具有2’-醚基的寡核苷酸制造技术

技术编号:1534707 阅读:185 留言:0更新日期:2012-04-11 18:40
*** Ⅰ 本发明专利技术公开了式Ⅰ化合物,式中R↓[1]和R↓[2]各自相互独立地为氢或保护基,或R↓[1]如说明书所定义,且R↓[2]为形成含磷核苷酸桥基的残基;B为嘌呤或嘧啶残基或其类似物;及R↓[3]为OH、F或(CF↓[2])nCF↓[3](其中n为0-7的数);以及含有这些核苷的寡核苷酸。(*该技术在2015年保护过期,可自由使用*)

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及其中2′—OH被羟乙基或氟代烷基醚化的核苷类似物,其制备方法,含有这些核苷的寡核苷酸,以及这些核苷用于制备分子中含相同或不同核苷单元的寡核苷酸的用途。核苷和寡核苷酸都可作为抗病毒有效成分,并因为它们与核酸(“反义”寡核苷酸)相互作用的能力和与此相关的生物活性,已引起人们的极大兴趣;例如见Uhlman,E.,Peyman,A.,Chemical Reviews90543—548(1990)。为了得到具有新特性的核苷或改进反义寡核苷酸与天然核酸的相互作用并提高它们对核酸酶的稳定性,对核苷(或寡核苷酸中的核苷单元)的糖残基、已对寡核苷酸中核苷间的磷酸酯键进行了各种修饰;例如见Marquez,V.E.,Lim,M.I.,Medicinal Re-search Reviews 61—40(1986),Helene,C.Toulme,J.J.,Biochimica etBiophysica Acta 104999—125(1990),Englisch,U.,Gauss,D.H.,Angewandte Chemie 103629—646(1991),Matleucci,M.D.,Bischof-berger,N.,Annual Reports in Medicinal Chemistry 2687—296(1991)在Cook,P.D.,Anti—Cancer Drug Design 6585—607(1991)和WO91/06556中,描述了在糖的2′—OH上已被修饰的核苷。所述的这些修饰使核酸酶耐受性提高;烷基越长,核酸酶耐受性越高。据观察用短链烷基如甲基、乙基或丙基,结合亲合力稍有提高,而用长链则结合亲合力大幅度下降。迄今为止还没有过将以羟乙基或氟代烷基作为2′—OH的侧链的核苷掺入到寡核苷酸中。令人惊奇地是,与使用等长的未取代烷基相比,本专利技术的修饰提高了对互补的RNA的结合亲合力。在公开的现有文献基础上无法预计到该结果。与2′—OH修饰的寡核苷酸相似,本专利技术的化合物用标记的核酸酶耐受性来区别。另外,包含本专利技术核苷的寡核苷酸显示其细胞摄取率提高,并因此提高了生物利用度和体内活性。本专利技术涉及式I化合物 其中R1和R2互相独立,各自为氢或保护基,或R1同上所定义,并且R2为形成含磷核苷酸桥基的残基;B为嘌呤或嘧啶残基或其类似基团;及R3为OH、F或(CF2)nCF3,其中n为0—7的数。当R3为OH时,该羟基可被R1和R2中定义的基团保护。优选n为0。优选R1和R2为氢。保护基和用这样的保护基衍生羟基的方法在糖和核苷酸化学中是普遍已知的,并在下述文献中有述例如Greene,B.T.的ProtectiveGroups in Organic Synthesis,Wiley Interscience,New York(1991),Son-veaux,E.的Bioorganic Chemistry 14274—325(1986)或Beaucage,S.L,Iyer,R.的Tetrahedron 482223—2311(1992)。