人体内含有外源重组DNA来源的转录本、DNA片段、或其翻译产物，及其检测方法和应用技术

本发明专利技术涉及人体内含有外源重组DNA来源的转录本、DNA片段、或其翻译产物，及其检测方法和应用。具体地，人体内来自于外源重组DNA的氨苄青霉素抗性基因的一种转录本(rAmp)能够与内源酰基辅酶A：胆固醇酰基转移酶1(ACAT1)基因的转录本发生反式剪接，从而形成一种独特的新转录本及其翻译产物。本发明专利技术还提供了检测人体内是否含外源重组DNA来源的转录本、DNA片段、或其翻译产物的方法和应用。

【技术实现步骤摘要】
人体内含有外源重组DNA来源的转录本、DNA片段、或其翻译产物，及其检测方法和应用
本专利技术属于分子生物学、分子遗传学和细胞生物学领域，具体地，本专利技术涉及人体内含有外源重组DNA来源的转录本、DNA片段、或其翻译产物，及其检测方法和应用。
技术介绍
重组DNA技术自上世纪七十年代创立以来发展非常快速，不仅产生了分子生物学这ー新生学科，也拓展了各类生命学科及其相关学科的前沿基础研究，并且建立了动物、植物、微生物等的细胞、组织、器官、个体等转基因系统。这些研究成果的成功运用获得各种大量的转基因产物，特别是建立了在临床医学中对与疾病治疗和应用相关的基因工程与基因治疗等体系。这些发展既具有商业性、经济性等方面巨大的建设与价值，也产生理论性、社会性等深远的影响与意义。利用重组DNA技术建立的各种转基因系统，包括利用重组载体(Vector)或重组质粒(Plasmid)或其它特异重组DNA等,将人工分离或修饰的基因导入到生命体细胞内或进入基因组中，导入基因的表达可以引起宿主生命体性状的可遗传的修饰,建立的这一重组DNA技术系统称之为转基因系统。在转基因过程中，体外构建重组载体或重组质粒或其它特异重组DNA等必不可少，通常其含有复制起点、启动子、标记基因、翻译控制元件、转录终止子等各种元件、或其组合元件，使可携帯经过人工改造的目的基因或DNA片段进入宿主细胞内或进入基因组内。随着重组DNA技术的广泛应用，除转基因系统体外构建的重组载体或重组质粒或其它特异重组DNA等外，还包括大量构建的不同容量的重组DNA库、突变DNA库及其筛选系统等。这些重组DNA技术的产物也已在自然环境中分布，许多已知的这类基因存在于转座子、整合子或质粒中，能够通`过接合(conjunction)或水平基因转移(horizontal genetransfer, HGT)等方式进入到同种甚至不同种的其它细菌等生命体,如在人类的ー些病原生物和共生细菌(肠道微生物群)中都有抗性基因转移的证据等，但是否已进入人体内细胞或基因组、是否进入人体内细胞或基因组表达并引起作用，国际社会在非常密切关注中。由于重组DNA技术的迅速发展，人们对包括转基因系统、DNA库筛选系统等的安全性越来越重视。就转基因食品而言，虽然市场上第一个转基因食品早在上个世纪九十年代初就出现在美国市场，但是目前经美国食品和药物管理局确定的转基因食品品种只有几十种。此外，由于转基因作物或植物或微生物是人工制造的物种，这些物种对于自然界原来存在的物种而言，是ー种外来物种，而且，这些外来物种对环境或生物多样性造成威胁或危险会持续一段较长的时间，如需10年或更长的时间。目前本领域尚不明确重组DNA技术的外源产物是否已进入人或非人哺乳动物的体内细胞或基因组、是否进入体内细胞或基因组表达并引起作用、是否由新生重组启动子或其它连接的启动子转录表达、人体内外源重组DNA的转录本或翻译产物或DNA片段及其对人体内源基因组DNA或其来源的转录本与翻译产物的影响等，因此迫切需要进行这些方面的研究。
技术实现思路
本专利技术的目的就是提供ー种人体内含有外源重组DNA来源的转录本、DNA片段、或其翻译产物及其检测方法和应用。在本专利技术的第一方面，提供了一种分离的转录本，所述转录本分离自人或非人哺乳动物，并且所述的转录本是:(a):来自于外源重组DNA的转录本与人或非人哺乳动物基因组的转录本的剪接转录本；或(b):来自于外源重组DNA的未剪接的转录本。在另ー优选例中，所述的转录本是氨苄青霉素抗性基因或其片段与酰基辅酶A:胆固醇酰基转移酶I(ACATl)基因或其片段组成的剪接转录本；优选地，所述的剪接转录本具有如SEQ ID N0.: 1所示的多核苷酸。在另ー优选例中，所述的转录本是来自于外源重组DNA的未剪接的氨苄青霉素抗性基因或其DNA片段的转录本；优选地，所述的转录本具有如SEQ ID N0.: 2所示的多核苷酸。在本专利技术的第二方面，提供了一种分离的DNA片段，所述的DNA片段分离自人或非人哺乳动物，并且所述的DNA片段来自于外源重组DNA，并重组于人或非人哺乳动物基因组中。在另ー优选例中，所述的DNA片段编码权利要求1所述的来自于外源重组DNA的未剪接的转录本。在本专利技术的第三方面，提供了一种分离的翻译产物，所述的翻译产物是由第一方面所述转录本所翻译的。在本专利技术的第四方面，提供了ー种第一方面所述的转录本、第二方面所述的DNA片段、或第三方面所述的翻译产物的用途，用于制备检测试剂或试剂盒，所述检测试剂或试剂盒用于检测人或非人哺乳动物基因组中是否含有来自于外源重组DNA的DNA片段，或所述的人或非人哺乳动物中是否存在来自于外源重组DNA的转录本或其翻译产物。在本专利技术的第五方面，提供了一种非诊断性和非治疗性的检测方法，包括步骤:检测待测样本中是否含有来自于外源重组DNA的DNA片段、或来自于外源重组DNA的转录本，或所述转录本的翻译产物，其中所述的待测样本为人或非人哺乳动物的样本，并且所述的来自于外源重组DNA的DNA片段、或来自于外源重组DNA的转录本，或所述转录本的翻译产物在样本中是不存在的。在另ー优选例中，所述的内源基因组来源的转录本或翻译产物样本是没有被外源重组DNA污染的样本。在另ー优选例中，所述的样本含DNA或RNA，并且所述检测包括步骤:(I)获得待测样本的基因组DNA，或将待测样本的RNA逆转录为DNA ；(2)检测步骤(1)所述的DNA中是否含有来自于外源重组DNA的多核苷酸或其互补序列，并且所述的多核苷酸或其互补序列在内源基因组中、或其转录本中不存在。在另ー优选例中，所述的转录本包括未剪接的转录本和经剪接的转录本。在另ー优选例中，所述的经剪接的转录本包括经反式剪接或顺式剪接的转录本。在另ー优选例中，所述的待测样本为人的样本。在另ー优选例中，所述的人的样本选自下组:体液样本、唾液样本、血液样本、血清样本、淋巴液样本、脊髓液样本、精液样本、尿液样本、毛发样本、细胞样本、组织样本、或器官样本。在另ー优选例中，所述的外源重组DNA选自下组:表达载体或其片段、表达质粒或其片段、穿梭载体或其片段、穿梭质粒或其片段、重组载体或其片段、重组质粒或其片段、或其它特异重组DNA或其片段。在另ー优选例中，所述重组载体为pBR322、pUC18/19、pFLAG、pGL、pGEM_T、pCMV、pBluescript或pcDNA系列，或其片段。在另ー优选例中，所述的重组载体为pBR322。在另ー优选例中，所述的来自于外源重组DNA的转录本为任选自下组的一个或多个转录本:(I)与连接的启动子同方向的正向转录本；(2)与连接的启动 子反方向的反向转录本；(3)标记基因或抗性基因的正、反向转录本；(4)含有翻译控制元件的正、反向转录本；(5)含有转录终止子的正、反向转录本；(6)来源于所述体外重组DNA的其它转录本。在另ー优选例中，所述的标记基因或抗性基因选自下组:二氢叶酸还原酶基因、新霉素抗性基因、绿色荧光蛋白基因、四环素抗性基因、氨苄青霉素抗性基因、氯霉素抗性基因、链霉素抗性基因、卡那霉素抗性基因、其它特异标记基因等。在另ー优选例中，所述的翻译控制元件为如核糖体结合元件、核糖体内部进入位点元件、上游小开放阅读框元本文档来自技高网...

