鉴定tms5基因水稻种子的引物组及用其检测种子纯度的方法技术

本发明专利技术公开了鉴定tms5基因水稻种子的引物组及用其检测种子纯度的方法，包括TA突变型检测：设计上下游引物、野生型W1‑P、TA突变型MTA‑PNFQ特异性探针；TC突变型检测：设计上下游引物、野生型W2‑P、TC突变型MTC‑P特异性探针；用引物组检测种子纯度的方法：根据母本胚乳aa和F1子一代胚乳基因型Aaa，采用在F1子一代胚乳中梯度掺入母本胚乳，建立1％、5％、10％、15％、20％、30％、50％质量掺入比(母本/子一代)对应的实际测定拷贝数比a/A和理论拷贝数比a/A曲线，计算出种子的纯度；能快速鉴别水稻tms5不育系，检测灵敏度高、特异型好、检测时间短，可在1‑2小时内完成对tms5基因野生型和突变型的检测和区分；针对子一代种子纯度的检测比现有的方法检测周期短。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术属于基因检测领域，具体涉及，具体涉及鉴定tms5基因水稻种子的引物组及用其检测种子纯度的方法。
技术介绍
我国是世界上最早种植水稻的国家之一，目前在我国有过半人口以水稻作为膳食中主粮。水稻杂交育种方式大大增加了水稻的产量和质量，是目前我国水稻增产的主要方式，在国家粮食战略中占有重要地位。目前水稻杂交选育主要有三系法和两系法，与三系法相比，两系法简化繁殖，制种程序，降低种子生产成本，使水稻产量在现有杂交水稻基础上实现更高产目标。但两系法中不育系在制种过程中孕穗期遇低温会自交结实，另外不育起点温度漂变等导致育种失败现象常有发生，对两系法育种十分不利。因此开发新的水稻不育基因标记方法，加速不育系基因的鉴别，缩短育种周期和提高制种质量，对推动两系法杂交水稻的育种具有重要意义。wang等(2003)选取定位F2群体安农S-1×南京11，将tms5定位于第二号染色体的STS标记C365-1与CAPs标记G227-1之间，距离2个标记的物理距离分别是1.04cM和2.08cM。姜大刚等(2006) 选取3个F2群体(分别为安农S-1×安农N,安农S-1×IR36和安农S-1转育的香12本文档来自技高网...

【技术保护点】
鉴定tms5基因水稻种子的PCR引物组，其特征在于，包括TA突变型检测：上下游引物、野生型W1‑P、TA突变型MTA‑P NFQ特异性探针：上游引物P1‑F:TTACAGGCTAGATGTTGAAGAAGCA下游引物P1‑R:GTTTTGGCACGAAGCACGAT野生型W1–P探针:FAM‑TCCAACggctAGCAGTA‑NFQ突变型MTA‑P探针:VIC‑CCAACgccAGCAGTA‑NFQTC突变型检测：上下游引物、野生型W2‑P、TC突变型MTC‑P上游引物P2‑F:CGGCGACCTCCACCAC下游引物P2‑R:GCCCGCCGATGGAGATG野生型W2–P探针:FAM‑C...

【技术特征摘要】
1.鉴定tms5基因水稻种子的PCR引物组，其特征在于，包括TA突变型检测：上下游引物、野生型W1-P、TA突变型MTA-P NFQ特异性探针：上游引物P1-F:TTACAGGCTAGATGTTGAAGAAGCA下游引物P1-R:GTTTTGGCACGAAGCACGAT野生型W1–P探针:FAM-TCCAACggctAGCAGTA-NFQ突变型MTA-P探针:VIC-CCAACgccAGCAGTA-NFQTC突变型检测：上下游引物、野生型W2-P、TC突变型MTC-P上游引物P2-F:CGGCGACCTCCACCAC下游引物P2-R:GCCCGCCGATGGAGATG野生型W2–P探针:FAM-CCTTCGACTTCGGC-NFQ突变型MTC-P探针:VIC-CCTTCGCCTTCGGC-NFQ 。2.根据权利要求1所述的鉴定tms5基因水稻种子的PCR引物组，其特征在于，tms5基因水稻种子的PCR引物组在通过PCR扩增自生物体获得的核酸样品在检测水稻种子纯度中的用途。3.一种使用权利要求1所述的鉴定tms5基因水稻种子的PCR引物组对水稻种子是否含有tms5基因鉴定、分型的方法，其特征在于，包括以下步骤：步骤一、提取杂交种子或叶片中DNA；步骤二、TA突变型检测：制备上下游引物、野生型W1-P、TA突 变型MTA-PNFQ特异性探针：上游引物P1-F:TTACAGGCTAGATGTTGAAGAAGCA下游引物P1-R:GTTTTGGCACGAAGCACGAT野生型W1–P探针:FAM-TCCAACggctAGCAGTA-NFQ突变型MTA-P探针:VIC-CCAACgccAGCAGTA-NFQTC突变型检测：制备上下游引物、野生型W2-P...

【专利技术属性】
技术研发人员：宗凯，姚剑，李云飞，余晓峰，吕侠影，陈雪娇，孙娟娟，周莉质，王满满，郑海松，
申请(专利权)人：安徽出入境检验检疫局检验检疫技术中心，
类型：发明
国别省市：安徽;34