The embodiment of the invention provides a data acquisition method and a device, belonging to the field of data processing. Among them, the method includes: from the sample to obtain detected expression in the samples; expression of the gene and the two classification model based on pre created, the samples were detected, the detection results obtained by the sample; the gene in the measured expression in the samples from the sample, then the expression of the gene and the two classification model based on pre created, to the sample for testing, to obtain the test results of the sample, the method can improve the accuracy of data acquisition and convenience, which makes the detection of the sample to be detected can be more accurate and convenient.
【技术实现步骤摘要】
数据获取方法及装置
本专利技术涉及数据处理领域,具体而言,涉及一种数据获取方法及装置。
技术介绍
目前,癌症诊断方法一般有组织活检、血清肿瘤标志物检测以及液态活检。组织活检是对肿瘤组织进行病理分析,即从患者体内切取、钳取或穿刺等取出病变组织,进行诊断。但是组织活检方法需要患者进行手术从肿瘤上取样切片,这给患者带来很大痛苦,并且不能频繁进行。而且传统活检往往只能对单一器官进行检测,局限性也非常大,不适合在常规体检时使用。更严重的是,从肿瘤上切片提取组织会对肿瘤进一步刺激,容易激发癌细胞的快速增长。血清肿瘤标志物检测是指对肿瘤细胞发生和增殖的过程中,由肿瘤细胞产生或者是机体对肿瘤细胞反应而产生的一类物质进行检测,其主要成分是蛋白质,即肿瘤标志物。而液态活检是指通过抽取少量血液来分析肿瘤信息。而血清肿瘤标志物的主要成分是蛋白质。这些蛋白往往在正常细胞内也有表达,表达情况不稳定。某些肿瘤标志物在某些生理情况下或某些良性疾病也可以异常升高,从而导致假阳性出现;肿瘤标志物受多种非肿瘤因素影响,吸烟、酗酒、服用药物也可能导致肿瘤标志物升高;肿瘤标志物正常并不能排除肿瘤发生的可能,有的肿瘤从始至终肿瘤标记物都不会升高,有的肿瘤标志物在早期正常,疾病发展到一定程度才会升高。液态活检是通过抽取少量血液来分析肿瘤信息。通常采用CTC(循环肿瘤细胞)、ctDNA(循环肿瘤DNA/circulatingtumorDNA)及外泌体等检测方法,通过非侵入性的取样方式获得肿瘤信息。其中CTC是实体瘤释放到外周血中的循环肿瘤细胞,其检出率低,CTCs是非常罕见的,因此从血液中捕获CTCs技 ...
【技术保护点】
一种数据获取方法,其特征在于,所述方法包括:从待测样品中获取基因在所述待测样品中的表达情况;基于所述基因的表达情况以及预先创建好的二分类模型,对所述待测样品进行检测,获取所述待测样品的检测结果。
【技术特征摘要】
1.一种数据获取方法,其特征在于,所述方法包括:从待测样品中获取基因在所述待测样品中的表达情况;基于所述基因的表达情况以及预先创建好的二分类模型,对所述待测样品进行检测,获取所述待测样品的检测结果。2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述从待测样品中获取基因的表达情况与表达量的步骤之前,所述方法还包括:将从相互对照的多个样品中提取的RNA进行测序得到的碱基序列与参考基因组进行比对,获取比对结果,其中,所述比对结果包括所述碱基序列在所述参考基因组上的比对信息以及所述基因在所述参考基因组上的位置信息;基于所述比对结果,获得每个所述样品中的所述基因的表达情况;基于获得的所述多个样品中的所述基因的表达情况,筛选出所述多个样品中的差异表达基因;基于获得的所述差异表达基因在所述多个样品中的表达情况,创建所述二分类模型。3.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,基于获得的所述多个样品中的所述基因的表达情况,筛选出所述多个样品中的差异表达基因,包括:获取所述多个样品中的所述基因的表达情况;基于获取的所述多个样品中的所述基因的表达情况以及差异表达基因的筛选条件,筛选出所述多个样品中的差异表达基因。4.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,所述将从相互对照的多个样品中提取的RNA进行测序得到的碱基序列与参考基因组进行比对,获取比对结果,包括:将从相互对照的多个样品中提取的RNA进行测序得到的碱基序列进行质控,获取高质量的所述碱基序列;将获取到的高质量的所述碱基序列与所述参考基因组进行比对,获取比对结果。5.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,基于获得的所述差异表达基因在所述多个样品中的表达情况,创建所述二分类模型,包括:获取所述差异表达基因在所述多个样品中的表达情况;基于获得的所述差异表达基因在所述多个样品中的表达情况以及...
【专利技术属性】
技术研发人员:宋驰,
申请(专利权)人:武汉贝纳科技服务有限公司,
类型:发明
国别省市:湖北,42
还没有人留言评论。发表了对其他浏览者有用的留言会获得科技券。