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【技术实现步骤摘要】
本专利技术涉及生物医学信息化,更具体地,涉及一种可视化癌症基因关系显示方法和系统。
技术介绍
1、从分子生物学的角度来看,肿瘤是由于某些染色体上dna损伤致使细胞内基因异常表达,导致细胞生长失控、缺乏分化和异常增生的一类复杂基因疾病,因而肿瘤也是一种系统的生物疾病,到目前为止人类仍然不完全清楚肿瘤发生发展的机理。众所周知,晚期肿瘤病人的治疗效果常常不佳,而肿瘤的早期诊断对肿瘤的成功治疗却很有帮助。然而,采用传统的诸如x射线检测肿瘤团块的方法进行早期肿瘤诊断有一定的困难。特别是肿瘤的不同亚型对于同样的治疗却有不同的治疗效果。因此采用现代数据挖掘技术对基因表达谱进行深入研究对于揭示肿瘤发生发展过程与肿瘤分子诊断具有重要的现实意义。
2、近年来,随着对病毒感染的肿瘤患者进行的高通量测序和微阵列技术的不断完善,产生了非常可观的表达谱数据,为探索不同病毒感染状态下肿瘤免疫微环境的差异,并为肿瘤免疫治疗提供一定的理论基础。肿瘤免疫微环境是一个极为复杂的体系,其内在的各种免疫细胞、基质细胞及细胞因子均可与肿瘤细胞相互作用,且这些免疫系统网络的调控与肿瘤存在着复杂的相互作用并对肿瘤发生发展和免疫治疗应答产生重要影响。
3、当前社会中,对于每类癌症来说,由于突变位点众多,因此只能使用生物信息学及统计学的方法可以筛选出对于某类癌症高突变的基因或位点,但现有技术的种种关键驱动基因查找方法无法基于历史的大数据进行合理分析并直观向用户显示以指导相关用户进行癌症基因诊断。
技术实现思路
2、肿瘤实体节点决策所述肿瘤实体节点至病毒实体节点的传染轨迹信息,其中,所述肿瘤实体节点与所述病毒实体节点为一对具有关联关系的病源实体节点;
3、当所述肿瘤实体节点在接收到发往表达基因实体节点的因子受体时,如果所述肿瘤实体节点至所述表达基因实体节点的已存在关系冲突,则所述肿瘤实体节点根据所述传染轨迹信息,将所述因子受体传递至所述病毒实体节点,经所述病毒实体节点将所述因子受体传递至所述表达基因实体节点;
4、依据所述肿瘤实体节点、病毒实体节点和表达基因实体节点的传递关系显示传染轨迹图。
5、进一步的,所述肿瘤实体节点决策所述肿瘤实体节点至病毒实体节点的传染轨迹信息之后,还包括:
6、如果所述肿瘤实体节点与所述病毒实体节点之间有信号通路,则所述肿瘤实体节点决策所述传染轨迹信息为所述肿瘤实体节点至所述病毒实体节点的诱因信息。
7、进一步的,所述当所述肿瘤实体节点在接收到发往表达基因实体节点的因子受体时,如果所述肿瘤实体节点至所述表达基因实体节点的已存在关系冲突,则所述肿瘤实体节点根据所述传染轨迹信息,将所述因子受体传递至所述病毒实体节点,包括:
8、当所述肿瘤实体节点在接收到发往表达基因实体节点的因子受体时,如果所述肿瘤实体节点至所述表达基因实体节点的已存在关系冲突,且所述肿瘤实体节点与所述病毒实体节点之间的已存在关系冲突,则所述肿瘤实体节点根据所述传染轨迹信息,将所述因子受体传递至所述病毒实体节点。
9、进一步的,所述决策所述肿瘤实体节点至病毒实体节点的传染轨迹信息,包括:
10、肿瘤实体节点在知识图谱信息中添加已检测病源实体节点,并分别更新所述已检测病源实体节点与所述肿瘤实体节点、病毒实体节点之间的已存在关系,其中,所述已检测病源实体节点的所属组织与所述肿瘤实体节点的所属组织相同;
11、根据所述肿瘤实体节点、所述已检测病源实体节点和所述肿瘤实体节点、病毒实体节点之间的已存在关系,决策所述肿瘤实体节点至所述病毒实体节点的传染轨迹信息;
12、所述肿瘤实体节点的所属组织包括第一器官和第二器官,所述病毒实体节点的所属组织包括所述第一器官和所述第二器官,所述第一器官对应的第一传染轨迹长度差值与所述第二器官对应的第二传染轨迹长度差值相等,所述第一传染轨迹长度差值为在所述第一器官下所述肿瘤实体节点至所述已检测病源实体节点的传染轨迹长度和所述病毒实体节点至所述已检测病源实体节点的传染轨迹长度的差值,所述第二传染轨迹长度差值为在所述第二器官下所述肿瘤实体节点至所述已检测病源实体节点的传染轨迹长度和所述病毒实体节点至所述已检测病源实体节点的传染轨迹长度的差值。
