【技术实现步骤摘要】
【技术保护点】
一种PBR1基因标记筛选防治根肿病潜在菌株的方法,包括以下步骤:(1)从待测菌株组织中提取基因组DNA,以提取的基因组DNA为模板,用PBR1引物进行PCR扩增,获得PCR产物,用1%琼脂糖凝胶对PCR扩增产物进行电泳检测,选择电泳单条带约753bp的PCR产物进行测序得待测菌株的核苷酸序列;所述的PBR1引物由上游引物PBR101和下游引物PBR102组成,所述的上游引物PBR101的碱基序列如序列表中SEQ?ID?NO:2所示,所述的下游引物PBR102的碱基序列如序列表中SEQ?ID?NO:3所示;(2)如果步骤(1)获得的待测菌株的核苷酸序列与PBR1基因标记的核苷酸序列的同源性在98%以上,并且包含一个开放阅读框,则将待测菌株的核苷酸序列翻译得到氨基酸序列与抗菌蛋白PBR1的氨基酸序列进行比对,如果待测菌株的氨基酸序列与所述抗菌蛋白PBR1的氨基酸序列的同源性为100%,则该待测菌株为防治根肿病潜在菌株;所述PBR1基因标记的核苷酸序列如序列表中SEQ?ID?NO:1所示,所述抗菌蛋白PBR1的氨基酸序列如SEQ?ID?NO:4所示。
【技术特征摘要】
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