微生物在鉴别和/或区分不同种族个体中的应用制造技术

本发明专利技术提供了微生物在鉴别和/或区分不同种族个体中的应用及检测微生物丰度的产品在鉴别和/或区分不同种族个体中的应用，本发明专利技术还提供了一种鉴别和/或区分不同种族个体的方法，所述的方法包括检测个体肠道和/或粪便中的Allisonella菌属的相对丰度，并与阈值比较。

Application of Microorganisms in Identifying and/or Distinguishing Individuals of Different Races

The invention provides the application of microorganisms in identifying and/or differentiating individuals of different races and the application of products for detecting microbial abundance in identifying and/or differentiating individuals of different races. The invention also provides a method for identifying and/or differentiating individuals of different races. The method includes detecting the relative abundance of Allisonella bacteria in the intestines and/or feces of individuals and matching the threshold value. Comparison.

【技术实现步骤摘要】
微生物在鉴别和/或区分不同种族个体中的应用
本专利技术涉及生物医药
，具体涉及微生物在鉴别和/或区分不同种族个体中的应用，更具体的，涉及检测Allisonella菌属的相对丰度，并与阈值比较，鉴定个体种族来源的方法。
技术介绍
高原反应即高原病，是人到达一定海拔高度后，身体为适应因海拔高度而造成的气压差、含氧量少、空气干燥等的变化而产生的自然生理反应。高原反应的症状一般表现为头疼、心慌、疲倦、胸闷、气短、呕吐、食欲减退、抽搐、意识恍惚、认知能力骤降等。体征为心率加快、呼吸加深、血压轻度异常、颜面或四肢水肿、口唇紫绀等。高原心脏病是高原病的一种，由于高原低压缺氧环境引起的心脏结构功能受损，以肺动脉高压和右心功能受损为特征。青藏高原的藏族居民是全球主要高海拔人群，对高原的低氧、低气压环境进行了长期的生理和遗传适应，低氧环境下肺血管收缩反应性降低，具备更好的运动能力。人体肠道中存在大量的共生菌群，其数量超过1000万亿个，大约是人体细胞总数的10倍。同时肠道内微生物基因的数量约为300万个，大约是人类基因组基因数量的100多倍，如此海量的基因能够帮助微生物适应多变的环境，形成了与人体密不可分的共生关系。不同遗传背景和生活习惯的居民其肠道菌群组成存在较大差异，例如拟杆菌属是西方居民肠道中相对含量最多且个体间差异最大的细菌属，韩国居民是栖粪杆菌属。菌属的差异也暗示个体对当地环境的耐受能力。对于个体在高原环境下的耐受能力或者高原病的诊断标志物，目前研究广泛。例如，专利CN106248947A公开了一种脂质和多糖的复合物脂多糖作为哺乳动物高原脑水肿标志物的用途，实验检测进入高原低氧环境后哺乳动物血浆中脂多糖的含量，当血浆中脂多糖的含量超过0.5EU/mL时，哺乳动物脑组织含水量明显增加。专利CN104614462B公开了C8-神经酰胺、鞘氨醇和谷氨酰胺作为高原肺水肿诊断标志物，检测此诊断标志物的诊断试剂盒诊断结果准确度高，为高原肺水肿的诊断提供了可量化的、客观灵敏的临床诊断指标。专利CN102605089B公开了以单核苷酸多态性为标志物检测高原红细胞过度增多的易感性，其中提供了检测单核苷酸多态性引物及试剂盒。专利CN101135666B、CN101470095B、CN101470096A、CN101135665B、CN101469345B、CN101135667B、CN1898394B均公开了以单核苷酸多态性为标志物检测高原肺水肿的易感性，其中提供了检测单核苷酸多态性引物及试剂盒。但是，迄今为止，尚未见以Allisonella菌属作为标志物，来鉴别和/或区分不同种族个体的技术方案。
技术实现思路