13、进一步的,所述已检测病源实体节点至所述肿瘤实体节点的传染轨迹长度及所述已检测病源实体节点至所述病毒实体节点的传染轨迹长度为大于预设阈值的预设数值;
14、所述肿瘤实体节点接收所述病毒实体节点发送的显示信息,其中,所述显示信息中携带所述病毒实体节点的段标识器官;
15、所述肿瘤实体节点决策所述肿瘤实体节点至病毒实体节点的传染轨迹信息,条件为:
16、所述肿瘤实体节点的器官与所述病毒实体节点的器官相同。
17、根据本专利技术第二方面,本专利技术请求保护一种可视化癌症基因关系显示系统,其特征在于,所述系统包括:
18、传染轨迹确定模块,决策所述肿瘤实体节点至病毒实体节点的传染轨迹信息,其中,所述肿瘤实体节点与所述病毒实体节点为一对具有关联关系的病源实体节点;
19、基因传递模块,依据所述肿瘤实体节点在接收到发往表达基因实体节点的因子受体情况,将因子受体传递至所述病毒实体节点,经所述病毒实体节点将所述因子受体传递至所述表达基因实体节点;
20、显示模块,依据所述肿瘤实体节点、病毒实体节点和表达基因实体节点的传递关系显示传染轨迹图;
21、所述一种可视化癌症基因关系显示系统用于执行所述的一种可视化癌症基因关系显示方法。
22、本申请涉及生物医学
,涉及一种可视化癌症基因关系显示方法和系统,肿瘤实体节点决策肿瘤实体节点至病毒实体节点的传染轨迹信息,其中,肿瘤实体节点与病毒实体节点为一对具有关联关系的病源实体节点;当肿瘤实体节点在接收到发往表达基因实体节点的因子受体时,如果肿瘤实体节点至表达基因实体节点的已存在关系冲突,则肿瘤实体节点根据传染轨迹信息,将因子受体传递至病毒实体节点,经病毒实体节点将因子受体传递至表达基因实体节点;依据肿瘤实体节点、病毒实体节点和表达基因实体节点的传递关系显示传染轨迹图。本专利技术可以基于历史的大数据进行合理分析并直观向用户显示各种病源因子数据以指导相关用户进行癌症基因诊断。
【技术保护点】
1.一种可视化癌症基因关系显示方法,其特征在于,所述方法包括:
2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述肿瘤实体节点决策所述肿瘤实体节点至病毒实体节点的传染轨迹信息之后,还包括:
3.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,所述当所述肿瘤实体节点在接收到发往表达基因实体节点的因子受体时,如果所述肿瘤实体节点至所述表达基因实体节点的已存在关系冲突,则所述肿瘤实体节点根据所述传染轨迹信息,将所述因子受体传递至所述病毒实体节点,包括:
4.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述决策所述肿瘤实体节点至病毒实体节点的传染轨迹信息,包括:
5.根据权利要求4所述的方法,其特征在于,所述已检测病源实体节点至所述肿瘤实体节点的传染轨迹长度及所述已检测病源实体节点至所述病毒实体节点的传染轨迹长度为大于预设阈值的预设数值;
6.一种可视化癌症基因关系显示系统,其特征在于,所述系统包括:
【技术特征摘要】
1.一种可视化癌症基因关系显示方法,其特征在于,所述方法包括:
2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述肿瘤实体节点决策所述肿瘤实体节点至病毒实体节点的传染轨迹信息之后,还包括:
3.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,所述当所述肿瘤实体节点在接收到发往表达基因实体节点的因子受体时,如果所述肿瘤实体节点至所述表达基因实体节点的已存在关系冲突,则所述肿瘤实体节点根据所述传染轨迹信息,将所述...
【专利技术属性】
技术研发人员:王吉锐,白义凤,彭盛坤,刘宇,陈易,吕雪莲,
申请(专利权)人:四川省医学科学院·四川省人民医院,
类型:发明
国别省市:
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