一种DNA序列模式的构建方法技术
【技术实现步骤摘要】
一种DNA序列模式的构建方法
本专利技术涉及生物群体中特定DNA序列的表示方法，特别是一种DNA序列模式的构建方法。
技术介绍
基因是指具有遗传效应的DNA片段，不同种类的生物体内存在着不同的基因体系。然而某些基因由于其表达产物承担着重要的生命功能而在生物群体中广泛存在，如细胞色素氧化酶基因和rDNA基因存在于几乎所有的生物细胞当中。此外，这两种基因的部分序列及紧邻的非编码区还具有高度的可变性，不同的生物类群拥有其特定的序列。因此这两种基因相关序列可以作为特定生物类群的标识，目前在生物体的种属鉴定和生物群体结构解析等方面得到了广泛的应用：细胞色素氧化酶基因相关序列正作为生物物种DNA条码的首选片段，rDNA基因相关序列则正作为微生物菌群研究的理想片段。然而同一种生物拥有相同的上述序列只是一种理想情况，事实上即使同一种生物也会存在上述序列的变异（这种变异并不能简单归结于亚种或者变种等），这种情况因不同的生物种属而异，理论上这应该是大多数生物种属的常态。此外，对于群体生物学研究而言，有时候需要在不同生物类群中进行分析和比较，此时需要的是生物类群层面的序列信息而非种属层...
【技术保护点】
一种DNA序列模式的构建方法，其特征在于：对于特定的DNA序列，将研究涉及的生物种属或类群所有该DNA序列按照碱基兼并表示规则合并成一条DNA序列模式，这种合并可以在种、属或其它分类单位水平上进行的，也可以是针对特定的生物类群来进行的。
【技术特征摘要】
1.一种DNA序列模式的构建方法，其特征在于：对于特定的DNA序列，将研究涉及的生物种属或类群所有该DNA序列按照碱基兼并表示规则合并成一条DNA序列模式，这种合并在种、属或其它分类单位水平上进行，或者是针对特定的生物类群来进行；DNA序列模式的构建步骤如下：步骤1：确定研究涉及的生物种属或类群；步骤2：根据研究需要选择特定的DNA片段，收集步骤1所述生物种属或类群的相应DNA序列；步骤3：将步骤2中收集到的DNA序列进行比对，剔除与其它序列明显不一致或错误的DNA序列；步骤4：根据研究需要在生物种属或类群水平上，...
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