【技术保护点】
一种分离的转录本，其特征在于，所述转录本分离自人或非人哺乳动物，并且所述的转录本是：(a)：来自于外源重组DNA的转录本与人或非人哺乳动物基因组的转录本的剪接转录本；或(b)：来自于外源重组DNA的未剪接的转录本。

【技术特征摘要】
1.一种分离的转录本，其特征在于，所述转录本分离自人或非人哺乳动物，并且所述的转录本是: (a):来自于外源重组DNA的转录本与人或非人哺乳动物基因组的转录本的剪接转录本；或 (b):来自于外源重组DNA的未剪接的转录本。2.一种分离的DNA片段，其特征在于，所述的DNA片段分离自人或非人哺乳动物，并且所述的DNA片段来自于外源重组DNA，并重组于人或非人哺乳动物基因组中； 优选地，所述的DNA片段编码权利要求1所述的来自于外源重组DNA的未剪接的转录本。3.一种分离的翻译产物，其特征在于，所述的翻译产物是由权利要求1所述的转录本所翻译的。4.权利要求1所述转录本，或权利要求2所述DNA片段，或权利要求3所述翻译产物的用途，其特征在于，用于制备检测试剂或试剂盒，所述检测试剂或试剂盒用于检测人或非人哺乳动物的基因组中是否含有来自于外源重组DNA的DNA片段，或所述的人或非人哺乳动物中是否存在来自于外源重组DNA的转录本或其翻译产物。5.一种非诊断性和非治疗性的检测方法，其特征在于，包括步骤: 检测待测样本中是否含有来自于外源重组DNA的DNA片段、或来自于外源重组DNA的转录本，或所述转录本的翻译产物，其中所述的待测样本为人或非人哺乳动物的样本，并且所述的来自于外源重组DNA的DNA片段、或来自于外源重组DNA的转录本，或所述转录本的翻译产物在样本中是不存在的。6.如权利要求5所述的方法，其特征在于，所述的样本含DNA或RNA，并且所述检测包括步骤: (1)获得待测样本的基因组DNA，或将待测样本的RNA逆转录为DNA； (2)检测步骤(1)所述的DNA中是否含有来自于外源重组DNA的多核苷酸或其互补序列，并...

【专利技术属性】
技术研发人员：李伯良，胡光晶，陈佳，赵晓楠，许佳佳，郭冬青，杨新颖，熊缨，李琴，宋保亮，鲁明，胡西旵，
申请(专利权)人：中国科学院上海生命科学研究院，
类型：发明
国别省市：