品的检测结果,通过该方法可以提高数据获取的准确性与便捷性,使得对所述待测样品的检测可以更加准确和便捷。

Data acquisition method and device

The embodiment of the invention provides a data acquisition method and a device, belonging to the field of data processing. Among them, the method includes: from the sample to obtain detected expression in the samples; expression of the gene and the two classification model based on pre created, the samples were detected, the detection results obtained by the sample; the gene in the measured expression in the samples from the sample, then the expression of the gene and the two classification model based on pre created, to the sample for testing, to obtain the test results of the sample, the method can improve the accuracy of data acquisition and convenience, which makes the detection of the sample to be detected can be more accurate and convenient.

【技术实现步骤摘要】
数据获取方法及装置
本专利技术涉及数据处理领域,具体而言,涉及一种数据获取方法及装置。
技术介绍
目前,癌症诊断方法一般有组织活检、血清肿瘤标志物检测以及液态活检。组织活检是对肿瘤组织进行病理分析,即从患者体内切取、钳取或穿刺等取出病变组织,进行诊断。但是组织活检方法需要患者进行手术从肿瘤上取样切片,这给患者带来很大痛苦,并且不能频繁进行。而且传统活检往往只能对单一器官进行检测,局限性也非常大,不适合在常规体检时使用。更严重的是,从肿瘤上切片提取组织会对肿瘤进一步刺激,容易激发癌细胞的快速增长。血清肿瘤标志物检测是指对肿瘤细胞发生和增殖的过程中,由肿瘤细胞产生或者是机体对肿瘤细胞反应而产生的一类物质进行检测,其主要成分是蛋白质,即肿瘤标志物。而液态活检是指通过抽取少量血液来分析肿瘤信息。而血清肿瘤标志物的主要成分是蛋白质。这些蛋白往往在正常细胞内也有表达,表达情况不稳定。某些肿瘤标志物在某些生理情况下或某些良性疾病也可以异常升高,从而导致假阳性出现;肿瘤标志物受多种非肿瘤因素影响,吸烟、酗酒、服用药物也可能导致肿瘤标志物升高;肿瘤标志物正常并不能排除肿瘤发生的可能,有的肿瘤从始至终肿瘤标记物都不会升高,有的肿瘤标志物在早期正常,疾病发展到一定程度才会升高。液态活检是通过抽取少量血液来分析肿瘤信息。通常采用CTC(循环肿瘤细胞)、ctDNA(循环肿瘤DNA/circulatingtumorDNA)及外泌体等检测方法,通过非侵入性的取样方式获得肿瘤信息。其中CTC是实体瘤释放到外周血中的循环肿瘤细胞,其检出率低,CTCs是非常罕见的,因此从血液中捕获CTCs技术难度极高;CTC特异性低,病人个体化差异大,根据肿瘤的类型、病期和其他因素,CTCs可能带着不同的分子变异,即使同一患者也具有异质性。ctDNA是肿瘤细胞释放到外周血中的DNA,ctDNA来源复杂,个体差异大,不同患者具有的突变不一样,难以有统一的检测标准;不能反映不依赖基因突变的肿瘤类型,例如蛋白翻译后修饰,表观遗传调控导致的肿瘤等。因此,如何通过对血小板RNA的提取,以对获得的数据进行处理,提高数据获取的准确性与便捷性,从而可以更容易检测出病人的病变情况,以提高疾病诊断的准确性与便捷性。
技术实现思路
有鉴于此,本专利技术实施例的目的在于提供一种数据获取方法及装置,其能够提高数据获取的准确性与便捷性。第一方面,本专利技术实施例提供了一种数据获取方法,所述方法包括:从待测样品中获取基因在所述待测样品中的表达情况;基于所述基因的表达情况以及预先创建好的二分类模型,对所述待测样品进行检测,获取所述待测样品的检测结果。第二方面,本专利技术实施例提供了一种数据获取装置,所述装置包括:第一获取模块,用于从待测样品中获取基因在所述待测样品中的表达情况;检测模块,用于基于所述基因的表达情况以及预先创建好的二分类模型,对所述待测样品进行检测,获取所述待测样品的检测结果。本专利技术实施例的有益效果是:本专利技术实施例提供一种数据获取方法及装置,通过从所述待测样品中获取基因在该待测样品中的表达情况,再基于所述基因的表达情况以及预先创建好的二分类模型,从而来对所述待测样品进行检测,以获取所述待测样品的检测结果,通过该方法可以提高数据获取的准确性与便捷性,使得对所述待测样品的检测可以更加准确和便捷。本专利技术的其他特征和优点将在随后的说明书阐述,并且,部分地从说明书中变得显而易见,或者通过实施本专利技术实施例了解。本专利技术的目的和其他优点可通过在所写的说明书、权利要求书、以及附图中所特别指出的结构来实现和获得。附图说明为了更清楚地说明本专利技术实施例的技术方案,下面将对实施例中所需要使用的附图作简单地介绍,应当理解,以下附图仅示出了本专利技术的某些实施例,因此不应被看作是对范围的限定,对于本领域普通技术人员来讲,在不付出创造性劳动的前提下,还可以根据这些附图获得其他相关的附图。图1示出了一种可应用于本申请实施例中的电子设备的结构框图;图2为本专利技术第一实施例提供的一种数据获取方法的流程图;图3为本专利技术第二实施例提供的一种数据获取方法的流程图;图4为本专利技术第三实施例提供的一种数据获取装置的结构框图。图标:400-电子设备;101-存储器;102-存储控制器;103-处理器;104-外设接口;105-输入输出单元;106-音频单元;107-显示单元;100-数据获取装置;110-第一获取模块;120-检测模块;130-比对模块;140-第二获取模块;150-筛选模块;160-创建模块。具体实施方式下面将结合本专利技术实施例中附图,对本专利技术实施例中的技术方案进行清楚、完整地描述,显然,所描述的实施例仅仅是本专利技术一部分实施例,而不是全部的实施例。通常在此处附图中描述和示出的本专利技术实施例的组件可以以各种不同的配置来布置和设计。因此,以下对在附图中提供的本专利技术的实施例的详细描述并非旨在限制要求保护的本专利技术的范围,而是仅仅表示本专利技术的选定实施例。基于本专利技术的实施例,本领域技术人员在没有做出创造性劳动的前提下所获得的所有其他实施例,都属于本专利技术保护的范围。应注意到:相似的标号和字母在下面的附图中表示类似项,因此,一旦某一项在一个附图中被定义,则在随后的附图中不需要对其进行进一步定义和解释。同时,在本专利技术的描述中,术语“第一”、“第二”等仅用于区分描述,而不能理解为指示或暗示相对重要性。请参照图1,图1示出了一种可应用于本申请实施例中的电子设备400的结构框图。电子设备400可以包括数据获取装置100、存储器101、存储控制器102、处理器103、外设接口104、输入输出单元105、音频单元106、显示单元107。所述存储器101、存储控制器102、处理器103、外设接口104、输入输出单元105、音频单元106、显示单元107各元件相互之间直接或间接地电性连接,以实现数据的传输或交互。例如,这些元件相互之间可通过一条或多条通讯总线或信号线实现电性连接。所述数据获取装置100包括至少一个可以软件或固件(firmware)的形式存储于所述存储器101中或固化在所述数据获取装置100的操作系统(operatingsystem,OS)中的软件功能模块。所述处理器103用于执行存储器101中存储的可执行模块,例如所述数据获取装置100包括的软件功能模块或计算机程序。其中,存储器101可以是,但不限于,随机存取存储器(RandomAccessMemory,RAM),只读存储器(ReadOnlyMemory,ROM),可编程只读存储器(ProgrammableRead-OnlyMemory,PROM),可擦除只读存储器(ErasableProgrammableRead-OnlyMemory,EPROM),电可擦除只读存储器(ElectricErasableProgrammableRead-OnlyMemory,EEPROM)等。其中,存储器101用于存储程序,所述处理器103在接收到执行指令后,执行所述程序,前述本专利技术实施例任一实施例揭示的流过程定义的服务器所执行的方法可以应用于处理器103中,或者由处理器103实现。处理器103可能是一种集成电路芯片,具有信号的处理能力。上述的处理器103可以是通用处理器,包括中央处理器(Centra本文档来自技高网
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数据获取方法及装置

