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本发明提供了与菠菜性别基因Y共分离的分子标记S5.7及其应用，属于植物分子遗传育种领域。本发明提供的分子标记S5.7在菠菜雄株里可以扩出了126bp的特异条带，在雌株里没有扩出条带，扩增其的引物序列如SEQ ID NO.2-3所示。本发明提...该专利属于中蔬种业科技（北京）有限公司;中国农业科学院蔬菜花卉研究所所有，仅供学习研究参考，未经过中蔬种业科技（北京）有限公司;中国农业科学院蔬菜花卉研究所授权不得商用。