这类保护基的例子有苄基、甲基苄基、二甲基苄基、甲氧基苄基、二甲氧基苄基、溴苄基、2,4—二氯苄基;二苯基甲基、二(甲基苯基)甲基、二(二甲基苯基)甲基、二(甲氧苯基)甲基、二(二甲氧苯基)甲基、三苯甲基、三—4,4′,4″—叔丁基苯基甲基、二-对茴香基苯基甲基、三(甲基苯基)甲基、三(二甲基苯基)甲基、甲氧苯基(二苯基)甲基、二(甲氧苯基)苯基甲基、三(甲氧苯基)甲基、三(二甲氧苯基)甲基;三苯基甲硅烷基、烷基二苯基甲硅烷基、二烷基苯基甲硅烷基和三烷基甲硅烷基,其中烷基含1—20个,优选1—12个,最优选1—8个碳原子,如三甲基甲硅烷基、三乙基甲硅烷基、三正丙基甲硅烷基、异丙基二甲基甲硅烷基、叔丁基二甲基甲硅烷基、叔丁基二苯基甲硅烷基、正辛基二甲基甲硅烷基、(1,1,2,2—四甲基乙基)—二甲基甲硅烷基;—(C1—C8烷基)2Si—O—Si(C1—C8烷基)2—,其中烷基为如甲基、乙基、正丙基、异丙基、正丁基、异丁基或叔丁基;C2—C12—酰基,特别是C2—C8—酰基,如乙酰基、丙酰基、丁酰基、戊酰基、己酰基、苯甲酰基、甲基苯甲酰基、甲氧基苯甲酰基、氯代苯甲酰基和溴代苯甲酰基;Rs1—SO2,其中Rs1为C1—C12烷基,特别是C1—C6烷基、C5—或C6—环烷基、苯基、苄基、C1—C12烷基苯基特别是C1—C4烷基苯基、或C1—C12—特别是C1—C4烷基苄基、或卤代苯基或卤代苄基,例如甲基—、乙基—、丙基—、丁基—、苯基—、苄基—、对溴苯基—、对甲氧苯基—及对甲基苯基—磺酰基;被F、Cl、Br、C1—C4烷氧基、三—(C1—C4烷基)甲硅烷基或被C1—C4烷基磺酰基取代或未取代的C1—C12—,优选C1—C8—烷氧羰基,例如甲氧基—、乙氧基—、正丙氧基—、异丙氧基—、正丁氧基—、异丁氧基—或叔丁氧基—羰基、2—三甲基甲硅烷基乙氧基羰基、2—甲基磺酰基乙氧基羰基、烯丙氧基羰基、或各自被烷氧羰基的上述取代基取代或未取代的苯氧基羰基或苄氧基羰基,例如甲基—或甲氧基—或氯—苯氧基羰基或—苄氧基羰基,及9—芴基甲氧羰基。当R1和/或R2为烷基时,它可被F、Cl、Br、C1—C4烷氧基、甲氧基、氯苯氧基、甲氧苯氧基、苄氧基、甲氧苄氧基或被氯苯氧基取代。式I中R1和R2可为相同或不同的保护基。特别优选作为保护基的R1和R2为苄基、甲基苄基、二甲基苄基、甲氧基苄基、二甲氧基苄基、卤化苄基(特别是溴代苄基);二苯基甲基、二(甲基苯基)甲基、二(二甲基苯基)甲基、二(甲氧苯基)甲基、二(甲氧苯基)(苯基)甲基、三苯基甲基、三—4,4′,4″—叔丁基苯基甲基、二—对茴香基苯基甲基、三(甲基苯基)甲基、三(二甲基苯基)甲基、三(甲氧苯基)甲基、三(二甲氧苯基)甲基;三甲基甲硅烷基、三乙基甲硅烷基、三正丙基甲硅烷基、异丙基—二甲基甲硅烷基、叔丁基—二甲基甲硅烷基、叔丁基二苯基甲硅烷基、正辛基—二甲基甲硅烷基、(1,1,2,2—四甲基乙基)—二甲基甲硅烷基、—(CH3)2Si—O—Si(CH3)2—、—(i—C3H7)2Si—O—Si(i—C3H7)2—;乙酰基、丙酰基、丁酰基、戊酰基、己酰基、苯甲酰基、甲基苯甲酰基、甲氧基苯甲酰基、氯苯甲酰基和溴苯甲酰基;甲基—、乙基—、丙基—、丁基—、苯基—、苄基—、对溴苯基—、对甲氧苯基—和对甲基苯基—磺酰基;甲氧基—、乙氧基—、正或异丙氧基—或正或异或叔丁氧基羰基、或苯氧基羰基、苄氧基羰基、甲基—、或甲氧基—或氯—苯氧基羰基或—苄氧基羰基或9—芴基甲氧基羰基。作为形成核苷酸桥基的含磷残基的R2可为式P1或P2 其中Ya为氢、C1—C12烷基、C6—C12芳基、C7—C20芳烷基、C7—C20烷芳基、—ORb、-SRb、—NH2、伯氨基、仲氨基、O_M_或S_M_;Xa为氧或硫;Ra为氢、M_、C1—C12烷基、C2—C12链烯基、C6—C12芳基、或RaO—基团为具有含1—3个N原子的5之环的N—杂芳基—N—基;Rb为氢、C1—C12烷基或C6—C12芳基;及M_为Na_、K_、Li_、NH4_或伯、仲、叔或季铵离子;Ya、Ra和Rb中的烷基、本文档来自技高网...

【技术保护点】
式Ⅰ化合物:*** (Ⅰ)其中R↓[1]和R↓[2]各自相互独立地为氢或保护基,或R↓[1]如上所定义和R↓[2]为形成含磷核苷酸桥基的残基;B为嘌呤或嘧啶残基或其类似物;及R↓[3]为OH,F或(CF↓[2]) ↓[n]CF↓[3],其中n为0-7的数。

【技术特征摘要】
...

【专利技术属性】
技术研发人员:P马丁
申请(专利权)人:诺瓦提斯公司
类型:发明
国别省市:CH[瑞士]

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