【技术保护点】
一种数据获取方法,其特征在于,所述方法包括:从待测样品中获取基因在所述待测样品中的表达情况;基于所述基因的表达情况以及预先创建好的二分类模型,对所述待测样品进行检测,获取所述待测样品的检测结果。

【技术特征摘要】
1.一种数据获取方法,其特征在于,所述方法包括:从待测样品中获取基因在所述待测样品中的表达情况;基于所述基因的表达情况以及预先创建好的二分类模型,对所述待测样品进行检测,获取所述待测样品的检测结果。2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述从待测样品中获取基因的表达情况与表达量的步骤之前,所述方法还包括:将从相互对照的多个样品中提取的RNA进行测序得到的碱基序列与参考基因组进行比对,获取比对结果,其中,所述比对结果包括所述碱基序列在所述参考基因组上的比对信息以及所述基因在所述参考基因组上的位置信息;基于所述比对结果,获得每个所述样品中的所述基因的表达情况;基于获得的所述多个样品中的所述基因的表达情况,筛选出所述多个样品中的差异表达基因;基于获得的所述差异表达基因在所述多个样品中的表达情况,创建所述二分类模型。3.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,基于获得的所述多个样品中的所述基因的表达情况,筛选出所述多个样品中的差异表达基因,包括:获取所述多个样品中的所述基因的表达情况;基于获取的所述多个样品中的所述基因的表达情况以及差异表达基因的筛选条件,筛选出所述多个样品中的差异表达基因。4.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,所述将从相互对照的多个样品中提取的RNA进行测序得到的碱基序列与参考基因组进行比对,获取比对结果,包括:将从相互对照的多个样品中提取的RNA进行测序得到的碱基序列进行质控,获取高质量的所述碱基序列;将获取到的高质量的所述碱基序列与所述参考基因组进行比对,获取比对结果。5.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,基于获得的所述差异表达基因在所述多个样品中的表达情况,创建所述二分类模型,包括:获取所述差异表达基因在所述多个样品中的表达情况;基于获得的所述差异表达基因在所述多个样品中的表达情况以及...

【专利技术属性】
技术研发人员:宋驰
申请(专利权)人:武汉贝纳科技服务有限公司
类型:发明
国别省市:湖北,42

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