本专利技术的第一方面，提供了微生物在鉴别和/或区分不同种族个体中的应用。优选的，所述的微生物为Allisonella菌属。进一步优选的，所述的微生物为肠道或粪便中的Allisonella菌属。在本专利技术的一个具体实施方式中，所述的微生物为肠道或粪便中的Allisonellahistaminiformans。优选的，所述的不同种族为高原环境的种族和平原环境的种族。在本专利技术的一个具体实施方式中，所述的不同种族为藏族和汉族。在本专利技术的一个具体实施方式中，所述的不同种族为高原环境下生活的藏族和汉族。本专利技术的第二方面，提供了一种鉴别和/或区分不同种族个体的方法，所述的方法包括检测所述不同种族个体的肠道和/或粪便中微生物的丰度，将所述的微生物的丰度值与阈值比较，确定所述不同种族个体为高原环境的种族或平原环境的种族。本专利技术所述的高原环境为海拔2000m以上，具有低压、缺氧的条件。优选的，所述的高原环境为海拔2700m以上，具有低压、缺氧的条件下。在本专利技术的一个具体实施方式中，所述的高原环境为海拔3500m以上，具有低压、缺氧的条件下。在本专利技术的一个具体实施方式中，所述的高原环境为海拔5500m以上，具有低压、缺氧的条件下。优选的，所述的方法包括如下步骤：1)提取待测个体粪便或肠道中的微生物核酸；2)扩增步骤1)提取的微生物核酸；3)对步骤2)扩增的核酸进行测序；4)计算Allisonella菌属的相对丰度；5)将步骤4)所述的Allisonella菌属的相对丰度值与9.98×10-5相比；其中，Allisonella菌属的相对丰度值大于9.98×10-5确定为藏族人，Allisonella菌属的相对丰度值小于9.98×10-5确定为汉族人。本专利技术的第三方面，提供了检测微生物丰度的产品在鉴别和/或区分不同种族个体中的应用。优选的，所述的微生物为Allisonella菌属。优选的，所述的不同种族为高原环境的种族和平原环境的种族。本专利技术的第四方面，提供了一种检测微生物丰度的产品，所述的产品包括检测微生物相对丰度的试剂和/或装置，优选的，所述的微生物为Allisonella菌属。本专利技术的第五方面，提供了检测Allisonella菌属的试剂在制备评估个体高原环境下耐受能力的产品中的应用。优选的，所述的Allisonella菌属为肠道中的Allisonella菌属。本专利技术所述的检测Allisonella菌属的试剂为检测Allisonella菌属丰度的试剂。优选的，所述的检测Allisonella菌属的试剂为检测个体肠道中的Allisonella菌属丰度的试剂。在本专利技术的一个具体实施方式中，所述的检测Allisonella菌属的试剂为检测个体粪便中的Allisonella菌属丰度的试剂。本专利技术所述的高原环境下耐受能力为高原病的易感程度。本专利技术所述的高原环境为海拔2000m以上，具有低压、缺氧的条件。优选的，所述的高原环境为海拔2700m以上，具有低压、缺氧的条件下。在本专利技术的一个具体实施方式中，所述的高原环境为海拔3500m以上，具有低压、缺氧的条件下。在本专利技术的一个具体实施方式中，所述的高原环境为海拔5500m以上，具有低压、缺氧的条件下。本专利技术的第六方面，提供了一种鉴别和/或区分不同种族个体的微生物，所述的微生物为Allisonella菌属。优选的，所述的微生物为肠道或粪便中的Allisonella菌属。在本专利技术的一个具体实施方式中，所述的微生物为粪便中的Allisonella菌属。本专利技术的第七方面，提供了一种评估高原环境耐受能力的标志物，所述的标志物为Allisonella菌属。优选的，所述的标志物为肠道内的Allisonella菌属。在本专利技术的一个具体实施方式中，所述的标志物为粪便中的Allisonella菌属。本专利技术的第八方面，提供了一种评估个体高原环境下耐受能力的产品，所述的产品包含检测Allisonella菌属的试剂。优选的，所述的检测Allisonella菌属的试剂为检测个体肠道中的Allisonella菌属丰度的试剂。在本专利技术的一个具体实施方式中，所述的检测Allisonella菌属的试剂为检测个体粪便中的Allisonella菌属丰度的试剂。本专利技术所述的产品包含检测Allisonella菌属的试剂及检测其他菌的试剂。本专利技术的第九方面，提供了一种检测Allisonella菌属丰度的方法，所述的方法包括对样本进行16SrRNA测序，和对测序获得的reads进行OTU聚类及物种注释。优选的，所述的16SrRNA测序之后、OTU聚类本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.微生物在鉴别和/或区分不同种族个体中的应用，其特征在于，所述的微生物为Allisonella菌属。

【技术特征摘要】
1.微生物在鉴别和/或区分不同种族个体中的应用，其特征在于，所述的微生物为Allisonella菌属。2.根据权利要求1所述的应用，其特征在于，所述的微生物为肠道或粪便中的Allisonella菌属。3.根据权利要求1或2所述的应用，其特征在于，所述的微生物为肠道或粪便中的Allisonellahistaminiformans。4.根据权利要求1-3任一所述的应用，其特征在于，所述的不同种族为高原环境的种族和平原环境的种族。5.根据权利要求1-4任一所述的应用，其特征在于，所述的不同种族为藏族和汉族。6.一种鉴别和/或区分不同种族个体的方法，其特征在于，所述的方法包括检测所述不同种族个体的肠道和/或粪便中微生物的丰度，将所述的微生物的丰度值与阈值比较，确定所述不同种族个体为高原环境的种族或平原环境的种族。7.根据权利要求6所述的方法，其特征在于，所...

【专利技术属性】
技术研发人员：何昆仑，冯强，赵乐，兰翔，许振国，刘继轩，赵晓静，崔佳奕，王依慧，
申请(专利权)人：中国人民解放军总医院，
类型：发明
国别省市：北京,11