水稻强耐盐高活力基因qSE3的分子标记及其应用制造技术

本发明专利技术公开了水稻强耐盐高活力基因qSE3的分子标记及其应用。利用本发明专利技术SSR标记的引物中的一对或多对对水稻基因组DNA进行PCR扩增，PCR扩增产物在8％非变性聚丙烯酰胺胶上进行电泳检测，如果扩增出对应大小的DNA片段，标志着控制水稻强耐盐高活力基因qSE3增效等位基因存在。通过本发明专利技术的与强耐盐高活力基因qSE3共分离和紧密连锁的分子标记方法，可预测水稻种子萌发期耐盐性水平，能快速筛选出水稻种子萌发期耐盐性品种。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术属于种子科学与技术应用领域，涉及水稻强耐盐高活力基因qSE3的分子标记及其应用。
技术介绍
水稻(Oryza sativa L.)是我国重要的粮食作物之一，属淡水沼泽植物，对盐较为敏感。由于长期灌溉和施肥不当导致土壤中盐分积累，我国盐碱稻作区面积约占水稻栽培总面积的20％。同时，我国现有沿海滩涂面积3,500多万亩，每年还以一定的速度淤长。近年来，随着经济的发展，农村劳动力日益短缺，直播、机插秧水稻轻简栽培变得越来越普遍，水稻萌发期的盐害显得尤为突出；同时，水稻强耐盐品种的培育对我国盐碱滩涂地土壤的利用具有重要现实意义。目前，多位学者利用不同RILs、DH、F2:3等水稻作图群体，已定位了多个贡献率大于20％水稻盐胁迫相关主效QTLs。迄今，仅有一个苗期主效QTL SKC1被成功克隆。但有关水稻种子萌发期耐盐性基因克隆，以及盐胁迫下种子萌发形成正常幼苗的分子机理还未见报道。高活力种子能够形成高、壮、整齐一致的幼苗，确保作物产量与质量。通过图位克隆法已成功克隆多个与种子萌发相关基因，如：qLTG3-1、Sdr4、OsVP1、OsGA20ox1、OsFbx352及GD1等，但本文档来自技高网...

【技术保护点】
水稻强耐盐高活力基因qSE3的分子标记，其特征在于所述的分子标记选自jm3、jm6、jm31和jm32中的任意一种；所述的分子标记jm3的上游引物为jm3L：SEQ ID NO.1，下游引物为jm3R：SEQ ID NO.2，扩增产物大小为116bp；所述的分子标记jm6的上游引物为jm6L：SEQ ID NO.3，下游引物为jm6R：SEQ ID NO.4，扩增产物大小为154bp；所述的分子标记jm31的上游引物为jm31L：SEQ ID NO.5，下游引物为jm31R：SEQ ID NO.6，扩增产物大小为233bp；所述的分子标记jm32的上游引物为jm32L：SEQ ID NO.7，...

【技术特征摘要】
1.水稻强耐盐高活力基因qSE3的分子标记，其特征在于所述的分子标记选自jm3、jm6、jm31和jm32中的任意一种；所述的分子标记jm3的上游引物为jm3L：SEQ ID NO.1，下游引物为jm3R：SEQ ID NO.2，扩增产物大小为116bp；所述的分子标记jm6的上游引物为jm6L：SEQ ID NO.3，下游引物为jm6R：SEQ ID NO.4，扩增产物大小为154bp；所述的分子标记jm31的上游引物为jm31L：SEQ ID NO.5，下游引物为jm31R：SEQ ID NO.6，扩增产物大小为233bp；所述的分子标记jm32的上游引物为jm32L：SEQ ID NO.7，下游引物为jm31R：SEQ ID NO.8，扩增产物大小为214bp。2.权利要求1所述的水稻强耐盐高活力基因qSE3的分子标记引物，其特征在于所述的分子标记jm3的上游引物为jm3L：SEQ ID NO.1，下游引物为jm3R：SEQ ID NO.2，扩增产物大小为116bp；所述的分子标记jm6的上游引物为jm6L：SEQ ID NO.3，下游引物为jm6R：SEQ ID NO.4，扩增产物大小为154bp；所述的分子标记jm31的上游引物为jm31L：SEQ ID NO.5，下游引物为jm31R：SEQ ID NO.6，扩增产物大小为233bp；所述的分子标记jm32的上游引物为jm32L：SEQ ID NO.7，下游引物为jm31R：SEQ ID NO.8，扩增产物大小为214bp。3.权利要求1所述的分子标记在分子筛选种子萌发期耐盐的水稻品种中的应用。4.权利要求2所述的分子标记引物在分子筛选种子萌发期耐盐的水稻品种中的应用。5.筛选水稻耐盐高活力基因qSE3增效等位基因存在与否的方法，其特征在于包含如下步骤：(1)取水稻叶片...

【专利技术属性】
技术研发人员：王州飞，张红生，程金平，何永奇，王建飞，黄骥，鲍永美，
申请(专利权)人：南京农业大学，
类型：发明
国别省市：江苏;32